調控機制科研分子生物學實驗

來源: 發布時間:2021-10-31

USF2促進circACTN4在BC中的表達為

了研究 circRNA 在 BC發展中的功能,利用芯片分析檢測了4對BC組織和*旁組織中circRNA表達特征。共發現85個***差異表達的circRNAs, 63 個上調和22個下調circRNAs。熱圖顯示了14個上調的circRNA,其中circACTN4是失調**嚴重的一個,差異高達10倍。根據circBase數據庫發現circACTN4來自位于人類19號染色體上的ACTN4基因,產生于ACTN4外顯子2至外顯子7(共571bp),通過 Sanger 測序驗證了反向剪接連接點。為了驗證circACTN4的環形結構,使用聚斂引物和發散引物擴增環狀 circACTN4 和線性 ACTN4。通過FISH和核質分離PCR觀察到circACTN4主要位于BC細胞的細胞核中, circACTN4在*組織中的表達高于*旁組織。 大黃酸能緩解D。SS誘導的小鼠慢性結腸炎。調控機制科研分子生物學實驗

7、CFL1/PLD1軸介導低氧誘導的HCC細胞中AKT途徑的***之前的一項研究表明,PLD1***AKT及其下游mTOR通路促進HCC細胞增殖、侵襲。與此一致,作者觀察到CFL1敲除降低了p-AKT水平,在HCCLM3細胞中通過PLD1恢復增強了p-AKT水平(圖7A,C)。此外,PLD1沉默逆轉了CFL1誘導的Hep3B細胞中AKT信號轉導通路的活化(圖7B,D)。值得注意的是,CFL1或PLD1敲除抑制了肝*細胞中缺氧誘導的AKT通路***和EMT過程(圖7E,F)。之后,進行拯救實驗探討HIF-1α-CFL1-PLD1軸中PLD1的功能。在HCCLM3細胞中過表達的PLD1可以逆轉低氧條件下CFL1-shRNA引起的對AKT磷酸化或EMT過程的抑制(圖7G,H)。總的來說,證實CFL1/PLD1軸在缺氧誘導的HCC進展中起重要作用。

總之,該研究表明HCC中過表達CFL1與較差的臨床病理學參數呈正相關。體外和體內實驗證實CFL1是HCC**生長和轉移的驅動因素。PDL1/AKT通路介導CFL1的致*功能。此外,CFL1是一個缺氧反應基因,通過***PLD1/AKT信號轉導參與缺氧誘導的HCC進展(圖8)。綜上所述,該研究表明CFL1是低氧微環境與HCC進展之間的一種新的連接體。 分子毒理通路發現者科研中標率高英拜的員工福利待遇很好。

由于HoxBlinc通過招募SETD1A和MLL1復合物,并在HoxB前位點組織活躍的染色質結構域,促進HoxB前基因的表達,NPM1c+或HoxBlincTg引起的HoxBlinc上調可以通過增強子/啟動子染色質可及性來***其在HSPC中的靶基因。為了驗證這一點,使用WT、NPM1c/+和HoxBlincTg小鼠的LSK細胞進行了轉座酶可及染色質分析高通量測序 (ATAC-seq)。巧合的是,NPM1c/+和HoxBlincTg LSK細胞有相當一部分基因表現出啟動子可及性的增加(28.9%)或減少(24.3%)(圖4e)。此外,NPM1c+或HoxBlincTg使啟動子可及性增加的基因中有相當一部分也上調,這些基因包括NPM1c特征基因HoxB2-5、HoxA9-10、Meis1和Runx1,以及其他靶基因如Stat1和Cdr2(圖4f-g)。這些結果表明HoxBlinc lncRNA的過表達通過增強HSPC中增強子/啟動子染色質的可及性特異性***NPM1c+標記基因。

轉錄組學 (RNA-Seq) 模塊

RNA-seq 模塊對與衰老相關的全基因組轉錄組變化進行編目。RNA-seq 模塊中收集的數據集來自與衰老研究相關的已發表文章。該模塊收集在特定基因干預(過表達、敲除等)時觀察到的轉錄組變化,該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過程中基因表達譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個可能與衰老有關的差異表達基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中,可以通過基因名稱輕松搜索 DEG,并且每個 DEG 條目都包含潛在的實驗條件和基因表達的倍數變化及其發布的來源。可以下載每篇文章中的所有搜索結果和相應的DEG數據庫。 文章使用FMT(糞微生態移植)來確定大黃酸改變的腸道菌群是否對結腸炎有療效。

單細胞轉錄組學 (scRNA-Seq) 模塊

scRNA-seq 模塊系統地組織了基因表達隨年齡增長的組織和細胞類型特異性異質變化。該模塊提供不同細胞類型或亞型的高分辨率、綜合參考圖,以及它們的時空分布信息,以及在不同衰老相關或疾病條件下每種細胞類型或亞型的基因表達模式。該模塊目前包括來自大鼠、猴子和人類的 14 種衰老組織的單細胞 RNA 測序數據集。這些數據包括從單細胞轉錄組學圖譜中的多個哺乳動物組織中提取的細胞類型注釋和細胞類型特異性 DEG,用于衰老和熱量限制 (CR)。該模塊還包含單細胞轉錄組數據,涵蓋非人類靈長類動物的卵巢、胰島、主動脈、視網膜和心肺衰老,以及老年 COVID-19 患者中人類循環免疫細胞的單細胞轉錄組學景觀。 上海英拜生物提供可靠可信可參觀的實驗平臺。輸卵管阻塞科研

這些數據表明大黃酸***可以改善DSS誘導的結腸炎。調控機制科研分子生物學實驗

8)在AKI期間上調UCP1減少脂質積累,可通過AMPK/ULK1途徑促進體內自噬

我們發現UCP1在體外通過***自噬來影響AKI中的細胞功能,我們探討了這種情況在體內是否也會發生。結果表明,在動物模型中上調UCP1也能******AMPK/ULK1/自噬通路(圖8A),免疫熒光和免疫組化分析進一步證實了這一點(圖8B-C)。***,CL316243上調UCP1后,AMPK/ULK1/自噬通路也被******(圖8D-F)。綜上所述,我們的研究構建了AKI中脂質積累***的模型,且這種積累的脂質與UCP1呈負相關。通過上調UCP1來***AKI中積累的脂質,可以***AMPK/ULK1/自噬通路來抑制疾病進展(圖9)。

結論:UCP1直接調控AKI中的脂質積累,***細胞自噬,從而***抑制疾病進展。這為AKI的***提供了新的思路和靶點。 調控機制科研分子生物學實驗

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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