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來源: 發布時間:2021-10-26

對離體培養的Maoa野生型和KOBMMDs中ROS水平的測定也顯示,在IL-4/IL-13刺激或不刺激下,MaoaKOBMMDs中ROS水平降低,與體內TAM結果一致(圖4d)。向IL-4/IL-13刺激的MaoaWT和KOBMDMs補充H2O2可將其細胞內ROS水平提高到相似水平,并消除它們在免疫抑制標記物和特征基因表達的差異(圖4e-g)。另一方面,補充酪氨酸(MAO-A的底物)可增加ROS水平,并上調免疫抑制基因在MaoaWTBMDMs中的表達,但在MaoaKOBMDMs中不上調(圖4h-j)。綜上所述,這些數據表明MAO-A通過調節巨噬細胞內ROS水平來調節巨噬細胞的免疫抑制極化。將 CTD 暴露與 CTD 解剖學相結合使環境健康科學家能夠調查暴露研究和組織和系統暴露化學應激誘導表型的細節。廣東課題歡迎咨詢

作者進行了PAR-CLIP實驗,以評估SLC7A11 mRNA-YTHDC2相互作用是否依賴于m6A甲基化。結果表明,在H1299細胞中,通過過表達METTL3來提高m6A的甲基化水平,促進YTHDC2與SLC7A11 mRNA的結合(圖6D)。無論METTL3是否過表達,YTH結構域的缺失都阻斷了SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用(圖6D)。作者通過SLC7A11 3’-UTR探針進行RNA-pull down實驗,發現YTHDC2WT,優先結合于含有m6A的SLC7A11 mRNA的3'UTR,而不是含有未甲基化腺苷的mRNA(圖6E)。此外,YTHDC2傾向于結合m6A共識基元GGAC (圖6E)。通過在H1299和H1975細胞中進行METTL3的功能增加和丟失實驗,發現細胞內SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用是由m6A水平決定的(圖6F和G)。這些數據表明YTHDC2優先與m6A甲基化的SLC7A11 mRNA結合。天津課題動物模型構建高通量測序后續的機制實驗。

3)FTO是SsD的直接靶點

基于基因芯片數據,SsD介導的白血病發生抑制主要是由于m6A通路,我們假設SsD可能調節白血病m6ARNA甲基化。我們確定了FTO在白血病發生中起作用。為了驗證SsD與FTO的直接結合,我們首先基于已發表的FTO晶體結構進行分子對接分析。SsD的比較好結合位點表現出與底物結合位點互補的特殊形狀,占據了整個結合口袋(圖3A-B)。4個氨基酸殘基(R96,K216,E234,R332)參與了與SsD的相互作用(圖3C),在抑制FTO活性方面發揮了關鍵作用。在NB4和Kas-1AML細胞中,SsD與FTO蛋白的結合導致了明顯的熱轉移,表明對熱降解有保護作用(圖3D)。接著,我們利用NMR進一步研究了FTO和SsD之間的相互作用,在滴定過程中觀察到信號的劑量依賴性衰減(圖3E)。這些結果表明,FTO干擾了SsD的狀態。接下來,我們使用LC-MS/MS定量分析了細胞對SsD的攝取(圖3F)。在NB4和Kas-1細胞中,SsD在0.05-0.14nmol/百萬細胞中檢測到。HPLC顯示SsD對體外FTO去甲基化的抑制活性(圖3G)。此外,在無細胞系統中,斑點印跡試驗證實了SsD介導的FTO活性競爭性抑制(圖3H)。綜上所述,FTO是SsD的直接靶點,可能是SsD誘導的白血病細胞生長抑制作用的主要介質。

6)circPde4b和RIC8A影響小鼠OA發病機制

為了證實上述發現,我們進一步評估了circPde4b對小鼠OA的影響。圖6A為四組不同AAV***后circPde4b和RIC8A的RNA表達情況。從軟骨中提取的ECM相關蛋白的RT-qPCR和westernblot分析也提示在內側半月板不穩(DMM)+vector組和DMM+circPde4b+RIC8A組中OA更嚴重(圖6B,C)。SafraninOfastgreen染色(圖6D)發現,與SHAM+載體組和DMM+circPde4b+RIC8A組相比,DMM+載體組和DMM+circPde4b+RIC8A組的蛋白多糖明顯丟失,表明circPde4bAAV可以挽救由DMM引起的OA進展,而RIC8AAAV可以逆轉這種挽救。 英拜生物對實驗可行性分析。

2)阿爾茨海默病患者皮質區受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高

由于NOX4蛋白水平在AD患者受損星形膠質細胞中升高,我們研究NOX4在AD患者受損星形膠質細胞氧化應激中的作用。我們用免疫熒光染色法檢測了AD患者或非AD供者大腦顳葉皮質組織中GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE的蛋白水平(圖2A)。免疫熒光染色顯示,AD患者(AD)皮質區分子層GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE陽性染色強度相對于非AD供者增加(圖2A、B)。此外,AD患者皮質區ML中受損的GFAP陽性星形膠質細胞4-HNE陽性染色強度高于非AD供者(圖2A和B)。AD患者中4-HNE與GFAP亞細胞共定位陽性的受損星形膠質細胞數量***增加(圖2C)。此外,相對于非AD供體,4-HNE在AD患者的NOX4陽性星形膠質細胞***定位(圖2D)。AD患者的NOX4和4-HNE陽性星形膠質細胞數量相對于非AD供者***增加(圖2E)。這些結果提示AD患者受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高。 Pex調節HSC的ECM分泌。新疆課題省自然科學基金

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五、gata1調控靶基因的染色質可及性及表達動態

檢測了pySCENIC鑒定的**頂層gata1調控靶基因的scRNA-seq和scATAC-seq數據(根據AUCell評分排序)(圖5)。我們觀察了兩個基因啟動子(距轉錄起始位點3kb[TSS])和遠端調控區域(距TSS50kb)的可及性,以及沿MEMP分化軌跡所選靶基因的表達水平(圖5A)。我們觀察到,在造血干細胞/mpp中,gata1調控靶基因的啟動子在任何明顯的基因表達之前通常是開放的(圖5A)。因此,與我們之前的觀察一致,造血干細胞/mpp的染色質可及性發生在*存在于分化程度更高的細胞中的轉錄變化之前。有趣的是,與第1類(hsc/MPPs)相比,第6類(MEMPs)中GATA1靶基因的啟動子可及性總體較低(圖5B、5D和5E),與拮抗基因(即針對不同譜系的基因)的啟動子共可及性較低相吻合(圖5F)。相比之下,簇6中遠端調控元件/增強子的可及性高于簇1(圖5C)。這可能表明gata調控基因可能在啟動子上啟動,而增強子則提供細胞類型特異性的表達。
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