1）NOX4水平在阿爾茨海默病患者皮質區受損星形膠質細胞中升高
為了探討NOX4在AD患者星形膠質細胞損傷中的作用，我們分析了AD患者大腦皮質星形膠質細胞中NOX4蛋白水平是否升高。我們采用免疫熒光染色法檢測AD患者或非AD供者(正常)顳葉皮質組織GFAP陽性星形膠質細胞中的NOX4蛋白水平(圖1A和B)。免疫熒光染色顯示AD患者皮質區分子層GFAP陽性星形膠質細胞中NOX4陽性染色強度相對于非AD供者增加(圖1A)。此外，AD患者皮質區ML中受損的GFAP陽性星形膠質細胞中的NOX4陽性染色強度高于非AD供者(圖1A和B)。值得注意的是，AD患者中NOX4與GFAP亞細胞共定位陽性的受損星形膠質細胞數量***增加(圖1C)。與非AD供者相比，每一位AD患者的NOX4水平普遍較高。這些結果提示，AD患者星形膠質細胞受損時NOX4蛋白水平升高。 可以推斷基因調控事件之間的關系。過氧化物
2、MAO-A直接調節TAM極化并影響TAM相關的T細胞抗**活性
為了確定MAO-A是否直接調節免疫細胞，進行一個骨髓（BM）轉移實驗，從MaoaWT或KO小鼠中獲得的BM細胞被連續轉移到BoyJ(CD45.1)WT受體小鼠中，然后該小鼠接受B16-OVA黑色素瘤細胞接種（圖2a）。在本實驗中，MAO-A缺乏的比較***于免疫細胞。結果顯示免疫細胞中MAO-A缺陷導致**生長抑制（圖2b-c），改變TAM極化（圖2d-f），增強**浸潤CD8+T細胞***，表明MAO-A直接調節免疫細胞抗**活性，特別是TAM極化和T細胞抗**反應。 過氧化物促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。
6、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化促進CRLM
將弱轉移的CRC細胞系SW480和RKO與miR-934mimics預處理的THP-1細胞的CM共培養。結果顯示，無論是體內還是體外，侵襲和轉移能力都隨著miR-934mimics外泌體處理而升高，隨著anti-miR-934外泌體處理而下降（Fig.6c–g）。這些結果表明，CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化可以增強CRC細胞的侵襲和肝轉移能力。
7、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化，通過***CRC細胞中的CXCL13/CXCR5軸促進CRLM
用HCT-8細胞來源的外泌體與陰性對照處理或PMA預處理的THP-1細胞孵育，分析趨化因子水平。如Fig.7a所示，CXCL13、IL-10和CCL22的表達水平遠遠高于其他趨化因子的水平。然后，PMA-pretreatedTHP-1細胞轉染miR-934mimics或NC，ELISA表明CXCL13的表達***增加(大約10倍)而CCL22和IL-10(二至三倍)，這表明CXCL13可能在CRLM的進展扮演了一個重要的角色（Fig.7b）。此外，結果顯示，過表達miR-934或下調miR-934可部分增強或減弱HT29/HCT8細胞來源外泌體對M2巨噬細胞分泌CXCL13的增強作用（Fig.7c）。
作者進行了PAR-CLIP實驗，以評估SLC7A11 mRNA-YTHDC2相互作用是否依賴于m6A甲基化。結果表明，在H1299細胞中，通過過表達METTL3來提高m6A的甲基化水平，促進YTHDC2與SLC7A11 mRNA的結合(圖6D)。無論METTL3是否過表達，YTH結構域的缺失都阻斷了SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用(圖6D)。作者通過SLC7A11 3’-UTR探針進行RNA-pull down實驗，發現YTHDC2WT，優先結合于含有m6A的SLC7A11 mRNA的3'UTR，而不是含有未甲基化腺苷的mRNA(圖6E)。此外，YTHDC2傾向于結合m6A共識基元GGAC (圖6E)。通過在H1299和H1975細胞中進行METTL3的功能增加和丟失實驗，發現細胞內SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用是由m6A水平決定的(圖6F和G)。這些數據表明YTHDC2優先與m6A甲基化的SLC7A11 mRNA結合。使用motif和CHIP-seq預測影響基因簇表達的轉錄因子。
二、偽時間軌跡，染色質可及性和基因表達分析揭示Flow-Dependent內皮細胞重新編程
我們的分析明確了3種主要的分化細胞類型:(1)ec，(2)免疫細胞(巨噬細胞，樹突狀細胞和T細胞)，以及(3)SMCs和纖維細胞(圖3A)。此外，在每一細胞類型走向的軌跡路徑上，還有許多其他細胞出現，表明它們響應d-flow的過渡性去分化狀態。為了更好地理解軌跡結果，我們將分析分為四種實驗條件(圖3B)。在s-flow條件下(2D-R和2W-R)，大部分細胞分化良好，少數細胞處于過渡狀態。相反，d-flow條件誘導許多ec進入過渡狀態，潛在地向smc和纖維轉化分化，表明EndMT。令人驚訝的是，我們還發現許多ec在急性d-flow條件下(2D-L)向免疫細胞轉移，在慢性d-flow條件下(2W-L)進一步增加。 進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應。過氧化物
caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細胞的標志物。過氧化物
對snATAC-seq數據集使用97%置信閾值對細胞類型分配進行過濾，以去除異型雙重體。通過標簽轉移獲得的snATAC-seq細胞類型預測(圖1d)與無監督簇的編輯注釋(圖1e, f)的比較表明，所有主要的細胞類型都存在于這兩個數據集中，并且在檢測和分配細胞身份方面，snATAC-seq與snRNA-seq具有可比性(補充圖3)。使用基于基因活性的細胞類型分配進行下游分析，這是通過對snatc -seq數據集的無監督聚類獲得的。有趣的是，snATAC-seq能夠檢測到近端小管簇內的兩個亞群，這可能**近端曲小管(圖1e, PCT)和近端直小管(圖1e, PST)。PCT顯示編碼SGLT2的SLC5A2具有更強的染色質可及性;而PST在編碼SGLT1的SLC5A1(圖1f，補充圖4)中表現出更強的可達性。SGLT2在近端小管S1和S2段重新吸收葡萄糖，SGLT1位于S3。過氧化物
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