3.分析突變的LIR基序（LAMs）在泛*中的作用
使用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn)，STDB1在泛*中為抑制**；在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中為促進(jìn)**。
驗(yàn)證LIR基序突變影響自噬
在HEK293T細(xì)胞中進(jìn)行co-IP，結(jié)果表明STBD1LIR基序W203C是影響基因互作的重要結(jié)構(gòu)。
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，STBD中W203C突變影響其與GABARAPL1的結(jié)合，進(jìn)而影響自噬指標(biāo)的表達(dá)。
5. 在臨床樣本中檢測(cè)STBD1的表達(dá)
在*組織、*旁中檢測(cè)STBD1的表達(dá)水平，結(jié)果表明STBD1在*組織中***下調(diào)，與之前的預(yù)測(cè)結(jié)果一致。
6.細(xì)胞實(shí)驗(yàn)研究STBD1的功能
在多種*細(xì)胞中進(jìn)行細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)，STBD1抑制*細(xì)胞生長(zhǎng)，突變W203C會(huì)部分回復(fù)STBD1的抑制作用。
7.動(dòng)物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證STBD1的功能
裸鼠成瘤實(shí)驗(yàn)表明，STBD1抑制**生長(zhǎng)。
8.轉(zhuǎn)錄組、代謝組分析
在細(xì)胞中干擾STBD1，然后進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，分析表達(dá)水平***改變的基因，并進(jìn)行通路富集分析。分析發(fā)現(xiàn)，STBD1抑制**生長(zhǎng)可能是通過改變基因轉(zhuǎn)錄和重塑糖酵解/糖異生途徑。
為了進(jìn)一步驗(yàn)證STBD1是否重塑代謝，進(jìn)行代謝組分析。結(jié)果表明，STBD1敲除后糖酵解增強(qiáng)。
9.構(gòu)建LIRCP調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)
將LAMs對(duì)應(yīng)蛋白、自噬相關(guān)基因按照生物學(xué)功能聚類，構(gòu)建調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)，將自噬與**聯(lián)系起來(lái)。
上海英拜生物設(shè)有專業(yè)的武漢技術(shù)中心。胞質(zhì)科研中標(biāo)率高
第三步：上傳附加文件（可以選擇性上傳）
附加文件中可以包括平臺(tái)、批次等信息。 例如，在平臺(tái)列中，“1”表示數(shù)據(jù)來(lái)自 Affymetrix U133 plus2 平臺(tái)，“2”表示來(lái)自安捷倫微陣列芯片的數(shù)據(jù)，“3”表示來(lái)自 Illumina Hiseq 2000 的數(shù)據(jù)等。
第四步：填寫電子郵箱（選填，建議填寫）
如果填寫郵箱，結(jié)果會(huì)以郵件形式發(fā)送至該郵箱。
第五步：提交
數(shù)據(jù)文件全部上傳后，點(diǎn)擊“Submit”進(jìn)行提交，頁(yè)面會(huì)自動(dòng)跳轉(zhuǎn)至結(jié)果頁(yè)。也可以根據(jù)頁(yè)面給出的job ID查詢結(jié)果。
總而言之，我們可以使用Rank-In對(duì)**的芯片和 RNA-seq中的混合數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。 滲透性應(yīng)激科研地區(qū)科學(xué)基金英拜生物您隨身的科研小助手。
RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上，而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和IncRNAs.上普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)".“消碼器(Eraser"和“讀碼器(Reader"決定[1]。“編碼器(Writer)"即甲基轉(zhuǎn)移酶。目前已知這個(gè)復(fù)合物的成分有METTL3，METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉(zhuǎn)甲基化;m6A由m6A結(jié)合蛋白識(shí)別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結(jié)合蛋白(讀碼器)有YTH結(jié)構(gòu)域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3，YTHDC1和YTHDC2)和核不均-蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。
現(xiàn)今研究表明tRNA-derivedsmallnoncodingRNAs（sncRNAs）主要分為兩類：tRNAhalves(tiRNAs)和fragments(tRFs)。前者在人類實(shí)體**中的的生物學(xué)功能吸引了越來(lái)越多的關(guān)注，但是其在**發(fā)生中的生物學(xué)機(jī)制仍知之甚少。tiRNAs和剪切相關(guān)蛋白之間的相關(guān)作用更是為未可知。本研究***發(fā)現(xiàn)一個(gè)5’-tRNAhalves，即tiRNA-Gly通過與RBM17結(jié)合誘導(dǎo)可變剪切進(jìn)而促進(jìn)**狀甲狀腺*（PTC）的增殖和遷移。本文于2021年7月發(fā)表在影響因子7.068的《JournalofExperimentalandClinicalCancerResearch》期刊上。文章檢測(cè)了小鼠腸系膜淋巴結(jié)(MLN)中的Th17細(xì)胞（與結(jié)腸炎癥密切相關(guān)）。
7）NOX4通過氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的人體星形膠質(zhì)細(xì)胞的脂質(zhì)過氧化促進(jìn)鐵死亡
為了探討NOX4調(diào)控AD星形膠質(zhì)細(xì)胞氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡的分子機(jī)制，我們檢測(cè)NOX4的升高是否能通過氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的人星形膠質(zhì)細(xì)胞脂質(zhì)過氧化促進(jìn)鐵死亡。我們用免疫熒光染色法測(cè)定了4-HNE在人星形膠質(zhì)細(xì)胞中的蛋白水平。免疫熒光染色顯示，與對(duì)照組相比，NOX4的升高增加了4-HNE蛋白的水平，增加了質(zhì)膜中脂質(zhì)過氧化源性液滴的含量，細(xì)胞的形狀出現(xiàn)收縮(圖7A)。NOX4過表達(dá)使4-HNE陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)量***增加(圖7B)。NOX4過表達(dá)增加了4-HNE水平和MDA水平(圖7C)。值得注意的是，與對(duì)照組相比，NOX4的升高增加了鐵的積累，這是鐵死亡的特異性標(biāo)志(圖7D)。 這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強(qiáng)。拷貝數(shù)科研實(shí)驗(yàn)外包
英拜的高通量測(cè)序服務(wù)質(zhì)量。胞質(zhì)科研中標(biāo)率高
此外，核輸出基因Emb (Exportin)的mRNA水平在tbi后***增加(圖1M)，而與對(duì)照組相比，微管相關(guān)蛋白Futsch的mRNA水平?jīng)]有變化(圖1圖Supplement 1H)，這與蛋白質(zhì)組學(xué)分析一致。Western blotting進(jìn)一步證實(shí)了tbi依賴性的果蠅幼蟲腦內(nèi)Nup214蛋白水平的升高(圖1N和O)。Western blot分析了損傷后幼蟲(0、2、4和6小時(shí))和成蟲(0、2、4、24和72小時(shí))的時(shí)間過程，以評(píng)估Nup214蛋白的水平。在檢測(cè)的時(shí)間點(diǎn)上，不管是幼蟲還是成人的大腦中，Nup214蛋白的水平都是上調(diào)的(圖1P,Q,R,S)，這表明創(chuàng)傷可能會(huì)破壞Nup214的水平和體內(nèi)的轉(zhuǎn)換。胞質(zhì)科研中標(biāo)率高
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)