2021年,來自加拿大多倫多大學和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學等團隊合作在Naturecommunication雜志上發表了文章“BiologicalandtherapeuticimplicationsofauniquesubtypeofNPM1mutatedAML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質性?;趓na-seq的基因表達譜分析,確定了兩種新亞型,稱為原始型和committed型?;诨虮磉_、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異,在**的AML隊列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態和患者生存聯系起來。此外,表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學上的異質性疾病,其特征是克隆擴增和突變的造血干細胞和祖細胞分化受損。在AML**常見的驅動突變中,NPM1基因第12外顯子的4堿基對插入是穩定的,在20%-30%的病例中發生。由于其生物學意義和預后影響,NPM1突變在世界衛生組織(WHO)的髓性白血病分類中**了一個獨特的白血病實體,并在預后和***決策中發揮重要作用。增加乳酸桿菌水平導致尿酸水平下降。成都病理科研
轉錄組學 (RNA-Seq) 模塊
RNA-seq 模塊對與衰老相關的全基因組轉錄組變化進行編目。RNA-seq 模塊中收集的數據集來自與衰老研究相關的已發表文章。該模塊收集在特定基因干預(過表達、敲除等)時觀察到的轉錄組變化,該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過程中基因表達譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個可能與衰老有關的差異表達基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中,可以通過基因名稱輕松搜索 DEG,并且每個 DEG 條目都包含潛在的實驗條件和基因表達的倍數變化及其發布的來源。可以下載每篇文章中的所有搜索結果和相應的DEG數據庫。 粘性鏈接芯片科研實驗外包METTL14的上調可以通過m6A修飾降低PERP水平。
宏基因組測序是對特定環境樣品中的微生物群體基因組(尤其是那些種類眾多的難于培養的微生物)。進行序列測定和功能基因的發掘,來分微生物群體基因組成及功能,解讀微生物群體的多樣性與豐度,發覺和研究新的、具有特定功能的基因。目前宏基因組學研究在發現新基因,開發新的微生物活性物質,研究微生物群落結構及功能方面得到應用,宏基因組測序技術為微生物的研究和發展提供了很好的策略。 英拜公司以高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的生物實驗平臺,為您的科研添磚加瓦。
這些明確的造血干細胞在妊娠后4周(pcw)首先在胎兒肝臟定植,并在那里大量擴張。在10.5 pcw時,造血部位再次轉移到骨腔(即骨髓[BM]),成人造血在此處長久建立。人們認為,***批在骨髓中播種的造血干細胞在其增殖和分化特性發生戲劇性變化之前,會繼續快速增加數量,以適應高產量分化子代的需要。
歷史上,造血系統的分化過程被描述為一系列中間步驟,由細胞表面標記物(即分化簇[CD])定義。在這個模型中,造血干細胞通常表現為造血樹,造血干細胞產生了越來越多的譜系限制性細胞類型,**終導致成熟的血細胞。這種模式在過去的5年里發生了改變,一些研究報告了數千個單個造血細胞的轉錄組,這些細胞被細胞表面標記物隔離,在小鼠模型和成人中。這些報告表明,以前被認為是同質的祖先種群,實際上在轉錄水平上是非常異構的。 我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。
2)M1-BMDMs來源的外泌體加重了bEnd.3細胞的EndoMT
我們評估了M1-BMDMs對bEnd.3細胞的影響。結果表明,M1-BMDMs條件培養基(M1-CM)***降低了bEnd.3細胞TEER值(圖2A),并增加通透性(圖2B)。此外,TJs蛋白熒光染色顯示,M1-CM處理***降低了bEnd.3細胞膜ZO-1和Occludin的表達(圖2C和D)。為了進一步研究M1-BMDMs是否通過外泌體破壞血管內皮細胞的TJs,我們使用外泌體分泌抑制劑GW4869預處理M1-BMDMs。我們發現,加入GW4869部分逆轉了M1-CM誘導的TEER值的下降(圖2A),滲透率增加(圖2B);GW4869也逆轉了TJs蛋白熒光強度下降的趨勢(圖2C和D)。相應的,TJs蛋白表達水平也出現了類似的結果(圖2E)。有趣的是,通過對脊髓切片中的α-SMA和CD31進行共染色,我們發現損傷部位的共定位比未損傷部位更多(圖2F和G)。M1-CM***改變bEnd.3細胞形態,分枝減少,胞體拉長(圖2H)。此外,M1-CM暴露***降低了CD31的表達,并強烈增強了EndoMT標記物膠原I、III和α-SMA在bEnd.3細胞中的表達(圖2I)。然而,GW4869可以部分扭轉這些影響。綜上所述,外泌體可能介導巨噬細胞和血管內皮細胞之間的相互作用,并可能是巨噬細胞誘導血管內皮細胞EndoMT的原因。 上海英拜生物有經驗豐富的科研團隊。湖北細胞因子和趨化因子科研
評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調節因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達。成都病理科研
為理解TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的機制作用,從4T1-P、TYRO3-OE、4T1-R和TYRO3–/–細胞中提取RNA進行全轉錄組分析。2種耐藥細胞系Tyro3-OE和4T1-R之間的轉錄組學變化高度相似,變化的重疊百分比較高,表明Tyro3在促進**細胞對抗PD-1/PD-L1***耐藥中的作用。來自TCGA數據庫的黑色素瘤患者TYRO3基因的通路分析也顯示TYRO3表達與PD-1/PD-L1**免疫***通路呈正相關,與T細胞介導的抗**反應相關通路(CTL介導的細胞凋亡和死亡受體信號),炎癥反應相關通路(Th1活化、Th2活化、NF-κB信號)呈負相關。HMGB1是一種損傷相關分子模式分子,由嗜鐵細胞釋放,我們發現HMGB1信號與TYRO3表達呈負相關。以上表明,TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的作用,并表明TYRO3有利于***TME。成都病理科研
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗