北京神經科研

來源: 發布時間:2021-11-01

轉錄組學 (RNA-Seq) 模塊

RNA-seq 模塊對與衰老相關的全基因組轉錄組變化進行編目。RNA-seq 模塊中收集的數據集來自與衰老研究相關的已發表文章。該模塊收集在特定基因干預(過表達、敲除等)時觀察到的轉錄組變化,該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過程中基因表達譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個可能與衰老有關的差異表達基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中,可以通過基因名稱輕松搜索 DEG,并且每個 DEG 條目都包含潛在的實驗條件和基因表達的倍數變化及其發布的來源。可以下載每篇文章中的所有搜索結果和相應的DEG數據庫。 大黃酸導致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。北京神經科研

數據庫還可以分析現有的化學品和基因相關數據,根據自身需要檢索相關基因或者化學品。

該數據庫還將解剖學及其相關表型與環境化學物質聯系起來,使它們可計算用于薈萃分析,并使 CTD 中化學和表型景觀的解剖學視角成為可能。2020 年, CTD 利用醫學主題詞中“解剖學”分支的修改子集作為其受控詞匯源,其中包括 1799 個用于解剖結構和區域、生理系統、流體和組織、細胞和亞細胞成分的術語。 目前,CTD中超過247000種化學-表型相互作用使用了870個解剖學術語。 用戶可以通過選擇門戶圖標向下鉆取可導航層次結構或使用 CTD 關鍵字搜索框中的“解剖”選擇列表選項,從主頁訪問 CTD Anatomy。CTD Anatomy 頁面組織和合并數據,允許用戶從解剖學角度探索交互;這可用于識別不同生理系統(例如腎臟、肝臟、大腦和心血管系統)獨有或共享的化學物質和表型,或發現例如影響影響的 1158 種化學物質 心臟中有 600 種表型。同樣,已經開始將 CTD 暴露與 CTD 解剖學相結合,使環境健康科學家能夠調查暴露研究和組織和系統暴露化學應激誘導表型的細節。***,為了幫助提高數據庫的互操作性。 代謝綜合癥MS鼠模型科研中標率高大黃酸處理沒有改變乳酸菌尿酸的產生。

5)USP35通過靶向FPN調節鐵下垂

我們接下來試圖闡明USP35對鐵死亡的可能機制。負責鐵輸入的蛋白質(Tf和TfR)沒有改變;然而,哺乳動物中關鍵的鐵轉運蛋白FPN在USP35缺乏的細胞中減少,而在過表達的細胞中增加(圖6A-C)。在USP35過表達的*細胞中,細胞膜中的FPN蛋白豐度增加,但由于USP35的敲除而降低(圖6D)。與分子變化一致,在USP35沉默或過表達的細胞中,胱氨酸攝取也不受影響(圖6E)。為了進一步證實FPN的參與,H460和H1299細胞分別預***shFPN以敲低內源性FPN表達。USP35過表達在鐵刺激時降低了肺*細胞內LIP和Fe2+,但在FPN缺陷細胞中未能做到這一點(圖6F)。

使用SmartSeq2協議對15個胎兒的單個細胞進行scRNA-seq處理(圖1 a)。

基于差異表達(DE)分析和按標準化表達***性排序的前20個標記基因。紅細胞(表達HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細胞祖細胞和單核細胞(表達CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細胞、肥大細胞(表達CD63、GATA2和HDC)、漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs;表達IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環pDCs(表達pDC和增殖標記物;例如,MKI67)和粒細胞1、2和3(表達AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細胞分析顯示,在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在***的轉錄異質性,一些表型祖細胞群體(如造血干細胞、MPPs、cmp、gmp、MEPs和CLPs)由超過10個不同的轉錄定義群體組成(圖1c).注釋了23個不同群體(圖1 d). 英拜跟客戶形成產學研合作模式。

MAPK級聯是人類****重要的致*驅動因子之一,通過靶向抑制劑阻斷這一信號通路是一種重要的抗**策略。因此,我們用MAPK通路抑制劑PD0325901處理SGC7901和MGC803細胞。Western blot顯示,PD0325901的加入***降低了MAPK1通路下游因子的***。而添加PD0325901后,MAPK1-109aa的表達水平沒有明顯變化(圖8a)。集落形成(圖8b,c)、EdU(圖8d,e)和Transwell實驗(圖8f)結果表明PD0325901處理后細胞的增殖和遷移能力明顯受到抑制。此外,在抑制劑存在的情況下,將shcircRNA轉染到SGC7901和MGC803細胞中,目的是部分提高MAPK通路的活性。然而,當細胞與PD0325901共同處理時,抑制circMAPK1沒有明顯的促*作用(圖8b-f)。綜上所述,這些結果證實了MAPK1-109aa通過與MEK1競爭相互作用抑制MAPK1的磷酸化,通過抑制MAPK通路發揮**抑制作用。

結論我們在胃*中發現了一種來自MAPK1的下調circRNA。MAPK1-109aa由circMAPK1編碼,通過與MAPK1競爭與上游激酶MEK1結合發揮***作用,抑制MAPK1磷酸化和下游致*因子。我們的研究結果提示circMAPK1可能作為GC的***靶點,也為MAPK通路***引起的疾病提供了新的***思路。 英拜提供春節回家探親車費補貼。生產因子科研分子生物學實驗

上海英拜生物的動物建模實驗。北京神經科研

4)體外實驗表明,上調UCP1以減輕AKI期間的脂質積累,可通過影響炎癥和凋亡,***抑制疾病進展

越來越多的證據表明,在AKI中有明顯的脂質積累和UCP1的異常表達,并與腎損傷的嚴重程度有很強的相關性。為了確定脂質積累是否影響AKI期間的細胞功能,我們首先使用UCP1過表達慢病毒和UCP1激動劑CL316243構建AKI細胞脂質積累***模型。如圖4A所示,在AKI中上調UCP1***脂質積聚,導致腎小管損傷指數、NGAL***下調,說明UCP1***脂質積聚可***減輕模型細胞的損傷。鑒于炎癥和凋亡是AKI細胞損傷**重要和直接的原因,我們對上述細胞模型中的炎癥和凋亡標記物進行了量化。IL-1β、IL-6和TNF-α隨著UCP1的上調而***降低(圖4B-D)。在凋亡指標Bax和C-caspase3中也觀察到類似的趨勢,而Bcl-2升高(圖4E)。***,通過TUNEL熒光染色直接定量評估細胞凋亡,證實上調UCP1緩解AKI模型細胞的凋亡(圖4F)。 北京神經科研

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎

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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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