MAD2和p31conmet的結構相似性突出了RIT1的潛在結合競爭。因此,我們使用了競爭結合試驗,其中滴定MAD2野生型(WT)或R133E/Q134A(RQ),一個二聚體和p31結合缺陷的突變體,未能抑制rit1-p31conmet結合(圖1E)。由于RIT1g結構域與其他Ras-GTPases,特別是它的鄰域RIT2之間的相似性,假設RIT1s的n端或c端延伸可能介導與MAD2和p31conmet的相互作用(圖1F)。隨后分析了RIT1N-或c-末端缺失突變體,證明了c-末端結構域對于MAD2和p31conmet星結合是必要和充分的(圖1G、1H和S1J)。m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。遼寧細胞凋亡基因芯片科研
支持了轉錄組學分析,流式細胞術表明帶有**記憶(Tcm)表型(CD44+CD62L+)的CD8+TILs的比例***更高,這在不同的**模型中是一致的(Fig.1H)。為了檢驗抑制CDK4/6對抗**T細胞免疫的長期功能效應,用CDK4/6i在短時間(抗**T細胞反應**活躍的3-13天)處理MC38-OVA荷瘤小鼠,然后停藥。在停止***時,CDK4/6i處理小鼠和對照小鼠的**體積是相等的(Fig.1I-J)。引人注目的是,在停止***后,既往使用CDK4/6i***的小鼠中有21只小鼠**完全***,而對照組只有9只(Fig.1K)。總之,這些數據表明CDK4/6的藥理抑制促進T細胞記憶,并產生能夠驅動有效和持續的抗**反應的瘤內T細胞室。心血管疾病芯片科研國家自然科學基金英拜提供生命科學內的一體化服務。
4、miR-208b直接靶向和抑制CD4+T細胞中PDCD4的表達
為了進一步探究miR-208b的分子機制,探究了其下游靶基因機制,使用生信預測了其靶基因,**終挑選到PDCD4(圖5A)。熒光素酶進一步證實了miR-208b和PDCD4之間的結合(圖5C-D)。研究發現,T細胞中PDCD4的表達在SW480外泌體處理組***下降,而這個抑制作用在SW480-OXA組更加明顯,PCD表達在miR-208b缺失組則***升高(圖5E)。此外,加入miR-208bmimics后,PDCD4蛋白***降低,而抑制miR-208b后,PDCD4蛋白的表達相對增強,此外,PDCD4在mRNA水平的表達沒有明顯變化(圖5F)。然后,評估了miR-208b對CD4+T細胞擴增的影響。研究表明,轉染miR-208bmimics***增強了Treg的擴增,而抑制miR-208b水平則抑制了Treg的擴增(圖5G-H)。這些結果表明miR-208b直接靶向抑制PDCD4的表達,導致Treg分化。
5、確認PDCD4在調節Treg擴增中的作用
隨后探究了PDCD4在調節Treg擴增中的作用。如圖A-C所示,成功構建了PDCD4的過表達和干擾表達細胞系。與對照組相比,PDCD4過表達***降低了Treg細胞的擴增率,而干擾其表達則***提高了Treg細胞的擴增率。表明PDCD4是負調節Treg細胞擴增的關鍵基因。
一、在pik3a突變的ER+乳腺*中,INPP4B的表達增加
INPP4B被確定為人類乳腺*er陽性標記物.INPP4B在三陰性乳腺*中表達缺失,然而,它作為其他**中潛在的致*基因的出現,促使我們檢測其在ER+乳腺*中的相對表達和功能。INPP4B蛋白表達缺失與三陰性乳腺*相關(圖1a, b) 增加INPP4B蛋白表達在14 40%的乳腺*相對于正常組織與ER / PR-positivity和腔內(ER +和/或PR+)乳腺*亞型(圖1 a, b和補充圖1 b, c)。在mRNA表達數據不能用于這些cohorts使用組織掃描乳腺*cDNA陣列I IV (OriGene)檢測130例原發人類乳腺*和16例正常乳腺組織的INPP4B mRNA表達(圖1c)。INPP4B表達降低與三陰性乳腺*相關,而***增加的INPP4B表達在25%的乳腺*中與ER/ propositivity和luminal亞型相關(圖1c, d和補充圖1d, e)。使用METABRIC和TCGA數據集,我們發現只有1%的乳腺*表現出INPP4B基因改變,如突變、截斷、擴增或缺失。INPP4B mRNA表達與PTEN或AKT1突變無關,但與pik3a突變狀態正相關(圖1e和補充圖1f)。在PIK3CA多突變的乳腺*中,INPP4B的表達也***升高(補充圖1g)。進一步分層研究發現,INPP4B高表達與pik3c突變ER+乳腺*亞型特異性相關(圖1f)。 英拜跟客戶形成產學研合作模式。
8)SOCS6通過泛素化和降解p65抑制NF-κB信號通路
鑒于miR-155通過增強細胞質和細胞核中p65的表達負調控SOCS6的表達,并***NF-κB信號通路,我們下一步研究SOCS6與p65之間潛在的相互作用。首先,我們在bEnd.3細胞中過表達或下調SOCS6。發現p65表達與SOCS6水平呈負相關(圖8A)。DiscoveryStudio?分析的3D對接也表明SOCS6可能與p65相互作用(圖8B)。此外,熒光共定位實驗表明,SOCS6與p65在細胞質***定位(圖8C和D),Co-IP實驗進一步揭示了SOCS6與p65的相互作用(圖8E)。值得注意的是蛋白酶體MG132可以部分逆轉SOCS6過表達對p65蛋白水平的抑制作用(圖8F)。同時,在環己酰亞胺的情況下,SOCS6的沉默***延緩了內源性p65的降解速率,而過表達SOCS6則***加速了p65的降解(圖8G)。***,通過泛素化實驗驗證SOCS6是否通過蛋白酶體降解誘導p65失穩。我們發現過表達SOCS6增加了bEnd.3細胞中p65多聚泛素化。沉默SOCS6則相反(圖8H)。綜上所述,這些結果表明SOCS6可以與p65結合并誘導其多聚泛素化和蛋白酶體降解。 英拜生物是國內承接各類高通量測序科研項目以及一站式的測序文章發表服務的公司之一。心血管疾病芯片科研國家自然科學基金
上海英拜生物的動物建模實驗。遼寧細胞凋亡基因芯片科研
由于circMAPK1在GC細胞系中穩定表達,我們推測circMAPK1可能是一種適合GC診斷或預后的標志物。qRT-PCR顯示circMAPK1在*組織中的表達低于匹配的非*組織(圖1m)。Kaplan-Meier生存分析顯示胃*組織中circMAPK1水平較高的患者總生存期***延長(圖1n)。綜上所述,circMAPK1是一種穩定表達的circRNA,可作為有效的診斷和預后標志物,值得進一步研究。
2)CircMAPK1在體外抑制GC細胞的增殖和遷移
為了研究circMAPK1在GC中的生物學功能,我們進行了一系列細胞實驗。隨CCK8實驗(圖2a)、集落形成實驗(圖2b)和EdU實驗(圖2c)結果表明,沉默circMAPK1可***增強GC細胞的增殖能力。我們發現circMAPK1的減少增加了S期GC細胞的數量(圖2d)。Transwell(圖2e)試驗顯示circMAPK1的干擾促進了GC細胞的遷移。此外,過表達circMAPK1***削弱了GC細胞的增殖能力。同樣,過表達circMAPK1時,S期GC細胞的數量***減少,細胞遷移受到抑制。綜上所述,circMAPK1在GC細胞的增殖和遷移中起著重要作用。 遼寧細胞凋亡基因芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗