上海細胞凋亡基因芯片科研

來源: 發布時間:2021-10-24

質膜塑造并保護真核細胞免受周圍環境的影響,對細胞生命至關重要。盡管重新密封受損膜的初始修復機制已經很好地建立,但關于細胞如何在重建受損膜后恢復體內平衡知之甚少。今年7月發表于《SCIENCE ADVANCES》的一篇研究表明,細胞通過***與巨胞飲作用相關的蛋白質來響應質膜損傷,特別是在受損的膜上。在膜重新密封之后,細胞形成源自修復部位的、LC3B蛋白陽性的胞吞小體。此過程**于 ULK1、ATG13 和 WIPI2,但依賴于 ATG7、p62 和 Rubicon。內化的胞吞小體在細胞質中收縮,可能是通過滲透排出,并**終與溶酶體融合。這是一種與非經典自噬相結合的巨胞飲作用,研究者將其稱為 LC3 相關巨胞飲作用 (LAM),其功能是從質膜上去除受損物質并在損傷時恢復膜的完整性。接下來我們來看一下具體研究方法及結果:發現乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。上海細胞凋亡基因芯片科研

為了確定METTL3誘導的APC表達下調在小鼠**生長中的作用,將KYSE180細胞皮下注射到裸鼠體內。發現通過APC去除,METTL3去除使**大小、體積和重量減小,并且**組織中的乳酸量恢復。此外,IHC染色顯示,METTL3缺失增加AP的表達,相應地減少了**組織中β-連環蛋白、cyclind1、c-Myc和PKM2的表達。這些結果表明METTL3抑制APC的表達可以促進**的發展。

APC表達下調與食管鱗*標本METTL3上調及食管鱗*患者預后不良相關

為了確定METTL3抑制APC表達的臨床相關性,分析TCGA數據, APC mRNA表達與ESCC中METTL3 mRNA表達呈負相關。發現與正常組織相比,ESCC標本中APC的表達***下調。81例ESCC標本的IHC染色觀察到METTL3蛋白表達與APC蛋白表達呈負相關,METTL3蛋白表達與β-連環蛋白表達呈正相關。此外,APC的高表達與ESCC患者的長期總生存時間***相關。這些結果提示APC表達下調與METTL3表達上調及ESCC患者預后不良相關。 血清/血漿芯片科研國家自然科學基金外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化促進CRC肝轉移。

6.ELNAT1通過UBC9誘導的hnRNPA1的SUMOylation被封裝到EVs中

UBC9可以催化靶蛋白的SUMOylation來調節它們與生物分子的相互作用和細胞運輸。Figure6A顯示,通過co-IP分析,觀察到一個明顯的15~25kDa條帶被hnRNPA1特異性富集。此外,IP分析顯示UBC9過表達增強了hnRNPA1的SUMO2連接,表明UBC9誘導hnRNPA1的SUMOylation(Figure6B)。將hnRNPA1中SUMOylation修飾的位點賴氨酸3(K3)和賴氨酸113(K113)用精氨酸替代(Figure6C),并通過co-IP分析表明,證明了hnRNPA1中SUMOylation修飾的位點是K113(Figure6D)。ELNAT1過表達上調了hnRNPA1K113的SUMO化,而敲除UBC9則消除了這個影響(Figure6E)。

circNDUFB2過表后IGF2BPs的mRNA無***變化,蛋白質水平***降低。此外,circNDUFB2突變體不影響IGF2BPs的蛋白質水平。因此推測circNDUFB2可能通過相互作用使IGF2BP蛋白失穩。發現circNDUFB2的過度表達***降低了IGF2BP蛋白的水平,這可以通過MG132(蛋白酶抑制劑)恢復。circNDUFB2***增加了IGF2BPs的泛素化水平,但這種作用因其突變而受損。這些結果表明circNDUFB2通過促進泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩定性。

TRIM25是介導IGF2BP泛素化的E3連接酶 Caspase-11介導的肝細胞焦亡促進非酒精性脂肪性肝炎的進展。

巨噬細胞中PI3K-AKT***促進ADM期后炎癥消退

基于RNA-seq數據,PI3K-AKT信號在ADM期間在巨噬細胞中顯著富集。當觀察PI3K-AKT通路中這些升高的基因時,發現80%的基因與細胞外基質(ECM)-受體相互作用、生長因子/細胞因子-受體相互作用有關,表明它們參與了巨噬細胞與相鄰細胞之間的串擾。同時,在第3天在CD11b+F4/80+CD206+胰腺巨噬細胞中觀察到更高的AKT***。在ADM階段抑制巨噬細胞的PI3K-AKT***時,胰腺修復/再生明顯受到阻礙。通過流式細胞術分析,我們發現胰腺中M2樣巨噬細胞(CD11b+F4/80+CD206+)的數量變化較小,而未成熟巨噬細胞(CD11b+F4/80mid)、炎性單核細胞(CD11b+Ly6Chi)和中性粒細胞(CD11b+Ly6G+)顯著升高。總之,阻斷胰腺巨噬細胞中的PI3K-AKT信號將觸發促炎反應和組織損傷,表明這些巨噬細胞在ADM階段(第3天)具有***或促消退表型。 為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機制。小分子非編碼RNA 科研分子生物學實驗

英拜的實驗室坐落在上海漕河涇園區浦江園區。上海細胞凋亡基因芯片科研

我們已經進行了snATAC-seq和snRNA-seq來研究染色質可及性如何改善我們對成熟人類腎臟中細胞狀態和功能的理解。我們生成了一個包含轉錄組和表觀基因組數據的交互式多模態圖譜。結合snRNA-seq和snATAC-seq分析提高了檢測近端小管和厚升肢內獨特細胞狀態的能力,并重新定義了可能有助于腎臟再生和細胞特異性離子通透性的細胞異質性。

一、人類成年腎臟的單細胞轉錄和染色質可及性分析

1)成人腎臟中的單細胞轉錄和染色質可及性分析

snRNA-seq基于譜系特異性標記的表達(圖1c,補充圖1b),鑒定了腎皮質內所有主要細胞類型(圖1b,補充圖1a)。檢測了近端小管(PT)、壁上皮細胞(PEC)、粗升肢(TAL)、遠端小管(DCT1、DCT2)、連接小管(CNT)、**管(PC、ICA、ICB)、內皮細胞(ENDO)、腎小球細胞類型(MES、PODO)、成纖維細胞(FIB)和少量白細胞(LEUK)(補充表2、補充數據1)。值得注意的是,近端小管亞群中VCAM1表達增加(PT_VCAM1)。該亞群還表達了HAVCR1,這是一種急性損傷后近端小管上調的基因,是長期腎臟預后的預測因子。 上海細胞凋亡基因芯片科研

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

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6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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