接下來為了證明,SUMOylation對BCas誘導的淋巴內皮管的形成和遷移作用,通過其特異性抑制劑阻斷SUMOylation (2D-08)明顯抑制了該誘導過程(Figure 1 G-I)。以上數據表明,UBC9異常高表達與膀胱*進展和淋巴結轉移正相關,SUMOylation參與膀胱*的淋巴結轉移。
2.EVs介導的ELNAT1過表達與淋巴結轉移相關
EVs介導的lncRNA轉運是**細胞與TME之間通過信號轉導發生的一個關鍵過程。作者采集各5例的健康志愿者與BCas患者的尿液,通過NGS測序確定了EVs中lncRNA的整體表達譜,結合與SUMOylation途徑的相關性,**終篩選出EVs中異常高表達的lncRNAELNAT1(Figure2A,B)。結合BCa與LN轉移,ELNAT1在BCa與LN轉移中高表達(Figure2C,D),并且ELNAT1過表達與BCa患者預后不良相關(Figure2E,F)。另外,在瘤內和瘤旁區域ELNAT1的表達與淋巴管密度正相關(Figure2G,H),提示ELNAT1***參與BCa的淋巴管生成。 神經元中FTH的敲除抵消了褪黑素對創傷性腦損傷鐵死亡的保護作用。淋巴水腫鼠模型科研國家自然科學基金
其次,采用UPGMA、PCoA和NMDS評估不同群體的腸道菌群β-多樣性。UPGMA聚類方法將對照組和PCOS大鼠樣本分為兩組,表明PCOS大鼠和對照組的腸道微生物分布不同。雖然DHEA + tempol組不能完全與DHEA + PBS組分離,但與DHEA + PBS組有所不同,說明給藥tempol影響了PCOS大鼠的腸道微生物分布(圖4G)。PCoA和NMDS分析進一步顯示,三組大鼠腸道總體微生物組成不同(圖4H-I),而Permanova/ Anosim分析表明,三組間差異***(圖4J)。上述結果表明,DHEA和tempol處理可影響腸道微生物的β-多樣性。受體科研英拜提供生命科學內的一體化服務。
4)circPDE4B促進了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成,促進了RIC8A的降解
我們試圖鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是,MS結果顯示circPDE4B也結合了兩個E3連接酶,包括RNF2和MID1。然而,由于RNF2定位于細胞核內,我們選擇MID1進行進一步研究。實際上,通過免疫沉淀分析,MID1被發現與RIC8A結合(圖4A)。RIC8A和MID1的免疫熒光染色也證實了它們在HCs***定位(圖4B)。IP結果表明,MID1敲低有效地削弱了RIC8A和MID1過表達的泛素化作用,增加了RIC8A泛素化作用(圖4C)。Co-IP實驗也顯示,與對照組相比,circPDE4B敲低細胞中RIC8A和MID1的結合減少,而過表達circPDE4B則有相反的作用(圖4D)。
鼻咽*通路此前尚未被認為與創傷介導的神經退行性變有關,但據報道,在ALS/FTD、AD、HD和其他神經退行性疾病中,鼻咽*通路被破壞。因此,我們決定進一步研究鼻咽*改變介導TDP-43在TBI中的病理變化。蛋白質組學分析顯示,一些Nups在腦損傷時被上調(圖1D和E)。對這些Nups的定量逆轉錄酶聚合酶鏈反應(qRT-PCR)分析證實,TBI***上調Nup93-2、Nup54、Nup62、Nup44A,和Nup214 mRNA水平的果蠅幼蟲(圖1F I和圖1圖Supplement 1G)和成年大腦(圖1J L)。此外,核輸出基因Emb (Exportin)的mRNA水平在tbi后***增加(圖1M),而與對照組相比,微管相關蛋白Futsch的mRNA水平沒有變化(圖1圖Supplement 1H),這與蛋白質組學分析一致。Western blotting進一步證實了tbi依賴性的果蠅幼蟲腦內Nup214蛋白水平的升高(圖1N和O)。Western blot分析了損傷后幼蟲(0、2、4和6小時)和成蟲(0、2、4、24和72小時)的時間過程,以評估Nup214蛋白的水平。在檢測的時間點上,不管是幼蟲還是成人的大腦中,Nup214蛋白的水平都是上調的(圖1P,Q,R,S),這表明創傷可能會破壞Nup214的水平和體內的轉換。尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。
2)下調MIR210HG可抑制子宮內膜*細胞的增殖、遷移和侵襲
我們研究了MIR210HG在子宮內膜*細胞中的生物學功能。我們發現MIR210HG的下調有效地降低了Ishikawa和HEC-1A細胞的增殖(圖2A和2B)。采用創面愈合實驗和Transwell實驗研究MIR210HG對**遷移和侵襲的影響。與sh陰性對照組(NC)相比,轉染sh-MIR210HG的細胞遷移和侵襲減少(圖2C和2D)。流式細胞術分析細胞周期分布(圖2E)。以上結果提示MIR210HG在子宮內膜*中起致*基因的作用。
3)MIR210HG可能參與了由lncRNA-miRNA-mRNA調控網絡介導的子宮內膜惡性生物學行為
利用TCGA數據集對子宮內膜*樣本進行基因**富集分析,探索MIR210HG參與調控子宮內膜*的生物學通路。MIR210HG的表達與TGF-b和Wnt通路***相關,而Smad3基因在這些關聯中發揮了重要作用(圖3A)。搜索工具STRING的分析也顯示SMAD3和HMGA2是強相關的(圖3B)。我們探究HMGA2是否為MIR210HG的下游基因,發現MIR210HG下調后HMGA2蛋白表達水平降低。相反,當MIR210HG高表達時,HMGA2的表達***增加(圖3C)。這表明MIR210HG可能通過上調HMGA2的表達來促進子宮內膜*細胞的惡性生物學行為。 發現乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。成都神經肌肉科研
m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。淋巴水腫鼠模型科研國家自然科學基金
表觀基因組學 (ChIP-Seq) 模塊
ChIP-seq 模塊目前包含大量染色質免疫沉淀測序 (ChIP-seq) 數據,反映了特定的衰老相關基因座是如何受組蛋白修飾和轉錄因子調節的。這些數據有助于闡明調控因素如何在全基因組范圍內影響衰老過程中的基因表達。ChIP-seq 數據來自已發表的與衰老相關的文章,并使用相同的分析方法處理原始數據以保持一致性。直觀地顯示了衰老過程中特定基因組位點不同轉錄因子的富集或組蛋白修飾的變化。
蛋白質組學(蛋白質-蛋白質相互作用)模塊
衰老過程中蛋白質穩態受損是典型的,蛋白質相互作用隨著年齡的增長而發生顯著變化。蛋白質-蛋白質相互作用模塊(PPI)旨在允許查詢感興趣的蛋白質及其與衰老相關的相互作用蛋白。結果以兩種方式呈現:交互式表格和網絡圖。前者提供了更詳細的信息,包括相互作用蛋白的數量、細胞/組織類型和支持相互作用的出版物;后者允許蛋白質相互作用網絡的可視化,并提供使用在線工具對選定數據執行基因本體或 KEGG 通路分析的選項。因此,PPI 將成為分析細胞衰老過程中關鍵蛋白質相互作用的有用模塊,從而可以在蛋白質水平上更好地了解人類衰老。 淋巴水腫鼠模型科研國家自然科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗