特色lncRNA基因
LncExpDB 表征了在特定細胞系/組織中特異性表達、在**或病毒***背景下差異表達、在特定細胞器中富集、在細胞分化或胚胎/***發育過程中動態表達或隨晝夜節律周期性表達的特征 lncRNA 基因韻律。基于大量RNA-seq數據,共鑒定出25191個特征lncRNA,其中***發育7922個,正常組織/細胞系7498個,亞細胞定位5292個,植入前胚胎4343個,*細胞系2907個,1740個晝夜節律,外泌體中為 1538,細胞分化中為 1232,病毒***中為 985。
LncRNA-mRNA相互作用
為了促進對特征 lncRNA 分子機制的深入研究,LncExpDB 通過共表達網絡預測 lncRNA-mRNA 相互作用。LncExpDB 總共包含 28 443 865 個預測的 lncRNA-mRNA 相互作用;這些相互作用中的大多數 (96.4%) 存在于一種生物環境中,并且在五種環境中發現了 12 種相互作用。 英拜提供春節回家探親車費補貼。北京染色質科研
四、RIT1抑制MCC-MAD2結合,促進APC/C底物降解
在MAD1與未連接的動點結合后,MAD2從開放的構象狀態(O-MAD2)轉化為封閉的構象狀態(C-MAD2), SAC信號被緊密調控和放大。MAD2的構象變化啟動了它與CDC20的結合。為了直接測試RIT1是否抑制了MAD2與CDC20或MAD1的關聯,進行了競爭性pull-down實驗來測試RIT1-MAD2和MAD2-CDC20/ MAD1結合之間的互斥性(圖4A和4B)。MAD2結合肽1 (MBP1)是一種模擬CDC20和MAD1相互作用基序(MIM)的高親和合成肽,它取消了MAD2- rit1的結合。評估了RIT1與O-或c -狀態穩定的MAD2突變體的結合(圖4C)。用過量的RIT1 c端尾肽孵育MAD2蛋白,并用凝膠過濾分離(圖4D)。
甲基科研文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(MLN)中的Th17細胞(與結腸炎癥密切相關)。
人類人臍帶來源的間充質干細胞(hUC-MSCs)移植被證實是***系統性紅斑狼瘡(SLE)的有效方法,但是詳細的潛在機制仍不明確。轉運miRNAs可能是MSCs交流其它細胞的方法。Sirt1是一種NAD依賴的去乙酰化酶,通過去乙酰化p53來防止細胞衰老。本研究旨在探討在MRL/lpr狼瘡小鼠模型中,hUC-MSCs是否通過miRNA調節Sirt1/p53來影響脾CD4+ T細胞的衰老。本文于2021年1月發表在《Theranostics》IF:8.597期刊上。
1、hUC-MSCs減輕緩解MRL/lpr小鼠的疾病進展
為了評估對MRL/lpr小鼠狼瘡綜合征的***作用,從17周齡開始用5×105hUC-MSCs或PBS***MRL/lpr小鼠,并在21周齡時處死所有小鼠(圖1A)。與PBS處理的小鼠相比,hUC-MSC處理的小鼠的腎臟病變明顯減少(圖1B)。此外,與PBS處理的MRL/lpr小鼠相比,hUC-MSCs處理后小鼠的脾臟重量和蛋白尿明顯降低(圖1C-D)。hUC-MSCs***組的血清anti-dsDNA抗體水平較低,但未達到統計學水平(圖1E)。數據表明hUC-MSCs改善MRL/lpr小鼠的狼瘡疾病。
在MAD1與未連接的動點結合后,MAD2從開放的構象狀態(O-MAD2)轉化為封閉的構象狀態(C-MAD2),SAC信號被緊密調控和放大。MAD2的構象變化啟動了它與CDC20的結合。為了直接測試RIT1是否抑制了MAD2與CDC20或MAD1的關聯,進行了競爭性pull-down實驗來測試RIT1-MAD2和MAD2-CDC20/MAD1結合之間的互斥性(圖4A和4B)。MAD2結合肽1(MBP1)是一種模擬CDC20和MAD1相互作用基序(MIM)的高親和合成肽,它取消了MAD2-rit1的結合。評估了RIT1與O-或c-狀態穩定的MAD2突變體的結合(圖4C)。用過量的RIT1c端尾肽孵育MAD2蛋白,并用凝膠過濾分離(圖4D)。RIT1M90I***降低了MAD2-CDC20和BubR1-CDC20的相互作用(圖4E和4F);表明致病RIT1蛋白水平阻礙MCC的完整性,符合RIT1從CDC20中隔離MAD2并促進MCC拆卸的模型。用重組RIT1補充這些提取物增加了CyclinB1和Securin的泛素化和降解,表明APC/C活性增加,可能是由于MCC抑制緩解(圖4G)。RIT1缺失細胞顯示CyclinB1降解延遲(圖4H)。此外,RIT1M90I的表達加速了正常細胞生長下CyclinB1的降解(圖4I);然而,其對CyclinB1降解的影響在藥理學誘導的有絲分裂阻滯下被消除(圖S4M),這表明致病性水平的RIT1不能抑制過度活躍的SAC反應。英拜可解放您的雙手釋放您的時間。
接著作者為了進一步證明YTHDC2與LUAD的關系,與相鄰的*旁組織相比,在LUAD**中觀察到YTHDC2 mRNA和蛋白的***下調(圖1E-G),組織芯片檢測(TMA)評估cohort #1中YTHDC2的表達,結果顯示51% (98/192) LUAD患者的YTHDC2表達下調(圖1H、I)。值得注意的是,YTHDC2表達下調與更大的**直徑和更晚期的分期相關(圖1J、K)。表明抑制YTHDC2可促進LUAD的**進展。
2.過表達YTHDC2抑制細胞活力和**發生
為了探索YTHDC2在體內的m6A解讀器功能,作者構建AAV5表達系統(KPYWT、KPYΔYTH和對照KPE)(圖2A)。與KPE小鼠***25周后的**相比,KPYWT和KPYΔYTH小鼠的**證實了YTHDC2持續上調(圖2B),這表明AAV5表達系統具有持久的效率。雖然YTHDC2不能阻止**的發生,但**發生時間延遲,**負荷明顯受到抑制,KPYWT小鼠的生存時間比KPE小鼠和KPYΔYTH小鼠更長(圖2C-F)。 思路是您的操作我們來做。骨折鼠模型科研服務兩年
大黃酸可以改變腸道菌群組成。北京染色質科研
色素瘤甲基化PCR芯片用于研究在黑色素瘤中低甲基化和高甲基化的22個基因的啟動子甲基化狀態。黑色素瘤占皮膚*不到5%,但80%的人死亡,說明疾病的**性和惡性。表觀遺傳研究低甲基化和高甲基化**抑制基因鑒定了黑色素瘤新的***靶標。這個芯片上的基因包括全基因組分析發現在黑色素瘤中經常發生高甲基化的基因,以及參與黑色素瘤發生和進程的基因。利用這些芯片分析細胞或新鮮組織基因組DNA樣本有助于關聯CpG島甲基化狀態與生物表型。結果還可以洞察**發生和進程,及其病理背后的分子機制和生物學通路。利用這個芯片,通過簡單的限制性內切酶消化和實時定量PCR,就可以研究分析22個參與黑色素瘤起始和進程的不同基因的啟動子甲基化狀態。北京染色質科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗