鑒于以上結果,作者想進一步探究tiRNA-Gly與RBM17作用的分子結果。結果顯示,tiRNA-Gly可提高總RBM17蛋白的水平,但是不影響RBM17的mRNA水平(圖3H-I)。隨后,用蛋白質合成抑制劑環己胺(CHX)處理細胞,tiRNA-Gly轉染后增加了K1細胞內源性RBM17蛋白的半衰期,而β-actin作為對照(圖3J)。此外,蛋白酶體抑制劑MG132處理后,內源性RBM17在轉染tiRNA-Gly的K1細胞中的積累量**高于轉染siRNA-NC的K1細胞,表明tiRNA-Gly抑制了蛋白酶體依賴性的PTC細胞中RBM17的降解(圖3K)。此外,tiRNA-Gly的過表達***抑制了泛素化RBM17的水平(圖3L)。綜上所述,tiRNA-Gly可以穩定RBM17蛋白通過泛素/蛋白酶體依賴性降解。大黃酸處理對正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應。細胞識別芯片科研
一、LC3陽性囊泡在質膜損傷后在修復部位積聚
用激光照射*細胞MCF7,致使細胞膜上形成小孔。使用膜不可滲透的FM1-43染料測量膜完整性,發現在Ca2+存在下,細胞能夠在20到30s內修復它們的質膜(Fig.1,AandB,left);在缺乏Ca2+的培養基中受損的細胞無法修復并繼續吸收細胞不可滲透的染料(Fig.1B,right)。使用穩定表達融合蛋白增強型綠色熒光蛋白(eGFP)-LC3的MCF7細胞研究激光照射后自噬是否參與該過程,結果顯示,LC3陽性點在損傷后大約8-10min開始在修復部位形成(Fig.1C);在未損傷區域中LC3陽性點未增加(Fig.1D);LC3依賴于ATG7(Fig.1E-H)。 半衰期科研英拜專注高通量測序行業的整體服務。
為了完全理解HoxBlinc過表達調控HSPC造血轉錄程序的機制,進行了ChIRP-seq在WT和HoxBlincTg Lin - c-Kit+細胞中繪制基因組HoxBlinc結合位點。HoxBlinc的過表達***增加了其與HoxB前基因啟動子區域和其他反式靶點的結合,如Stat1、Cdr2、Wnt5a、Runx1和后HoxA基因(圖5d)。Lin-c-Kit+細胞基因組中HoxBlinc結合位點的整體分布表明,HoxBlinc主要與非編碼區相互作用,包括基因間區、內含子和啟動子。值得強調的是,HoxBlinc的過表達***增加了其與啟動子和UTR的占用(圖5e)。整合來自WT和HoxBlincTg HSPC的ChIRP-seq、RNA-seq和ATAC-seq數據集顯示,大約74%的基因HoxBlinc結合增加表現在基因表達水平增加兩倍以上(圖5f),44.7%的基因表現出啟動子染色質可及性增強(圖5g)。這些數據表明,HoxBlinc直接結合造血特異性靶基因,主要是NPM1c+特征基因,并介導染色質的長程相互作用,驅動HSPC的基因調控網絡。
6)SsD抑制患者原代細胞
我們從吉林大學***醫院**組織/生物標本庫獲取AML患者外周血,進一步評估SsD對白血病進展的影響。SsD***抑制了白血病細胞增殖(圖6A)、集落形成能力(圖6B)、誘導細胞周期阻滯(圖6C)。在機制上,這是由FTO介導的m6ARNA甲基化及其在SsD處理的原代細胞中的靶點調控的(圖6D-G)。當我們使用“人-鼠”異種移植白血病模型來評估SsD在體內對白血病進展的影響時(圖6H),與上述類似,使用SsD******抑制AML進展,包括降低WBC,減少BM中的白血病母細胞,減少脾腫大,抑制肺轉移,延長AML原代細胞異種移植小鼠的存活時間(圖6I-N)。因此,這些體內研究結果表明SsD具有***FTO介導的AML的潛力。 FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉移。
5、確認PDCD4在調節Treg擴增中的作用
隨后探究了PDCD4在調節Treg擴增中的作用。如圖A-C所示,成功構建了PDCD4的過表達和干擾表達細胞系。與對照組相比,PDCD4過表達***降低了Treg細胞的擴增率,而干擾其表達則***提高了Treg細胞的擴增率。表明PDCD4是負調節Treg細胞擴增的關鍵基因。
6、**來源外泌體miR-208b影響體內化療效果和**生長
隨后作者探究了**來源外泌體miR-208b體內對化療效果和**生長的影響。用慢病毒轉染CT26細胞產生miR-208b過表達和miR-208b敲低細胞系。動物實驗設計示意圖如圖7A所示,實驗采用6組(每組10只小鼠),其中3組使用奧沙利鉑,BALB/c小鼠植入CT26細胞,建立**植入模型。如圖7B-7D所示,miR-208b-OE組**生長速度較快,而中miR-208-KD組**生長明顯慢于對照組。 上海英拜生物的動物建模實驗。江蘇醫學科研服務科研
代謝變化被認為是腸病**重要的特征之一。細胞識別芯片科研
沉默MIR210HG可以通過miR-337-3p/137-HMGA2軸阻斷TGF-b和Wnt信號通路
之前的GSEA表明MIR210HG與TGFb/Smad3和Wnt/b-catenin信號通路相關。為了進一步研究MIR210HG調控子宮內膜*細胞進展的機制,我們檢測了MIR210HG、HMGA2、miR-337-3p和miR-137對TGF-b、Wnt和EMT通路相關蛋白水平的調控作用。MIR210HG的下調降低了TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達以及b-catenin在細胞核中的分布(圖6A和6B)。基于這些結果,我們推測MIR210HG可能通過靶向miR-3373p/137-HMGA2調控軸抑制EMT、TGF-b和Wnt信號通路。干擾HMGA2***降低TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達,b-catenin在細胞核中的分布(圖6C和6D)。我們之前曾報道過HMGA2在Ishikawa和HEC-1A細胞系中調節Snail、Slug、N-cadherin、MMP-2和MMP-9的表達。我們接下來研究了miR-337-3p/137表達的誘導是否影響TGF-b、Wnt和EMT通路相關蛋白的水平。 細胞識別芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗