一、YTHDF1在胃*中的過表達
通過評估YTHDF1突變的分布,我們發現65%的突變是基因擴增,這通常會導致基因產物的過表達(圖1A).通過對TCGA數據集進行分析,發現YTHDF1在胃*患者中的表達確實明顯高于正常組織(圖1B)。YTHDF1的高表達與胃*進展(圖1C)和較差的總生存期(圖1D)相關。對正常胃組織和胃*標本進行免疫組化分析,證實**組織中YTHDF1蛋白表達上調(圖1F)。此外,YTHDF1在胃*患者中的異常高表達與更嚴重的臨床病理特征(如神經周圍侵犯、侵襲性**分期(III/IV期vs.I/II期)、靜脈侵犯等***相關(圖1G)。KaplanMeier生存分析也顯示,YTHDF1高表達的胃*患者4年總生存期較差。綜上所述,YTHDF1在胃*發生中具有潛在的致瘤作用。 引起28種血清代謝物豐度的變化在tempol作用下部分減弱.標書綜合編輯
由于circMAPK1在GC細胞系中穩定表達,我們推測circMAPK1可能是一種適合GC診斷或預后的標志物。qRT-PCR顯示circMAPK1在*組織中的表達低于匹配的非*組織(圖1m)。Kaplan-Meier生存分析顯示胃*組織中circMAPK1水平較高的患者總生存期***延長(圖1n)。綜上所述,circMAPK1是一種穩定表達的circRNA,可作為有效的診斷和預后標志物,值得進一步研究。
2)CircMAPK1在體外抑制GC細胞的增殖和遷移
為了研究circMAPK1在GC中的生物學功能,我們進行了一系列細胞實驗。隨CCK8實驗(圖2a)、集落形成實驗(圖2b)和EdU實驗(圖2c)結果表明,沉默circMAPK1可***增強GC細胞的增殖能力。我們發現circMAPK1的減少增加了S期GC細胞的數量(圖2d)。Transwell(圖2e)試驗顯示circMAPK1的干擾促進了GC細胞的遷移。此外,過表達circMAPK1***削弱了GC細胞的增殖能力。同樣,過表達circMAPK1時,S期GC細胞的數量***減少,細胞遷移受到抑制。綜上所述,circMAPK1在GC細胞的增殖和遷移中起著重要作用。 基礎醫學標書歡迎咨詢PCOS大鼠大部分血清代謝物的豐度與對照組大鼠完全不同.
circACTN4的表達與年齡(P ?= 0.036)、T(P ?= 0.001)、N(P ?= 0.001)和TNM分期(P < 0.001)呈正相關,但與分級無關。利用ISH檢測包含240個 BC組織的組織芯片確定circACTN4的表達。Kaplan-Meier生存分析顯示,circACTN4高表達患者的總生存期比circACTN4低表達患者的總生存期短。circACTN4的表達與T分期、N分期和TNM分期呈正相關。Cox 比例風險模型評估 circACTN4 的預后價值。結果顯示circACTN4的過表達是BC患者預后不良的**預測因子(HR = 4.566,P <0.001)。circACTN4 可以發揮致*作用,circACTN4 的高表達可以預測 BC 患者的不良預后。
采用LEfSe方法分析經DHEA和tempol處理后***改變的關鍵系統發育類型。Desulfovibrionaceae屬富集于oil+ PBS組,而Muribaculaceae 和Alloprevotella屬富集于DHEA+ PBS和DHEA+ tempol組 (圖5A-B),這表明tempol可以重塑微生物PCOS大鼠的腸道微生物群的結構。
通過分析細菌分類在門和屬水平上的相似性程度,進一步比較三組腸道菌群的整體組成。在門水平上,厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)是3個類群的優勢門(圖5)。DHEA處理增加了放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、Patescibacteria、軟毛桿菌門(Tenericutes)和Verrucomicrobia的豐度,減少了psilonbacteraeota和變形菌門(Proteobacteria)的數量。然而,在tempol干預下,放線菌門、Patescibacteria門、變形菌門和Tenericutes門的變化減弱了(圖5D)。在屬水平上,Lachnospiraceae_NK4A136_group和Multibaculaceae為優勢屬(圖5E)。DHEA***提高了thaauera、葡萄球菌、Ideonella、棒狀桿菌和瘤胃球菌_2的豐度,降低了瘤胃球菌_1的豐度。這些變化被tempol處理抵消了(圖5F)。 DHEA和tempol處理可影響腸道微生物的β-多樣性。
褪黑素可減少TBI誘發的小鼠腦行為缺陷和病變體積
為了利用褪黑素對TBI誘導的神經系統結果和病變體積的影響,進行了行為分析以及HE染色。關于線握測試,與假手術組相比,TBI在第1-8天導致運動表現顯著下降,但與TBI組相比,褪黑素和Lip-1的***改善了第2-6天的運動表現。在MWM測試中觀察到,與假手術組相比,TBI在第10-15天導致潛伏期延長,但是褪黑素和Lip-1***的TBI小鼠均表現出比TBI小鼠明顯更短的逃避潛伏期。曠場試驗中,與假手術組相比,TBI組的動物的總距離、中心移動距離和花費時間明顯縮短。褪黑素***可顯著逆轉上述參。HE染色顯示,褪黑素和Lip-1***的TBI組在TBI后第16天的病變體積明顯小于TBI組。兩者合計,結果提供了褪黑素***小鼠中TBI后改善運動,記憶和焦慮結局以及病變體積的證據。 FMT處理***增加了SCI小鼠腸道菌群的豐富度。國家自然科學基金厲害嗎
circNDUFB2過表達影響934個基因的表達水平。標書綜合編輯
在人類中,**終的造血功能開始于懷孕27天后,造血干細胞出現在造血集群的背主動脈內。這些明確的造血干細胞在妊娠后4周(pcw)首先在胎兒肝臟定植,并在那里大量擴張。在10.5 pcw時,造血部位再次轉移到骨腔(即骨髓[BM]),成人造血在此處長久建立。人們認為,***批在骨髓中播種的造血干細胞在其增殖和分化特性發生戲劇性變化之前,會繼續快速增加數量,以適應高產量分化子代的需要。
歷史上,造血系統的分化過程被描述為一系列中間步驟,由細胞表面標記物(即分化簇[CD])定義。在這個模型中,造血干細胞通常表現為造血樹,造血干細胞產生了越來越多的譜系限制性細胞類型,**終導致成熟的血細胞。這種模式在過去的5年里發生了改變,一些研究報告了數千個單個造血細胞的轉錄組,這些細胞被細胞表面標記物隔離,在小鼠模型和成人中。這些報告表明,以前被認為是同質的祖先種群,實際上在轉錄水平上是非常異構的。 標書綜合編輯
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗