5、hUC-MSCs調節(jié)MRL/lpr小鼠脾CD4+T細胞Sirt1/p53信號通過miR-199a-5p
文獻報道在**和自身免疫疾病中，hUC-MSCs能夠將miRNAs轉移到周圍的細胞。因此，作者考慮miRNAs是否可能參與hUC-MSCs介導的對脾CD4+T細胞中Sirt1的表達調控。使用在線軟件Targetscan識別了10個miRNA，這些miRNA被預測靶向Sirt1。qPCR分析顯示，在這10個miRNAs中，只有miR-199a-5p的表達在MRL/lpr脾CD4+T細胞中***降低(圖5A)。此外，miR-199a-5p是hUC-MSCs處理后***表達增加的miRNA(圖5A)。事實上，miR-199a-5pmimic不僅可以提高MRL/lpr脾CD4+T細胞中miR-199a-5p的水平，降低Sirt1的表達(圖5B-C)，而且還可以提高衰老標志物p21、p16和乙酰化p53的表達水平(圖5D)。 英拜生物對整體實驗實施的全局把控。細胞凋亡基因芯片
3.構建微生物群共發(fā)生網絡并進行聚類分析
使用SparCC算法構建差異ASV共發(fā)生網絡。
分析并比較了腺瘤和對照組中生物標志物的模式，將它們進一步組裝成具有不同分類學組成的四個簇。這些簇與患者的年齡，性別和BMI等特征沒有緊密聯系。此外，還探討了CRC患者腸道菌群在24種生物標記物組中的共發(fā)生網絡，并產生了三個簇。聚類1的細小螺旋藻科物種被分配的ASV**少，而聚類2在分類學上是異質的，在CRC個體中患病率較高。
4.結腸*、腺瘤分類模型的驗證
結果表明，微生物來源的生物標志物組在檢測大腸腺瘤方面優(yōu)于FIT，并且它們的組合可以提高非侵入性腺瘤診斷的準確性。
5.在**隊列中驗證結直腸腺瘤標志物
本研究納入了另外兩個來自美國（驗證組1）和中國（驗證組2）的**隊列。驗證隊列1由70名對照和102例腺瘤患者組成，而驗證隊列2中有57例腺瘤患者和52例CRC患者。 神經退行性疾病英拜生物致力于分子生物行業(yè)十余年。
通過在晚期核內體上產生PI(3)P, INPP4B通過Hrs促進晚期核內體的形成。***的shrna介導的Hrs耗散(補充圖6a, b)導致gfp載體細胞中cd63陽性晚期核內體減少，并將GFPINPP4B細胞中晚期核內體形成增加的水平逆轉為gfp載體控制水平(圖5a, b)。在非錨定細胞生長試驗中，耗用Hrs shRNA對gfp載體軟瓊脂集落的大小沒有影響，但減少了GFP-INPP4B細胞集落的大小，這與Hrs依賴的細胞增殖一致(圖5c, d)。將MCF-7細胞注射到雌性BALB/c裸小鼠腹股溝第四乳腺脂肪墊中，在體內檢測**生長的hrs依賴性。與GFPvector相比，GFP-INPP4B在體內**體積和體外**重量***增加(3倍)(圖5e g)。雖然敲除Hrs沒有影響gfp載體**的大小和重量，但GFP-INPP4B**的增強生長被減少Hrs抑制(圖5e g)，表明INPP4B促進pik3a突變ER+乳腺*細胞的增殖和**生長以hrsdependence的方式。
TRIM25的RNA結合活性對于其對底物的泛素連接酶活性是必需的。構建了一個帶有FLAG標記RNA結合域（RBD）缺失突變體。TRIM25ΔRBD不影響IGF2BPs的蛋白質水平，對IGF2BPs的泛素化水平沒有明顯影響，表明TRIM25完整的RBD對于IGF2BPs的有效泛素化和降解是必要的。這些結果表明，TRIM25通過泛素-蛋白酶體途徑促進NSCLC細胞中IGF2BPs的降解，并且TRIM25的RNA結合活性對其在底物泛素化中的作用至關重要。
已經顯示，TRIM25使用RNA作為其靶標有效泛素化的支架。然后，探討了TRIM25對IGF2BPs的泛素連接酶活性是否取決于circNDUFB2的存在。 circNDUFB2的丟失顯示了TRIM25對IGF2BPs泛素化和降解的顯著減弱作用。進一步驗證實驗數據并檢查circNDUFB2是否充當支架來增強TRIM25與IGF2BP的結合，進行了Co-IP分析。在帶有circNDUFB2但沒有circNDUFB2-MUT過表達的A549細胞中，TRIM25和IGF2BP之間的關聯得到增強。由于circNDUFB2對RNA核酸外切酶的抗性，使用RNase A***會嚴重破壞相互作用。此外，在METTL3 / 14敲低后，IGF2BP的泛素化作用顯著降低。結果表明，circNDUFB2充當支架，以增強TRIM25和IGF2BPs之間的相互作用，隨后促進TRIM25介導的IGF2BPs泛素化和降解。 按照實驗設計路線和實驗結果進行文章的構思與潤色。
表觀基因組學 (ChIP-Seq) 模塊
ChIP-seq 模塊目前包含大量染色質免疫沉淀測序 (ChIP-seq) 數據，反映了特定的衰老相關基因座是如何受組蛋白修飾和轉錄因子調節(jié)的。這些數據有助于闡明調控因素如何在全基因組范圍內影響衰老過程中的基因表達。ChIP-seq 數據來自已發(fā)表的與衰老相關的文章，并使用相同的分析方法處理原始數據以保持一致性。直觀地顯示了衰老過程中特定基因組位點不同轉錄因子的富集或組蛋白修飾的變化。
蛋白質組學（蛋白質-蛋白質相互作用）模塊
衰老過程中蛋白質穩(wěn)態(tài)受損是典型的，蛋白質相互作用隨著年齡的增長而發(fā)生顯著變化。蛋白質-蛋白質相互作用模塊（PPI）旨在允許查詢感興趣的蛋白質及其與衰老相關的相互作用蛋白。結果以兩種方式呈現：交互式表格和網絡圖。前者提供了更詳細的信息，包括相互作用蛋白的數量、細胞/組織類型和支持相互作用的出版物；后者允許蛋白質相互作用網絡的可視化，并提供使用在線工具對選定數據執(zhí)行基因本體或 KEGG 通路分析的選項。因此，PPI 將成為分析細胞衰老過程中關鍵蛋白質相互作用的有用模塊，從而可以在蛋白質水平上更好地了解人類衰老。 表達PTEN- 398A的細胞中上調的基因與G1/S檢查點的***有關。細胞凋亡基因芯片
TRF測序課題整體服務。細胞凋亡基因芯片
PTEN表達檢測的總有效率約為70%，而PTEN表達陰性患者的總有效率*為20%。PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩(wěn)定性有關。此外，小鼠胚胎成纖維細胞(mef)中PTEN基因的缺失導致了未修復的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認為通過至少兩種分子機制促進了基因組的完整性。在細胞核中，PTEN與著絲粒結合蛋白CENP-C結合，促進著絲粒組裝和中期到后期的轉變。此外，作為轉錄因子E2F1的輔助因子，核PTEN似乎調節(jié)Rad51的表達，Rad51是DNA修復機制的關鍵組成部分。然而，后續(xù)的研究得出了不一致的結果，表明PTEN在轉錄水平上對RAD51的調控可能***于特定的細胞環(huán)境。PTEN缺陷改變了多個細胞周期檢查點，可能留下更少的時間進行DNA損傷修復和/或染色體分離。細胞周期的進展需要幾個分子過程的完美執(zhí)行，以確保一個熟練的，無錯誤的，細胞分裂。這些事件發(fā)生的速度由周期蛋白依賴激酶(CDKs)的活性決定，CDKs磷酸化關鍵底物以促進DNA合成和有絲分裂進程細胞凋亡基因芯片
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗