5.ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯體,通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾
為了探索ELNAT1誘導BCa淋巴轉移的分子機制,我們使用NGS檢測過表達ELNAT1的BCa細胞和對照細胞(Figure5A),由于SUMOylation已經被證明可以調節特異性RNA的識別,并參與RNA分選進入EVs的過程,因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關靶基因。在受ELNAT1調控的925個基因中,作者發現UBC9是SUMOylation相關基因變化*****的(Figure5B-D)。接著通過RNA純化(ChIRP)檢驗ELNAT1與UBC9中P1(153~143bp)啟動子區域存在生理相互作用(Figure5E,F)。CD光譜證實ELNAT1/UBC9TTS1組在270~280nm處有一個***的正峰,在210nm處有一個負峰。 英拜專注高通量測序行業的整體服務。天津神經炎癥科研
作者構建了 (WT) SLC7A113’-UTR和突變型(Mut) 3’-UTR兩種質粒(圖6H)。結果表明,只有過表達YTHDC2WT降低SLC7A11 mRNA在H1299細胞中的穩定性,敲除YTHDC2可以提高SLC7A11 mRNA在H1975細胞中的穩定性。然而,與WT 3’-UTR相比,Mut報告基因的這些作用減弱(圖6I和J)。在檢測外源性F-Luc-SLC7A11融合mRNA的RNA穩定性后,得到了類似的結果(圖6K-M)。總的來說,3’-UTR上的m6A位點對于YTHDC2使SLC7A11 mRNA不穩定至關重要。
7.抑制YTHDC2對XC-系統靶向***敏感,并與LUAD進展相關
為了評估YTHDC2抑制在LUAD中的重要性,從cohort#1隨機抽取20例YTHDC2lowLUAD,其中50%屬于腺泡型(圖7A)。在cohort#2中,與相鄰組織相比,**中YTHDC2表達下調,62%(62/100)的腺泡組織被歸類為YTHDC2low(圖7B、C)。與無這種表達模式的腺泡性LUAD患者相比,YTHDC2low的患者總生存期要短得多(圖7D),進一步表明YTHDC2抑制可能對腺泡性LUAD的**進展尤為重要。另外,相對于*旁組織,**中腺泡LUAD組織中SLC7A11mRNA和蛋白水平表達量都比較高(圖7E、F)。 上海出生缺陷拷貝數科研英拜生物擁有一支高精尖的技術豐富的技術團隊。
關聯研究已將血液來源的microRNA(miRNA)的改變與結直腸*(CRC)聯系起來。miRNA譜可能在CRC進展過程中多樣化,并在血液中反映CRC進展水平。但是,尚無研究評估不同CRC階段血液中miRNA的變化。本研究對來自不同階段的健康供體、結直腸腺瘤、結直腸憩室炎和CRC患者(UICCstagesI/II,III,andIV)的80份血液樣本中的2,549種miRNA的譜進行了基于微陣列的比較。
接下來通過RT-PCR進行確認,并對另外 36 份血液樣本中miRNA進行驗證。與健康對照相比,有 179 個 CRC 相關 miRNA 的豐度差異。只有三個(miR-1225-5p、miR-1207-5p 和 miR-4459)在所有 CRC 階段表現出增加的水平。
對3個miRNA進行通路分析,發現了miRNAs 以各種方式對幾種**相關通路起作用。
這項研究為改進 CRC 篩查的生物標志物發現提供了線索,是***項提供 CRC 血液表達譜的研究,******評估了不同 CRC不同階段血液中 miRNA 的變化。 這也為其他疾病biomarker的研究提供了新的思路。
褪黑素可減輕TBI引起的鐵死亡
為了確定褪黑素是否可以挽救TBI引起的鐵死亡,在相應的高峰表達(例如1天和3天)進行了與鐵死亡相關蛋白的蛋白質印跡分析。發現褪黑素給藥在TBI后1天抑制了TBI誘導的xCT,Cox2,Tfr1,Fpn和Nox2蛋白表達的上調。同樣,褪黑素***在TBI后3天阻止了Fth,Ftl和4HNE蛋白的表達。用促鐵蛋白抑制劑liproxstatin-1(Lip-1)也獲得了相似的結果。此外,免疫組化染色顯示,與對照組相比在TBI后第7天,褪黑素和Lip-1的處理減少了神經元中4HNE陽性細胞的數量,表明褪黑素對TBI誘導的脂質具有神經保護作用過氧化。褪黑素和Lip-1均抑制TBI誘導的皮質GSH水平降低。褪黑素和Lip-1抑制TBI誘導3天后損傷皮層中MDA含量的上調。這些數據表明,TBI導致了與鐵死亡相關蛋白表達的時間變化,以及同側皮層中某些受推定的鐵死亡生物標志物的變化,但是用褪黑素有效地挽救了TBI誘導的鐵死亡。 神經元中FTH的敲除抵消了褪黑素對創傷性腦損傷鐵死亡的保護作用。
哺乳動物細胞DNA損傷反應(DDR)信號的**是共濟失調***擴張癥突變(ATM)和ATM-和rad3相關(ATR)蛋白激酶。ATM和ATR磷酸化并***另外兩個激酶CHK1和CHK2, CHK1和CHK2與ATM和ATR一起,是細胞周期檢查點[24]的主調節器。通過調節CDKs的活性,這些分子在細胞周期G1 S期、S內期和G2 M期減緩或阻止細胞周期進程,使DNA損傷得以修復。ATM和ATR通過控制不同因子在DNA損傷位點的表達、活性或招募來促進DNA修復。一般來說,DDR機制能夠修復細胞在其生命周期中積累的DNA損傷,但如果認為損傷程度過高,就會誘導細胞凋亡或細胞衰老導致細胞死亡。這些數據表明大黃酸***可以改善DSS誘導的結腸炎。上海出生缺陷拷貝數科研
METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。天津神經炎癥科研
NRF2是阻斷鐵死亡的關鍵介質,TYRO3過表達的293T細胞中NRF2轉錄活性增加。TAM激酶下游的PI3K/AKT信號通路可增加NRF2轉錄活性,TYRO3-OE介導的NRF2轉錄***被AKT抑制劑MK2206消除。這些結果表明TYRO3通過AKT/NRF2軸抑制鐵死亡。吞噬細胞對瀕死細胞的***依賴于對凋亡細胞暴露的“吃我信號”的識別。磷脂酰絲氨酸(PS)是一種關鍵的“吃我”分子,可與橋接分子結合,如TAM激酶配體蛋白S(Pros1)和Gas6。Pros1在與PS結合時同時***TYRO3。Pros1處理4T1和PY8119**細胞可抑制erastin誘導的脂質過氧化作用,表明凋亡細胞的Pros1“吃我”信號可以通過TYRO3抑制**細胞鐵死亡。天津神經炎癥科研
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗