GSEA和GO分析顯示,HOXBLINC的缺失會影響NPM1突變、HOXA9通路、**、細胞周期、細胞命運、髓樣細胞分化以及Wnt和JAK-STAT信號通路中涉及AML的通路和基因(圖1e-f)。此外,與對照組相比,HOXBLINC KD***抑制OCI-AML3細胞增殖(圖1g)。當把Dox誘導的HOXBLINC KD OCI-AML3克隆移植到NOD-scid IL2Rγnull (NSG)小鼠,然后進行Dox誘導或對照處理時,與未接受Dox處理的小鼠相比,Dox處理的受體小鼠的生存期***延長(圖1h)。并且HOXBLINC KD***增加了小鼠預后,以及**病理改變(圖1i-j)。因此,HOXBLINCKD降低了**負擔,并減弱了體內白血病進展,這可能是NPM1c+ AML患者的特異性。circSDHC通過充當miR-127-3p的海綿促進ccRCC的進展和轉移.Caspase-11標書地區科學基金
接著,我們利用NMR進一步研究了FTO和SsD之間的相互作用,在滴定過程中觀察到信號的劑量依賴性衰減(圖3E)。這些結果表明,FTO干擾了SsD的狀態。接下來,我們使用LC-MS/MS定量分析了細胞對SsD的攝取(圖3F)。在NB4和Kas-1細胞中,SsD在0.05-0.14 nmol/百萬細胞中檢測到。HPLC顯示SsD對體外FTO去甲基化的抑制活性(圖3G)。此外,在無細胞系統中,斑點印跡試驗證實了SsD介導的FTO活性競爭性抑制(圖3H)。綜上所述, FTO是SsD的直接靶點,可能是SsD誘導的白血病細胞生長抑制作用的主要介質。深圳VEGF標書脊髓損傷(Spinal cord injury, SCI)患者表現出腸道菌群紊亂而腸道失調加重SCI模型中的神經損傷。
其次,采用UPGMA、PCoA和NMDS評估不同群體的腸道菌群β-多樣性。UPGMA聚類方法將對照組和PCOS大鼠樣本分為兩組,表明PCOS大鼠和對照組的腸道微生物分布不同。雖然DHEA + tempol組不能完全與DHEA + PBS組分離,但與DHEA + PBS組有所不同,說明給藥tempol影響了PCOS大鼠的腸道微生物分布(圖4G)。PCoA和NMDS分析進一步顯示,三組大鼠腸道總體微生物組成不同(圖4H-I),而Permanova/ Anosim分析表明,三組間差異***(圖4J)。上述結果表明,DHEA和tempol處理可影響腸道微生物的β-多樣性。
6)Pex衍生的CD44v6和C1QBP的高表達預示著PDAC患者的肝轉移和低生存率采用免疫組化和westernblot檢測肝轉移灶周圍肝組織和正常肝組織的纖維化ECM微環境。與體內實驗一致,纖維連接蛋白、I型膠原和α-SMA水平***升高,而玻連蛋白和固生蛋白C水平下調(圖7A,B)。接下來,我們研究了外泌體衍生CD44v6和C1QBP在PDAC患者中的預后價值。外泌體CD44v6和C1QBP在PDAC組織中的表達明顯高于正常胰腺組織(圖7C)。此外,有肝轉移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉移的PDAC患者(圖7C)。免疫電鏡顯示,CD44v6和C1QBP在PDAC組織來源的EVs***表達(圖7D)。Pex中CD44v6和C1QBP高表達的患者比其他患者更容易發生肝轉移(圖7E)。采用非靶向代謝組學方法測量三組血清代謝產物?
6)沉默MIR210HG可以通過miR-337-3p/137-HMGA2軸阻斷TGF-b和Wnt信號通路之前的GSEA表明MIR210HG與TGFb/Smad3和Wnt/b-catenin信號通路相關。為了進一步研究MIR210HG調控子宮內膜*細胞進展的機制,我們檢測了MIR210HG、HMGA2、miR-337-3p和miR-137對TGF-b、Wnt和EMT通路相關蛋白水平的調控作用。MIR210HG的下調降低了TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達以及b-catenin在細胞核中的分布(圖6A和6B)。基于這些結果,我們推測MIR210HG可能通過靶向miR-3373p/137-HMGA2調控軸抑制EMT、TGF-b和Wnt信號通路。干擾HMGA2***降低TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達,b-catenin在細胞核中的分布(圖6C和6D)。我們之前曾報道過HMGA2在Ishikawa和HEC-1A細胞系中調節Snail、Slug、N-cadherin、MMP-2和MMP-9的表達。我們接下來研究了miR-337-3p/137表達的誘導是否影響TGF-b、Wnt和EMT通路相關蛋白的水平。DHEA處理的大鼠給予200 mg/kg水蘇糖12天.北京甘油三酯標書
FMT處理可以改善SCI小鼠的體重增加和代謝狀況。Caspase-11標書地區科學基金
一、YTHDF1在胃*中的過表達
通過評估YTHDF1突變的分布,我們發現65%的突變是基因擴增,這通常會導致基因產物的過表達(圖1A).通過對TCGA數據集進行分析,發現YTHDF1在胃*患者中的表達確實明顯高于正常組織(圖1B)。YTHDF1的高表達與胃*進展(圖1C)和較差的總生存期(圖1D)相關。對正常胃組織和胃*標本進行免疫組化分析,證實**組織中YTHDF1蛋白表達上調(圖1F)。此外,YTHDF1在胃*患者中的異常高表達與更嚴重的臨床病理特征(如神經周圍侵犯、侵襲性**分期(III/IV期vs.I/II期)、靜脈侵犯等***相關(圖1G)。KaplanMeier生存分析也顯示,YTHDF1高表達的胃*患者4年總生存期較差。綜上所述,YTHDF1在胃*發生中具有潛在的致瘤作用。 Caspase-11標書地區科學基金
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
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6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗