二、INPP4B增強pik3a突變ER+乳腺*和乳腺上皮細胞增殖
GFP-INPP4B在MCF-7和T47D ER+乳腺*細胞中表達,這兩種細胞分別有PIK3CAE545K和PIK3CAH1047R高活化突變.*細胞進行非錨定細胞生長的能力是細胞轉化的一個標志。GFP-INPP4B***增加了軟瓊脂中MCF-7細胞集落大小(2.1倍)和T47D細胞集落大小(1.8倍),但對集落數量沒有影響(圖2a-c)。與細胞增殖增加相一致。與載體對照相比,GFP-INPP4B在血清剝奪后增強了MCF-7細胞的增殖(1.7倍)(圖2d, e),但不影響在含血清培養基中生長的MCF-7細胞的增殖。過表達GFPINPP4B的MCF-7細胞中,egf刺激的AKTS473和AKTT308磷酸化水平略有降低(圖2f-h)。 代謝變化被認為是腸病**重要的特征之一??臻g轉錄組學科研歡迎咨詢
生物標志物是生物體中可測量的物質或特征,它指示某些現象,例如狀況,疾病,飲食,干預措施或環境暴露。在這方面,生物標記物可分為三種類型:(i)分子(化學物質,蛋白質或基因),(ii)細胞(細胞類型,細胞形態,組織組織學)或(iii)成像(X射線,CT) ,PET或MRI功能)。生物標記物類型的選擇在很大程度上取決于所研究的現象和所研究的生物系統。在醫學中,生物標志物的主要目的是診斷,預后或預測疾病。它們還可以用于評估藥物,***,污染物,食物或其他攝入物質的暴露。服務科研國家自然科學基金發現乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。
相比之下,Pten398A/398A;MMTVneu小鼠**發展加快,中位生存期縮短至199天(圖1A)。對Pten+/+;MMTVneu和Pten398A/398A;MMTVneu小鼠的石蠟包埋**標本進行免疫組化檢測γH2AX。采用半定量方法對γH2AX免疫反應性進行評分(表1)。Pten+/+;MMTVneu**一般很少表達γH2AX(圖1B)。所有Pten398A/398A;MMTVneu樣本均為γH2AX強陽性,表明更高水平的基因組不穩定性(圖1B, C)。我們通過對**樣本的western blot分析證實了這些結果,結果顯示Pten398A/398A;MMTVneu**比Pten+/+;MMTVneu**表達更高水平的γH2AX(圖1D, E)。通過對Ki-67進行免疫組化來評估**的增殖指數,Ki-67是常規病理中***使用的標志物。兩種基因型Pten+/+**的Ki67免疫反應性無***差異;MMTVneu(補充圖2C, D)??傊?,Pten398A突變加速mmtv神經驅動的**發生,這與更高的基因組不穩定性有關,但在細胞增殖中沒有明顯的改變。
HoxBlinc在造血中的轉基因表達導致小鼠的AML樣致死疾病
已有研究表明,小鼠造血干細胞(HSCs)中人源化NPM1c+敲入等位基因(NPM1c/+)的***會導致Hox基因過度表達、增強self-real和骨髓增生擴大,以及遲發性AML的發展。由于NPM1c+***HOXBLINC,而HOXBLINC對NPM1c+介導的轉錄程序和白血病發生至關重要,因此確定HOXBLINC的***是否足以導致異常造血和類似于NPM1c/+小鼠的髓系惡性**非常重要。HoxBlinc在長期(LT)和短期(ST)造血干細胞中表達高,在祖細胞(MPP,CMP和GMP)中表達降低,除了B220+B細胞,在成熟細胞系中進一步降低(圖2a)。HoxBlinc在造血中的表達模式提示該lncRNA可能在調控HSPC功能中發揮重要作用。為了研究HoxBlinc活化對體內正常造血和白血病發生的影響,構建了HoxBlinc轉基因(Tg)小鼠模型,在Vav1啟動子和增強子(HS321/45-vav載體)的控制下,將全長小鼠HoxBlinccDNA插入小鼠基因組,以確保轉基因在造血系統中的特異性表達(圖2b)。獲得2只HoxBlincTg小鼠。將該轉基因插入到Tg第1系18q染色體上Bin1基因的內含子中(圖2c)。BM細胞中HoxBlincRNA的表達水平分別是TgLine#1和#2內源性HoxBlinc表達水平的18倍和3倍(圖2d)。 我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。
Il4ra缺陷小鼠的M2樣巨噬細胞減少和再生失調
為了探索再生過程中胰腺巨噬細胞的調節機制,我們進行了基因集富集分析(GSEA)以比較第3天和第1天巨噬細胞的轉錄組譜。巨噬細胞的M2***和IL4刺激特征從第3天開始富含巨噬細胞。我們發現,表達IL-4和IL-13分別提高在第1天,和表達Il4ra自第1天升高,達到峰值在第3天。為了進一步確定受體和配體的細胞來源,在AP損傷后***從胰腺中分離并比較了CD45.2+和CD45.2-細胞,有趣的是,Il4ra1被顯性免疫細胞上表達(CD45.2+),而IL4和IL13中主要表達于實質細胞(CD45.2-)。此外,通過使用Il4ra缺陷小鼠,我們證明了IL4Rα信號在AP損傷后胰腺修復/再生過程中介導了M2巨噬細胞的極化。值得注意的是,與它們的對應物相比,來自Il4ra-/-小鼠的胰腺在第3天和第5天具有更多的ADM結構。總的來說,這些發現表明IL4/IL4Rα軸是AP恢復過程中胰腺巨噬細胞M2極化所必需的,發揮***功能來控制ADM形成的程度。 上海英拜生物提供可視化實驗過程參觀。推薦科研省自然科學基金
大黃酸可以改變腸道菌群組成??臻g轉錄組學科研歡迎咨詢
為理解TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的機制作用,從4T1-P、TYRO3-OE、4T1-R和TYRO3–/–細胞中提取RNA進行全轉錄組分析。2種耐藥細胞系Tyro3-OE和4T1-R之間的轉錄組學變化高度相似,變化的重疊百分比較高,表明Tyro3在促進**細胞對抗PD-1/PD-L1***耐藥中的作用。來自TCGA數據庫的黑色素瘤患者TYRO3基因的通路分析也顯示TYRO3表達與PD-1/PD-L1**免疫***通路呈正相關,與T細胞介導的抗**反應相關通路(CTL介導的細胞凋亡和死亡受體信號),炎癥反應相關通路(Th1活化、Th2活化、NF-κB信號)呈負相關。HMGB1是一種損傷相關分子模式分子,由嗜鐵細胞釋放,我們發現HMGB1信號與TYRO3表達呈負相關。以上表明,TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的作用,并表明TYRO3有利于***TME??臻g轉錄組學科研歡迎咨詢
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗