6)MAPK1-109aa通過競爭性結合MEK1來抑制MAPK1的磷酸化
為了研究MAPK1-109aa抑制GC的分子機制,我們將標記的MAPK1-109aa質粒轉染HEK293T細胞。在flag標記的MAPK1-109aa免疫沉淀復合物中,潛在的相互作用蛋白被拉下(圖7a)。采用蛋白MS分析對差異表達蛋白進行鑒定。在被識別的蛋白質列表中,豐度比較高的蛋白質是MEK1,表明MEK1是MAPK1-109aa潛在的相互作用蛋白(圖7b,c)。此外,flag標記的MAPK1-109aa可以與MEK1相互作用,證實了MAPK1-109aa與MEK1之間的直接相互作用(圖7d)。免疫熒光染色顯示MAPK1-109aa與MEK1共定位(圖7e)。此外,我們采用MEK1抗體免疫共沉淀,探討MAPK1-109aa對MAPK1通路的潛在調控作用。我們發現,在circMAPK1穩定下調的SGC7901和MGC803細胞中,與對照組相比,MAPK1-109aa與MEK1的結合明顯減少,而MAPK1與MEK1的結合增加(圖7f)。 課題CRO服務找上海英拜。海南課題
3)USP35過表達阻斷erastin/RSL3介導的**抑制作用細胞也用慢病毒載體***以在體外過表達USP35,并通過PCR驗證其效率(圖3A)。然而,在基礎條件下,USP35過表達不影響H460和H1299細胞的細胞死亡和集落形成(圖3B,C)。裸鼠的**體積和重量也不受USP35過表達的影響(圖3D,E)。我們進一步研究了USP35操作是否對鐵刺激引起的細胞死亡有影響。不出所料,erastin或RSL3處理***降低了H460和H1299細胞的細胞活力或集落形成,而這是通過USP35過表達來阻止的(圖3F,G)。相應地,接種CTRL肺*細胞的裸鼠在erastin或RSL3***后**體積和重量減少;然而,這些**抑制作用被USP35過表達阻斷(圖3H,I)。總的來說,USP35過表達阻斷了erastin/RSL33介導的**抑制作用。海南課題生命科學領域內的精細研究。
**調節因子通常作為蛋白質復合物中的亞基存在,并以多種方式參與轉錄調控,例如通過調節組蛋白修飾和染色質結構。哺乳動物BRG1-或brm相關的染色質重塑復合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細胞染色質可及性景觀。該復合物是細胞周期和增殖的關鍵調控因子,也是前列腺*的驅動因子,具有多種**特異性作用。此外,頻繁發生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復合物重新靶向于染色質,促進前列腺*的發生。互斥的ATPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復雜功能的關鍵組件。此外,AR與DNA序列特異性轉錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經建立。TF FOXA1可以結合到封閉的染色質區域,調節其染色質可及性,從而促進AR結合染色質引發PCa。
結直腸* (CRC) 在世界范圍內普遍存在,其死亡率主要是由于其轉移到遠處的關鍵***而造成的。外泌體-microRNA(miRNA)分泌已被表征為*細胞間細胞間通訊的重要因素。 然而,**分泌的 miRNA 與結直腸* (CRC) 轉移的特異性相關知之甚少。因此了解 CRC 轉移的確切分子機制對于確定新的診斷生物標志物和制定 CRC 患者的***策略非常重要。目前,有作者對這一機制進行了研究,該研究于2021年6月發表在l《Molecular Therapy-Nucleic Acids》,IF:8.886。提供整體課題外包實驗構思。
JAK-Stat6信號通路在介導IL-4/IL-13誘導TME中TAMs免疫抑制極化過程中起關鍵作用。IL-4/IL-13刺激后,JAK磷酸化,隨后Stat6磷酸化,磷酸化后的Stat6二聚并遷移至細胞核,然后與IL-4/IL-13相應基因,包括那些參與巨噬細胞免疫響應功能的基因的啟動子結合。據報道ROS可以促進JAK和Stat6磷酸化。因此,推測MAO-A可能通過上調ROS水平影響巨噬細胞極化,從而使JAK-Stat6信號通路敏感。事實上,直接分析從B16-OVA荷瘤MaoaWT和MaoaKO小鼠中分離的TAMs證實,與野生型TAMs相比,MAO-A缺陷的TAMs顯示Stat6***降低(圖4k-l)。進一步分析IL-4/IL-13誘導的JAK-Stat6信號通路,與在MaoaWTBMDMs中相比,在MaoaKOBMDMs中JAK-Stat6信號***下降,補充H2O2可使其JAK-Stat6信號達到與WT類似水平(圖4m)。這些數據表明MAO-A通過ROS致敏的JAK-Stat6通路***促進巨噬細胞免疫抑制極化。總之,這些體內外數據支持MAO-A促進TME中免疫抑制極化,通過上調TAM細胞內ROS水平,從而提高IL-4/IL-13誘導的JAK-Stat6信號通路。高通量測序的后續成文服務。新疆課題創新服務
TIMEOR是***個基于 Web 的自適應時間序列多組學管道方法。海南課題
6)上調UCP1減輕AKI中的脂質積累,可***緩解體內炎癥和凋亡
以上研究證實,在體外,上調UCP1可以通過抑制炎癥和凋亡來抑制AKI的進展。為了探究其在體內的作用,我們在腎多點注射模型中檢測了相應的指標。如圖6A-E所示,炎癥指標CD68、IL-1β、IL-6、TNF-α均***降低,UCP1上調。在凋亡方面,凋亡指標Bax和C-caspase3也隨著UCP1的上調而降低,而Bcl-2隨著UCP1的上調而升高(圖6F)。TUNEL熒光染色也直接證明了UCP1上調導致的凋亡減少(圖6G-H)。同樣,我們也使用UCP1激動劑CL316243在動物模型中證實了同樣的炎癥和凋亡趨勢(圖6I-P)。 海南課題
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗