2021年6月，在Oncogene雜志上發(fā)表了文章“Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells..”。此報(bào)道通過(guò)運(yùn)用了一種強(qiáng)大的染色質(zhì)導(dǎo)向蛋白質(zhì)組學(xué)方法，稱為ChIP-SICAP，揭示去勢(shì)抗性前列腺*(CRPC)細(xì)胞中內(nèi)源性AR周圍染色質(zhì)蛋白網(wǎng)絡(luò)(染色質(zhì)蛋白網(wǎng)絡(luò))的組成。在CRPC細(xì)胞雄***信號(hào)通路的背景下，進(jìn)一步研究了與AR相關(guān)蛋白作用的染色質(zhì)重塑者SMARCA4和SIM2。通過(guò)整合ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq和功能實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)，揭示SMARCA4和AR在染色質(zhì)上***共存，SMARCA4缺失影響了一組AR靶基因的染色質(zhì)可及性和表達(dá)，也抑制了CRPC細(xì)胞的生長(zhǎng)，驗(yàn)證了SMARCA4在CRPC細(xì)胞中的功能。雖然SIM2的沉默同樣降低了染色質(zhì)的可及性，但它影響了更多的雄***調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。在雞胚絨膜尿囊膜實(shí)驗(yàn)中，SIM2沉默也降低了CRPC細(xì)胞的增殖和**的大小。總之，此研究鑒定的AR染色體是研究這一重要藥物靶點(diǎn)的重要資源。提供生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的課題思路設(shè)計(jì)。同源異形盒
QKI促進(jìn)NSCLC細(xì)胞中circNDUFB2的生物發(fā)生
circNDUFB2和NDUFB2均來(lái)自NDUFB2 pre-mRNA，而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調(diào)。因此，推測(cè)circNDUFB2的下調(diào)在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生。我們?cè)赾ircNDUFB2中搜索與潛在QRE匹配的序列。接下來(lái)進(jìn)行了RIP分析，確認(rèn)QKI確實(shí)與NDUFB2 pre-mRNA中的假定QRE結(jié)合。在NSCLC細(xì)胞中QKI過(guò)表達(dá)可能會(huì)上調(diào)circNDUFB2。 這些數(shù)據(jù)表明，QKI與NDUFB2 pre-mRNA的circNDUFB2形成外顯子側(cè)翼的內(nèi)含子結(jié)合，從而促進(jìn)circNDUFB2的形成。 上皮細(xì)胞TIMEOR用于推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。
然后，我們?cè)贖460和H1299細(xì)胞中測(cè)量了USP35敲除和TKI之間的協(xié)同效應(yīng)，數(shù)據(jù)表明USP35沉默在體內(nèi)和體外使H460和H1299細(xì)胞對(duì)GFB化療敏感(圖9F-H)。值得注意的是，EGFR突變的肺*細(xì)胞對(duì)TKI更敏感，因此我們?cè)u(píng)估了USP35沉默是否會(huì)使H1650細(xì)胞對(duì)GFB化療敏感。如圖9I，J所示，USP35沉默進(jìn)一步抑制了GFB***后H1650細(xì)胞的生長(zhǎng)、集落形成和**進(jìn)展。總的來(lái)說(shuō)，USP35缺乏的肺*細(xì)胞對(duì)化療藥物更敏感。
結(jié)論：FPN蛋白穩(wěn)定性和肺*細(xì)胞的鐵輸出需要USP35，從而保持細(xì)胞內(nèi)鐵穩(wěn)態(tài)和**生長(zhǎng)。而USP35敲除通過(guò)減少游離鐵輸出增加細(xì)胞內(nèi)LIP水平和鐵死亡，并伴隨著肺*細(xì)胞生長(zhǎng)、定殖和**形成的減少，以及對(duì)DDP和PTX化學(xué)敏感性的增加。因此USP35是一個(gè)很有前途的肺****靶點(diǎn)。
2021年6月，***一篇發(fā)表在Curr Biol（IF=9.601）的文章（The RAS GTPase RIT1 compromises mitotic fidelity through spindle assembly checkpoint suppression.）從共生功能體視點(diǎn)的角度對(duì)29名接受同種異體造血干細(xì)胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進(jìn)行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了RIT1直接與SAC**組件MAD2和p31conmet相互作用；CDK1在有絲分裂過(guò)程中磷酸化RIT1并抑制其與SAC的相互作用；RIT1是細(xì)胞有絲分裂及時(shí)進(jìn)展所必需的；RIT1致病水平促進(jìn)染色體分離錯(cuò)誤。caspase-3抗體是一種***用于檢測(cè)凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。
5、CDK4/6預(yù)處理增強(qiáng)CAR-T細(xì)胞的持久性和有效性
接下來(lái)測(cè)試CDK4/6i處理是否會(huì)誘導(dǎo)嵌合抗原受體(CAR)-T細(xì)胞的記憶表型，并克服CAR-T細(xì)胞***成功的兩大障礙：T細(xì)胞耗竭和缺乏持久性。通過(guò)臨床試驗(yàn)，以LewisY(LeY)抗原為靶點(diǎn)，制造了人類CAR-T細(xì)胞(Fig.5A)并發(fā)現(xiàn)暴露于CDK4/6i產(chǎn)生CD4+和CD8+干細(xì)胞記憶（Tscm）CAR-T細(xì)胞(Fig.5B)。CAR-T細(xì)胞的3’RNA-seq揭示CDK4/6抑制后記憶表達(dá)***改變，GSEA分析證實(shí)了記憶相對(duì)效應(yīng)信號(hào)的富集，并如預(yù)期E2F靶基因下調(diào)(Fig.5C)。為了檢測(cè)在體內(nèi)的持久性，使用兩個(gè)**供體的PBMC生成的LeYCAR-T細(xì)胞用CDK4/6i預(yù)處理，并轉(zhuǎn)移到NSG小鼠中(Fig.5D)。與未經(jīng)處理的對(duì)照組相比，觀察到在移植后的幾周內(nèi)，血液中CD8+和CD4+預(yù)處理的CAR-T細(xì)胞的頻率和數(shù)量***增加(Fig.5E-F)。 動(dòng)物建模模型實(shí)驗(yàn)的整體服務(wù)。丁酸
生命科學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的精細(xì)研究。同源異形盒
LncExpDB提供101293個(gè)人類lncRNA基因（對(duì)應(yīng)于331244個(gè)轉(zhuǎn)錄本）***且高質(zhì)量的**。它包含了這些lncRNA在337個(gè)生物學(xué)條件下的豐富表達(dá)譜，這些條件屬于九個(gè)重要的生物學(xué)背景，涉及正常組織/細(xì)胞系、*細(xì)胞系、亞細(xì)胞定位、外泌體、細(xì)胞分化、植入前胚胎、***發(fā)育、晝夜節(jié)律和病毒***.此外，LncExpDB識(shí)別了25191個(gè)特征lncRNA基因，并表征了24508個(gè)lncRNA基因和17345個(gè)mRNA基因之間的28443865個(gè)共表達(dá)相互作用。
基于跨多個(gè)生物環(huán)境的綜合表達(dá)譜，LncExpDB具有增值管理和分析功能，可提供可靠轉(zhuǎn)錄的lncRNA基因。因此，我們發(fā)現(xiàn)92016個(gè)lncRNA基因（90.8%）得到可靠轉(zhuǎn)錄證據(jù)的支持（表達(dá)值閾值為1TPM），在九個(gè)生物學(xué)背景中分布不均。在可靠轉(zhuǎn)錄的基因中，大多數(shù)(82.6%)在至少兩種生物環(huán)境中表達(dá)，3318個(gè)lncRNAs(3.6%)在所有9種環(huán)境中表達(dá)。 同源異形盒
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)