4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細胞轉移中發揮作用
據報道，外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結合蛋白來轉運。通過RNApull-down分析和質譜分析，鑒定了三種可能參與miR-934轉運的RNA結合蛋白，并發現敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達（Fig.4a,b）。hnRNPA2B1是一種RNA結合蛋白，通過與特定基序GGAG/CCCU結合，參與miRNAs的運輸和轉錄后調控。特別是，由于miR-934序列中有兩個GGAG基序，我們推測hnRNPA2B1可能通過與GGAG序列結合，介導miR-934包裝成外泌體的過程。此外，miRNApull-down分析顯示，在細胞質和外泌體中，miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結合關系，然而，突變miR-934的結合序列(GGAG)可削弱這種結合（Fig.4c）。RNA免疫沉淀分析進一步證明，無論是在CRC細胞及其外泌體裂解物中，miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集（Fig.4d）。此外，敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細胞轉移到巨噬細胞的過程（Fig.4e）。因此，這些結果證實hnRNPA2B1可以通過與miR-934的GGAG序列結合，介導miR-934包裝到CRC細胞外泌體中，并將外泌體miR-934轉移到巨噬細胞中。 文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(MLN)中的Th17細胞（與結腸炎癥密切相關）。代謝組學科研推薦咨詢
miR-144通過FBXW7/HIF-1α/VEGF-A通路發揮促血管生成功能
我們確定NPC-EV來源的miR-144是否通過介導FBXW7/HIF-1α/VEGF-A通路促進HUVECs的血管樣管形成。免疫印跡分析結果表明，在miR-144抑制劑處理的鼻咽*細胞來源的EVs中，si-FBXW7處理導致FBXW7表達下調，HIF-1α和VEGF-A表達升高。這表明miR-144對HIF-1α/VEGF-A通路的影響是以FBXW7依賴的方式發生的(圖6A)。同樣地，我們還發現與單獨抑制miR-144相比，聯合抑制miR-144和FBXW7后，HUVEC的遷移(圖6B)和侵襲(圖6C)增強，以及血管樣管形成(圖6D)增加，這表明miR-144在體外依賴于FBXW7的促血管生成功能。體內Matrigel栓試驗(圖6E和6F)顯示，與單獨抑制miR-144相比，包含miR144模擬物處理過的鼻咽*細胞EVs的凝膠栓在miR-144和FBXW7抑制聯合作用下，新形成的血管增強了，說明NPC-EVmiR-144在體內依賴于FBXW7的促血管生成功能。
結論：總之，本研究的關鍵發現為EV來源的miR-144在體外鼻咽*的進展中發揮促進作用提供了證據。具體來說，miR-144可以通過鼻咽*細胞來源的EVs轉運到HUVECs，**終強化其惡性表型，為鼻咽*基于EVs的生物標志物和***方式的發展提供了一個新靶點。 福建科研整體服務英拜生物提供生物科學內的專業的技術咨詢，技術合作。
9）M1-Exos通過miR-155/SOCS6/p65軸加重了bEnd.3細胞的EndoMT
為了探討外泌體miR-155/SOCS6/p65軸在M1-Exos誘導的EndoMT中的作用，我們在體外進行了一系列功能喪失和功能獲得實驗。我們發現，SOCS6過表達部分逆轉了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos誘導的TEER值降低和通透性增加(圖9A和B)。ZO-1和Occludin的熒光強度進一步顯示SOCS6過表達***逆轉了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos在bEnd.3細胞中引起的TJs破壞(圖9C)。此外，EndoMT標記物的蛋白水平與這些結果一致，SOCS6上調可消除miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos介導的p65上調(圖9D)。值得注意的是，當miR-NCKD-Exos或miR-155KD-Exos下調SOCS6時，則出現相反的結果(圖9E-H)。
再次從老年和年輕小鼠中分離BMSCs，Dil染色劑標記后體外增殖，脛骨內注射到另一批年輕小鼠中，三天后收獲脛骨對成骨標志物Runx2進行熒光免疫染色。發現老年BMSCs處理的小鼠中Dil標記細胞降低，表明老化過程中OPCs向骨形成表面的遷移能力降低。大部分遷移到骨形成表面的Dil標記細胞表達Runx2，表明OPCs遷移到骨形成表面發生成骨分化，有助于體內骨形成。與年輕BMSCs相比，老年BMSCs的體外遷移能力明顯受損，Macf1***下調，從Macf1基因位點轉錄而來的長鏈非編碼RNA PMIF（即lnc-PMIF）表達***增高。上述提示，衰老過程中小鼠骨形成的減少伴隨著OPCs向骨形成表面遷移的減少和OPCs中lnc-PMIF表達的升高。英拜提供春節回家探親車費補貼。
放線菌素D處理后的 qRT-PCR 和 RT-PCR 分析表明，circACTN4 在指定的時間點具有抗性。隨后，生物信息學預測上游轉錄因子2(USF2)可能與ACTN4的啟動子結合。因此，構建了攜帶全長野生型和突變型ACTN4啟動子的熒光素酶報告基因載體，結果表明USF2增強了熒光素酶野生型熒光素酶報告基因的活性。Chip-qPCR檢測進一步證明USF2可以與ACTN4基因啟動子結合并增強其轉錄活性。設計并構建了USF2過表達和敲低質粒，通過qRT-PCR檢測到轉染相應質粒的BC細胞中ACTN4的表達。結果表明，上調的 USF2 顯著增加了線性ACTN4和circACTN4的表達，而下調的USF2顯著降低了線性ACTN4和circACTN4的水平。這些結果表明ACTN4是轉錄因子USF2的靶基因。
血清或尿液中尿酸濃度的升高與痛風腎臟和血管疾病密切相關。海綿體科研實驗外包
尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。代謝組學科研推薦咨詢
三、ICICLE-seq聯合測量可及性和表位
A.在標準的scATAC-seq協議下，細胞膜的去除切斷了細胞表面和細胞染色質狀態之間的連接。為了測試我們在通透性細胞上同時測量細胞表面蛋白和染色質狀態的能力，我們修改了我們優化的通透性細胞scATAC-seq方法，將其納入使用商用條形碼抗體試劑的測量，我們將這種新方法稱為ICICLE-seq.ICICLE-seq協議利用定制的Tn5轉座復合體，其捕獲序列與基因組公司的10xscRNA-seq凝膠珠捕獲反應兼容，可同時捕獲ATAC片段和多聚腺苷化抗體條形碼序列.
B.UMAP投影和ATAC標記轉移在ICICLE-seq數據上的分辨率與scATAC-seq在死亡細胞和***碎片后的完整通透細胞上的分辨率相似.
C.然而，基于poly-based的捕獲方法和置換片段的單端讀出限制了數據質量。盡管如此，ICICLE-seq結果表明，通透細胞能夠同時捕獲細胞核染色質可達性和高質量的細胞表面表位定量。我們能夠利用額外的ADT數據聚集并根據細胞表面抗原識別細胞類型.
D.E.基于ADT數據的UMAP和JaccardLouvain聚類可以根據細胞類型特異性標記與聚類的明確關聯識別細胞類型特異性聚類。 代謝組學科研推薦咨詢
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗