我們接下來試圖識別circPDE4B上游調節器。我們首先對circPDE4B側翼序列進行RNA pull-down-MS檢測,發現兩個與RNA剪接相關的RBP,包括DExH-box helicase 9和FUS(圖1G)。RT-qPCR結果顯示,FUS敲除后,HCs中circPDE4B表達下調,而pPDE4B和mPDE4B沒有明顯變化(圖1H)。此外,***兩種FUS shRNA慢病毒只降低了circPDE4B的表達(圖1I),而過表達FUS則上調了circPDE4B的表達(圖1I)。接下來,RIP分析顯示FUS與外顯子相鄰的位點結合,而其他遠端位點則可以忽略(圖1J,K)。我們還尋找了可能的FUS響應元素,發現了兩個可能的motifs,A位于上游,B位于下游。我們進一步設計了兩個短的circPDE4B微基因,包括circPDE4B-s和circPDE4B-s-del(圖1L)。RIP顯示FUS與circPDE4B-s之間存在明顯的相互作用,但與circPDE4B-s-del之間沒有相互作用(圖1M),表明FUS需要周圍內含子中的假定位點來結合。我們接下來在表達circPDE4B-s/del的HCs中敲除FUS,發現與circPDE4B-del相比,circPDE4B-s***減少了FUS敲除的circPDE4B轉錄本(圖1N)。值得注意的是,在HCs中FUS被TNF-α下調(圖1O)。綜上所述,在OA中circPDE4B的下調至少部分是由FUS的抑制引起的。英拜潤色的標書的中標率**提高。發育可塑性科研實驗可參觀
二、INPP4B增強pik3a突變ER+乳腺*和乳腺上皮細胞增殖
GFP-INPP4B在MCF-7和T47D ER+乳腺*細胞中表達,這兩種細胞分別有PIK3CAE545K和PIK3CAH1047R高活化突變.*細胞進行非錨定細胞生長的能力是細胞轉化的一個標志。GFP-INPP4B***增加了軟瓊脂中MCF-7細胞集落大小(2.1倍)和T47D細胞集落大小(1.8倍),但對集落數量沒有影響(圖2a-c)。與細胞增殖增加相一致。與載體對照相比,GFP-INPP4B在血清剝奪后增強了MCF-7細胞的增殖(1.7倍)(圖2d, e),但不影響在含血清培養基中生長的MCF-7細胞的增殖。過表達GFPINPP4B的MCF-7細胞中,egf刺激的AKTS473和AKTT308磷酸化水平略有降低(圖2f-h)。 細胞移植科研實驗外包外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化促進CRC肝轉移。
PTEN是一種**抑制因子,調節多種細胞功能,包括***,PI3K/AKT信號通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此,推測PI3K/AKT信號通路可能參與CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化。WB結果顯示過表達PTEN可以部分減弱miR-934和HCT-8細胞源外泌體對p-AKT和p-PI3K表達的增強作用,而沉默PTEN則相反(Fig. 5k)。更重要的是,當與HCT-8細胞來源的外泌體和PI3K抑制劑(LY294002)共培養時,PMA處理的THP-1細胞中p-AKT和M2標記物(CD206、arginase-1和CD163)的表達下調(Fig. 5l, m)。綜上所述,CRC細胞來源的外泌體miR-934可以通過下調PTEN表達和***PI3K/AKT信號通路誘導M2巨噬細胞極化。
磷酸甘油酸激酶1 (PGK1)是糖酵解途徑的重要組成部分,與多種**的發***展有關。然而,PGK1抑制劑在*細胞中的抑制機制和生理意義尚不清楚。因此,***給大家介紹于2021年4月發表于“Molecular Therapy”(IF=8.986)的文章“FOXO3A-induced LINC00926 suppresses breast tumor growth and metastasis through inhibition of PGK1-mediated Warburg effect”。在這里,我們鑒定了一個負調控PGK1表達的lncRNA LINC00926,并預測乳腺*良好的臨床預后。我們的研究建立了FOXO3A/LINC00926/PGK1作為調節乳腺*生長和進展的關鍵軸。靶向PGK1或補充LINC00926或FOXO3A可能是乳腺*的潛在***策略。結腸炎也會導致促炎細胞因子或趨化因子的增加。
通過半定量分析,胃*組織中MAPK1-109aa水平較正常胃組織中降低。Kaplan-Meier生存分析顯示,MAPK1-109aa表達水平較高的胃*患者總生存期明顯長于MAPK1-109aa表達水平較低的胃*患者(圖4h)。一系列GC細胞系中MAPK1-109aa的含量也明顯低于正常胃粘膜細胞系GES-1。在內源性circMAPK1水平較低且幾乎沒有MAPK1-109aa表達的MKN45細胞中,轉染circMAPK1和MAPK1-109aa質粒均產生預測的MAPK1-109aa帶,而過表達circMAPK1IRES突變質粒則沒有產生預測的MAPK1-109aa帶(圖4i)。相反,在內源性circMAPK1和MAPK1-109aa更高表達的GES-1細胞中,發現兩種特異性靶向circMAPK1連接的shRNA***降低了MAPK1-109aa的表達(圖4j)。使用anti-flag抗體進行免疫熒光檢測,證實MAPK1-109aa-Flag位于過表達MAPK1-109aa-Flag質粒的MKN45細胞的胞質中,如圖4k所示。我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。胞質科研國家自然科學基金
發現乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。發育可塑性科研實驗可參觀
***是一種系統性疾病,與炎癥細胞浸潤和免疫相關途徑的***有關。本文旨在揭示與免疫相關的變化,并探索頸***斑塊形成過程中的新型免疫學特征。首先,我們應用了集成的生物信息學方法,包括CIBERSORT和基因集富集分析(GSEA)?;虮磉_矩陣GSE28829,GSE41571和GSE43292是從基因表達綜合(GEO)數據集獲得的。經過一系列數據預處理步驟后,使用CIBERSORT,GSEA和ClusterProfiler軟件包對所得的組合表達矩陣進行了分析。在對早期和晚期頸***斑塊進行比較和分析后,我們發現,在晚期斑塊中活化記憶CD4T細胞的百分比較高,而靜息記憶CD4細胞的百分比較低。此外,記憶CD4T細胞的***可以促進頸***斑塊的發展。另外,FOXP3tTreg細胞成熟也可以參與頸動脈斑塊的進展。發育可塑性科研實驗可參觀
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗