熒光原位雜交和核胞質(zhì)RNA分?jǐn)?shù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，MIR210HG在Ishikawa細(xì)胞和HEC-1A細(xì)胞中均位于核和細(xì)胞質(zhì)內(nèi)(圖3D和3E)。我們假設(shè)MIR210HG對(duì)miRNAs起海綿作用。為了探究MIR210HG是否參與了一個(gè)新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)預(yù)測(cè)與HMGA2結(jié)合的mirna(圖3F)。選擇3個(gè)軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過(guò)將野生型雙熒光素酶載體介導(dǎo)的HMGA2構(gòu)建物共轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞，共鑒定和篩選了110個(gè)miRNAs。轉(zhuǎn)染后，23個(gè)miRNA轉(zhuǎn)染細(xì)胞的熒光素酶活性***降低(圖3G)。在上述23種miRNAs中，轉(zhuǎn)染miR-3373p、miR-137、let-7c-5p和miR-98-5p時(shí)，熒光素酶活性***降低，其中轉(zhuǎn)染miR-337-3p和miR-137時(shí)，熒光素酶活性降低**多。利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)TargetScan預(yù)測(cè)miR-337-3p和miR-137中與HMGA2結(jié)合的位點(diǎn)。雙熒光素酶基因報(bào)告基因檢測(cè)結(jié)果顯示，miR-337-3p和miR-137在其預(yù)測(cè)的結(jié)合位點(diǎn)上結(jié)合HMGA2(圖3H)。**近科研技術(shù)的開發(fā)。運(yùn)動(dòng)皮質(zhì)科研省自然科學(xué)基金
1）SsD在AML中表現(xiàn)出抗增殖活性
為了闡明SsD在白血病中的藥理作用，我們?cè)?0個(gè)人白血病細(xì)胞系中探討了一系列SsD濃度的影響。我們發(fā)現(xiàn)SsD在大多數(shù)白血病細(xì)胞系中以劑量依賴的方式抑制細(xì)胞活力(圖1A)。為了進(jìn)一步研究SsD對(duì)白血病的抑制作用，我們?cè)?種白血病細(xì)胞系NB4、kas1、MV4-11和U937(SsD敏感性排名前4位的細(xì)胞)進(jìn)行了集落實(shí)驗(yàn)。與細(xì)胞活力結(jié)果相似，SsD***抑制了所測(cè)細(xì)胞系的集落數(shù)量和大小(圖1B-E)。有趣的是，SsD對(duì)細(xì)胞增殖和活力的抑制可能是由于細(xì)胞周期阻滯在G1期和NB4細(xì)胞凋亡增加(圖1F-G)。 核受體與輔助調(diào)節(jié)因子科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)大黃酸處理改變腸道菌群組成。
3）LINC00926通過(guò)抑制乳腺*細(xì)胞中PGK1的表達(dá)來(lái)抑制糖酵解
由于PGK1是一種關(guān)鍵的糖酵解酶，而LINC00926被鑒定為負(fù)調(diào)控PGK1的lncRNA，我們想知道需氧糖酵解是否在LINC00926介導(dǎo)的乳腺*細(xì)胞增殖抑制中發(fā)揮作用。我們測(cè)試了LINC00926對(duì)葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成的調(diào)節(jié)作用。結(jié)果表明，LINC00926降低了葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成(圖3A)。在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中，PGK1的表達(dá)逆轉(zhuǎn)了這些作用。LINC00926還顯示出細(xì)胞外酸化率下降(圖3B和3C)。PGK1在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中重新表達(dá)挽救了這些效果。在PGK1敲低的MDA-MB-231或MCF-7細(xì)胞中敲低LINC00926對(duì)糖酵解表型沒(méi)有影響(圖3D-3F)，表明LINC00926通過(guò)PGK1抑制糖酵解表型。綜上所述，LINC00926通過(guò)抑制乳腺*細(xì)胞中PGK1的表達(dá)來(lái)抑制糖酵解。
5.腸道微生物群和循環(huán)代謝產(chǎn)物之間的聯(lián)系
采用非靶向代謝組學(xué)方法測(cè)量三組血清代謝產(chǎn)物，并研究腸道微生物組和宿主循環(huán)代謝產(chǎn)物之間的關(guān)系。主成分分析(PCA)顯示，三組間主要代謝成分差異***(圖6A)。OP***A的監(jiān)督正交投影評(píng)分圖也顯示出PCOS大鼠與對(duì)照組、DHEA+PBS組與DHEA+tempol組之間的明顯區(qū)別(圖6B)。圖6C列出了三組52種血清代謝物(包括26種脂類及類脂分子)的相對(duì)豐度，說(shuō)明PCOS大鼠大部分血清代謝物的豐度與對(duì)照組大鼠完全不同，說(shuō)明DHEA***對(duì)血清代謝有深遠(yuǎn)的影響。PCOS大鼠服用Tempol后，血清代謝產(chǎn)物的豐度也發(fā)生了***變化，引起28種血清代謝物豐度的變化在tempol作用下部分減弱(圖6C)。 英拜跟客戶形成產(chǎn)學(xué)研合作模式。
此外，在敲除內(nèi)源性FPN后，USP35過(guò)表達(dá)引起的ROS和丙二醛生成的減少也被減緩(圖6G)。我們還評(píng)估了體內(nèi)和體外RSL3***后FPN在肺*細(xì)胞或**異種移植中的作用。如圖7A-C所示，F(xiàn)PN敲除恢復(fù)了USP35過(guò)表達(dá)肺*細(xì)胞的細(xì)胞內(nèi)LIP和Fe2+水平，同時(shí)增加了ROS和MDA的形成。與此同時(shí)，F(xiàn)PN敲除后，由于USP35過(guò)表達(dá)而增加的細(xì)胞活力和集落形成也被逆轉(zhuǎn)(圖7D-F)。根據(jù)體外數(shù)據(jù)，F(xiàn)PN敲除后，USP35過(guò)表達(dá)細(xì)胞的**體積和重量均有所減少(圖7G，H)。更重要的是，我們發(fā)現(xiàn)FPN的膜分布在肺ADC和SCC**中***增加(圖7I)。綜上所述，這些數(shù)據(jù)表明FPN是USP35調(diào)節(jié)鐵死亡和**進(jìn)展的潛在靶點(diǎn)。上海英拜生物提供可視化實(shí)驗(yàn)過(guò)程參觀。細(xì)胞死亡通路發(fā)現(xiàn)者科研國(guó)家自然科學(xué)基金
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與HuR的RRM3結(jié)合，中斷HuR-β-actinmRNA相互作用，抑制β-actin表達(dá)，抑制OPC遷移
為闡明lnc-PMIF如何與HuR相互作用調(diào)節(jié)β-actin表達(dá)和OPC遷移，首先通過(guò)生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè)了lnc-PMIF的二級(jí)結(jié)構(gòu)，并合成生物素化的全長(zhǎng)lnc-PMIF（WT）和截短的lnc-PMIF突變體，分別為突變體A1（無(wú)5’莖環(huán)的正義）、突變體A2（有中心莖環(huán)和3’莖環(huán)的正義）和突變體A3（*有3’莖環(huán)的正義1100-1455bp），轉(zhuǎn)染MC3T3-E1細(xì)胞，并進(jìn)行標(biāo)記RNA鏈霉親和素下拉試驗(yàn)。蛋白免疫印跡分析顯示，HuR存在于轉(zhuǎn)染W(wǎng)Tlnc-PMIF、截短lnc-PMIF突變體A1或截短lnc-PMIF突變體A2的細(xì)胞的下拉部分中，但在轉(zhuǎn)染截短lnc-PMIF突變體A3的細(xì)胞的下拉部分中不存在。這些數(shù)據(jù)表明，lnc-PMIF的中心莖環(huán)足以實(shí)現(xiàn)lnc-PMIF和HuR之間的相互作用。 運(yùn)動(dòng)皮質(zhì)科研省自然科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)