5、確認PDCD4在調節Treg擴增中的作用
隨后探究了PDCD4在調節Treg擴增中的作用。如圖A-C所示，成功構建了PDCD4的過表達和干擾表達細胞系。與對照組相比，PDCD4過表達***降低了Treg細胞的擴增率，而干擾其表達則***提高了Treg細胞的擴增率。表明PDCD4是負調節Treg細胞擴增的關鍵基因。
6、**來源外泌體miR-208b影響體內化療效果和**生長
隨后作者探究了**來源外泌體miR-208b體內對化療效果和**生長的影響。用慢病毒轉染CT26細胞產生miR-208b過表達和miR-208b敲低細胞系。動物實驗設計示意圖如圖7A所示，實驗采用6組(每組10只小鼠)，其中3組使用奧沙利鉑，BALB/c小鼠植入CT26細胞，建立**植入模型。如圖7B-7D所示，miR-208b-OE組**生長速度較快，而中miR-208-KD組**生長明顯慢于對照組。 TIMEOR是***個基于 Web 的自適應時間序列多組學管道方法。分子生物學課題分子生物學
巨噬細胞的差異***與**進展密切相關，而表觀遺傳因子賴氨酸去甲基化酶6B (KDM6B，先前命名為JMJD3)通過一種未知的機制調節巨噬細胞的極化。本文探討了該調解機制及其功能，并于2021年5月發表在《Theranostics》IF:8.579期刊上。
1、巨噬細胞KDM6B的表達被miR-138-5p抑制
根據文獻報道KDM6B是巨噬細胞的***的關鍵分子，因此，作者首先檢測了乳腺*細胞系MB-MDA-231對巨噬細胞系TPH-1中KDM6B表達的影響，結果表明乳腺*細胞及其條件培養基都可***下調KDM6B的表達，表明存在一種乳腺*細胞來源的分泌因子產生此種影響。因此，通過生物信息學預測了KDM6B結合的miRNA，以及結合文獻，通過在乳腺*中上調的，同時符合條件的有3個。隨后將乳腺*細胞和巨噬細胞共培養，檢測三個miRNA的表達，如圖1B所示，只有miR-138-5p和miR-146a的表達在共培養后***上調。進一步檢測發現，只有miR-138-5p處理后KDM6B的表達***下降而非miR-146a（圖1C-D）。生信分析預測了miR-138-5p和KDM6B的結合位點，并進行了熒光素酶實驗檢測，證實了兩者間存在結合關系。 課題整包課題基礎實驗外包課題CRO服務找上海英拜。
circNDUFB2觸發NSCLC細胞的免疫防御反應
為了研究參與circNDUFB2的信號通路，使用RNA測序（RNA-seq）進行了轉錄組分析。結果表明circNDUFB2過表達影響934個基因的表達水平，其中743個基因上調，191個基因被下調。基因本體生物學過程（GO_BP）和KEGG途徑富集分析表明circNDUFB2觸發了免疫防御和I型干擾素（IFNs）信號傳導。基因集富集分析（GSEA）也表明目標基因的信號傳導途徑參與了免疫反應。確認了在circNDUFB2過表達的NSCLC細胞中一組免疫基因表達被上調，而circNDUFB2敲低降低了NSCLC細胞中這些基因的水平。這些結果表明，過量表達circNDUFB2，而不是其具有相同序列的線性RN**段，導致免疫基因上調。 酶聯免疫吸附試驗（ELISA）證實circNDUFB2過表達顯著增加了細胞培養上清液中CXCL10，CXCL11，CCL5和IFNβ的水平，而circNDUFB2敲低降低了細胞培養上清液中這些細胞因子的水平。這些結果證明circNDUFB2在NSCLC細胞中引發免疫應答。
六、改進分選策略以分離胚胎HSCs/MPPs
研究者基于細胞表面標記設計了一種針對HSCs / MPP的新的熒光***細胞分選策略（簡稱CD-REF），使用CD-REF分選板對股骨BM細胞進行分選，結果顯示標記為HSCs / MPP和HSCs / MPPs-Cycle簇的CD-REF細胞約占88％。為了評估CD-REF細胞譜系輸出的分化潛力和穩健性，研究人員在小鼠MS5飼養層或更具生理相關性的人類胎兒間充質干細胞（fMSCs）上對三個胎兒的單個細胞進行了分選，結果顯示MS5和fMSCs上分別存在著四系、三系、雙系、單系和未分化的譜系集落。接下來，又對單個CD-REF和免疫表型HSCs進行了分類，結果顯示CD-REF在胎兒肝臟和骨髓中富集了多譜系輸出的細胞群，且CD-REF細胞具有與表型HSCs相當的多潛能性和譜系輸出能力，這與前述分化軌跡探究一致，再次驗證CD-REF**了高富集的HSC/MPPs群體。 TIMEOR用于推斷基因調控事件之間的關系。
相比之下，Pten398A/398A;MMTVneu小鼠**發展加快，中位生存期縮短至199天(圖1A)。對Pten+/+;MMTVneu和Pten398A/398A;MMTVneu小鼠的石蠟包埋**標本進行免疫組化檢測γH2AX。采用半定量方法對γH2AX免疫反應性進行評分(表1)。Pten+/+;MMTVneu**一般很少表達γH2AX(圖1B)。所有Pten398A/398A;MMTVneu樣本均為γH2AX強陽性，表明更高水平的基因組不穩定性(圖1B, C)。我們通過對**樣本的western blot分析證實了這些結果，結果顯示Pten398A/398A;MMTVneu**比Pten+/+;MMTVneu**表達更高水平的γH2AX(圖1D, E)。通過對Ki-67進行免疫組化來評估**的增殖指數，Ki-67是常規病理中***使用的標志物。兩種基因型Pten+/+**的Ki67免疫反應性無***差異;MMTVneu(補充圖2C, D)。總之，Pten398A突變加速mmtv神經驅動的**發生，這與更高的基因組不穩定性有關，但在細胞增殖中沒有明顯的改變。***ATM對PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。標志物課題實驗檢測服務
TRF測序課題整體服務。分子生物學課題分子生物學
雄***和雄***受體(AR)是******轉錄因子(TF)，是驅動前列腺*(PCa)發***展的關鍵因素。因此AR是晚期PCa******的主要分子靶點。雄***剝奪療法，特別是第二代抗雄***和雄***合成抑制劑**初是有效的。然而，由于患者仍然可以從晚期PCa進展到致命性去勢抗性前列腺*(CRPC)，需要新的***靶點和生物標志物。靶蛋白的一個來源可能是ar相關的染色質蛋白。
大多數目前已知的核受體(NR)相互作用蛋白，包括那些AR，已經通過遺傳篩選，如雙雜交系統，免疫共沉淀和基于肽段的體外方法。盡管親和純化-質譜耦合(MS)已經啟發了NRs的輔助調節器，但它很少在**NRs自然環境的條件下進行。然而，通過利用RIME(內源性蛋白快速免疫沉淀MS)，Paltoglou等人和Stelloo等人已經從PCa細胞交聯染色質中鑒定了幾種內源性AR相關蛋白。 分子生物學課題分子生物學
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