此外，GFP-INPP4B的表達在基礎和wnt刺激條件下降低了GSK3β蛋白水平，與GSK3β的增強破壞一致(圖6d)。通過HrsshRNA消耗抑制晚期核內體形成后，降低的GSK3β蛋白水平得以恢復(圖6f,g)。GFP-INPP4B而不是gfp載體細胞表現出明顯的GSK3β蛋白酶保護，這與GSK3β向晚期核內體轉運的增強相一致(圖6h)。免疫熒光證實了這一點，在GFP-INPP4B中觀察到RFP-GSK3與LysoTracker共定位，這是一種積累在晚期核內體/溶酶體中的染料，而不是gfp載體細胞(圖6i)。醫學整體課題外包服務。帕金森小鼠模型課題產學研合作
表觀基因組學 (ChIP-Seq) 模塊
ChIP-seq 模塊目前包含大量染色質免疫沉淀測序 (ChIP-seq) 數據，反映了特定的衰老相關基因座是如何受組蛋白修飾和轉錄因子調節的。這些數據有助于闡明調控因素如何在全基因組范圍內影響衰老過程中的基因表達。ChIP-seq 數據來自已發表的與衰老相關的文章，并使用相同的分析方法處理原始數據以保持一致性。直觀地顯示了衰老過程中特定基因組位點不同轉錄因子的富集或組蛋白修飾的變化。
蛋白質組學（蛋白質-蛋白質相互作用）模塊
衰老過程中蛋白質穩態受損是典型的，蛋白質相互作用隨著年齡的增長而發生顯著變化。蛋白質-蛋白質相互作用模塊（PPI）旨在允許查詢感興趣的蛋白質及其與衰老相關的相互作用蛋白。結果以兩種方式呈現：交互式表格和網絡圖。前者提供了更詳細的信息，包括相互作用蛋白的數量、細胞/組織類型和支持相互作用的出版物；后者允許蛋白質相互作用網絡的可視化，并提供使用在線工具對選定數據執行基因本體或 KEGG 通路分析的選項。因此，PPI 將成為分析細胞衰老過程中關鍵蛋白質相互作用的有用模塊，從而可以在蛋白質水平上更好地了解人類衰老。 分子生物學課題協同創作英拜提供生物醫學課題外包服務。
為了檢測補充NAD + 是否可以糾正IFNα刺激的下游效應，用1 mM β-煙酰胺單核苷酸(NMN)培養CD8 + T細胞以恢復NAD +/NADH比值（圖6e）。然后，評估了用抗CD3/CD28再刺激后的氧化反應和細胞活力。補充NMN的NAD + 增加了OCR（圖6f），但未增加ECAR，表明線粒體能力增加。重要的是，通過NMN處理恢復NAD + 的可用性改善了IFNα延長和TCR刺激后的細胞活力（圖6 g），表明NAD途徑調節這些活化的人CD8 + T細胞中的線粒體適應性和細胞存活率。總之，這些數據表明，在人TCR刺激的CD8 + T細胞中，延長IFNα暴露增加了NAD + 的消耗，并降低了NAD +/NADH比值。這導致再刺激后線粒體呼吸缺陷和細胞活力降低。NAD + 前體NMN糾正了這些代謝變化，提高了CD8 + T細胞活力。
2）阿爾茨海默病患者皮質區受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高
由于NOX4蛋白水平在AD患者受損星形膠質細胞中升高，我們研究NOX4在AD患者受損星形膠質細胞氧化應激中的作用。我們用免疫熒光染色法檢測了AD患者或非AD供者大腦顳葉皮質組織中GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE的蛋白水平(圖2A)。免疫熒光染色顯示，AD患者(AD)皮質區分子層GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE陽性染色強度相對于非AD供者增加(圖2A、B)。此外，AD患者皮質區ML中受損的GFAP陽性星形膠質細胞4-HNE陽性染色強度高于非AD供者(圖2A和B)。AD患者中4-HNE與GFAP亞細胞共定位陽性的受損星形膠質細胞數量***增加(圖2C)。此外，相對于非AD供體，4-HNE在AD患者的NOX4陽性星形膠質細胞***定位(圖2D)。AD患者的NOX4和4-HNE陽性星形膠質細胞數量相對于非AD供者***增加(圖2E)。這些結果提示AD患者受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高。 英拜生物致力于分子生物行業十余年。
利用METABRIC數據集，我們評估了1459例ER+乳腺*中17個常見Wnt/β-catenin通路基因的表達，包括幾個Wnt靶基因(圖7a)。為了確定INPP4B是否促進PI3K和Wnt/β-catenin通路之間的對話，我們用增加劑量的PI3K抑制劑BKM120(0.5和1 M)處理gfp載體和GFPINPP4B MCF-7細胞，并測量Wnt靶基因AXIN2、LEF1和MYCN的mRNA表達(圖7b d)。在gfp載體細胞中，低劑量的BKM120對Wnt靶基因表達的影響**小，而高劑量的Wnt基因表達降低。在GFP-INPP4B表達細胞中，低濃度的BKM120部分挽救了Wnt基因表達的增加，在更高濃度時進一步降低。總之，這些發現與INPP4B促進Wnt/β-catenin信號轉導，從而通過增強晚期核內體形成促進pik3a突變ER+乳腺*細胞的增殖的解釋相一致(圖7e)。進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應。課題整包課題分子生物學
IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。帕金森小鼠模型課題產學研合作
作者收集并分析了黑色素瘤患者在***過程中的連續血液樣本，在此期間，患者接受CDK4/6i聯合靶向MEK抑制劑***，隨后接受PD-1和CTLA-4 ICB聯合***（Fig.6 F），患者達到完全緩解。使用CITE-seq技術評估一系列患者樣本，觀察到CDK4/6i + MEKi***后CD8 + T細胞記憶群的頻率呈時間依賴性增加，其特征為SELL、IL7R和TCF7的高表達（Fig.6G-I），這與臨床分析一致。事實上，偽時間分析揭示了從記憶樣群體到效應細胞的分化軌跡，CDK4/6i在該軌跡早期抑制CD8 + T細胞，隨后的ICB***加速了分化（Fig.6J）。跨越該時間的TCR克隆追蹤也發現，CDK4/6抑制增加了罕見T細胞克隆的頻率，主要存在于記憶群體內，隨后ICB處理擴增了這些克隆（Fig.6K）。這表明ICB***釋放了外周血中更多種類T細胞受體。總之，這些數據表明，CDK4/6i可用作ICB給藥前促進更有利T細胞表型的啟動工具。
這項研究證明了在細胞毒性T細胞中藥理學抑制CDK4/6可誘導RB介導的G1期阻滯，并促進記憶表型的獲得，可***增強這些細胞的長期抗**活性(Fig. 7)。 帕金森小鼠模型課題產學研合作
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
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