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USF2促進(jìn)circACTN4在BC中的表達(dá)為了研究 circRNA 在 BC發(fā)展中的功能,利用芯片分析檢測了4對BC組織和*旁組織中circRNA表達(dá)特征。共發(fā)現(xiàn)85個(gè)***差異表達(dá)的circRNAs, 63 個(gè)上調(diào)和22個(gè)下調(diào)circRNAs。熱圖顯示了14個(gè)上調(diào)的circRNA,其中circACTN4是失調(diào)**嚴(yán)重的一個(gè),差異高達(dá)10倍。根據(jù)circBase數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)circACTN4來自位于人類19號染色體上的ACTN4基因,產(chǎn)生于ACTN4外顯子2至外顯子7(共571bp),通過 Sanger 測序驗(yàn)證了反向剪接連接點(diǎn)。為了驗(yàn)證circACTN4的環(huán)形結(jié)構(gòu),使用聚斂引物和發(fā)散引物擴(kuò)增環(huán)狀 circACTN4 和線性 ACTN4。通過FISH和核質(zhì)分離PCR觀察到circACTN4主要位于BC細(xì)胞的細(xì)胞核中, circACTN4在*組織中的表達(dá)高于*旁組織。英拜的員工福利待遇很好。cancer科研贈(zèng)送提供技術(shù)路線
5、hUC-MSCs調(diào)節(jié)MRL/lpr小鼠脾CD4+T細(xì)胞Sirt1/p53信號通過miR-199a-5p
文獻(xiàn)報(bào)道在**和自身免疫疾病中,hUC-MSCs能夠?qū)iRNAs轉(zhuǎn)移到周圍的細(xì)胞。因此,作者考慮miRNAs是否可能參與hUC-MSCs介導(dǎo)的對脾CD4+T細(xì)胞中Sirt1的表達(dá)調(diào)控。使用在線軟件Targetscan識別了10個(gè)miRNA,這些miRNA被預(yù)測靶向Sirt1。qPCR分析顯示,在這10個(gè)miRNAs中,只有miR-199a-5p的表達(dá)在MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞中***降低(圖5A)。此外,miR-199a-5p是hUC-MSCs處理后***表達(dá)增加的miRNA(圖5A)。事實(shí)上,miR-199a-5pmimic不僅可以提高M(jìn)RL/lpr脾CD4+T細(xì)胞中miR-199a-5p的水平,降低Sirt1的表達(dá)(圖5B-C),而且還可以提高衰老標(biāo)志物p21、p16和乙?;痯53的表達(dá)水平(圖5D)。 陜西科研技術(shù)指導(dǎo)METTL14是其***的潛在靶點(diǎn)。
1)USP35敲除抑制肺*細(xì)胞生長、集落形成和**進(jìn)展
我們首先檢測了肺*組織和細(xì)胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示,USP35在肺ADC和SCC**中都***上調(diào)。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細(xì)胞系相比,USP35mRNA水平在肺*細(xì)胞系(A549、H358、H460、H1299和H1650)中也高度表達(dá)(圖1B)。鑒于H460和H1299細(xì)胞中USP35mRNA的豐度較高,我們在下一項(xiàng)研究中使用了這兩種細(xì)胞系。與mRNA水平一致,在H460和H1299細(xì)胞中USP35蛋白也增加了(圖1C)。為了闡明USP35在肺*發(fā)病機(jī)制中的作用,我們在H460和H1299細(xì)胞中沉默了USP35(圖1D)。有趣的是,USP35敲除抑制了H460和H1299細(xì)胞在體外的生長能力和集落形成(圖1E、F)。來自**異種移植實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)進(jìn)一步表明,USP35沉默抑制了25天生長后的**體積和重量(圖1G,H)??傊?,USP35在調(diào)節(jié)肺*細(xì)胞生長和**進(jìn)展中起著關(guān)鍵作用。
1.核糖體印跡與多聚核糖體分析證據(jù)
mRNA的翻譯是由核糖體進(jìn)行的,它可以在主動(dòng)翻譯的mRNA中形成多聚核糖體(Polysome)。因此,與核糖體/多核糖體的結(jié)合可以作為可翻譯circRNA潛力的強(qiáng)有力的預(yù)測證據(jù)。數(shù)據(jù)庫整合了已發(fā)表的核糖體印跡(RibosomeProfiling)分析數(shù)據(jù)和多聚核糖體分析(PolysomeProfiling)數(shù)據(jù),挖掘分析circRNA與核糖體的關(guān)聯(lián)。
2.翻譯啟動(dòng)站點(diǎn)(TIS)
GTI-seq已實(shí)現(xiàn)了接近單核苷酸分辨率的翻譯起始密碼子的全景圖,揭示了整個(gè)人類轉(zhuǎn)錄組中數(shù)千個(gè)TIS密碼子的明確**。數(shù)據(jù)庫基于GTI-seq的TISdb數(shù)據(jù)用作支持circRNAs翻譯的間接證據(jù),這也與潛在的ORF相關(guān)。 Caspase-11介導(dǎo)的肝細(xì)胞焦亡促進(jìn)非酒精性脂肪性肝炎的進(jìn)展。
3.構(gòu)建微生物群共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)并進(jìn)行聚類分析
使用SparCC算法構(gòu)建差異ASV共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)。
分析并比較了腺瘤和對照組中生物標(biāo)志物的模式,將它們進(jìn)一步組裝成具有不同分類學(xué)組成的四個(gè)簇。這些簇與患者的年齡,性別和BMI等特征沒有緊密聯(lián)系。此外,還探討了CRC患者腸道菌群在24種生物標(biāo)記物組中的共發(fā)生網(wǎng)絡(luò),并產(chǎn)生了三個(gè)簇。聚類1的細(xì)小螺旋藻科物種被分配的ASV**少,而聚類2在分類學(xué)上是異質(zhì)的,在CRC個(gè)體中患病率較高。
4.結(jié)腸*、腺瘤分類模型的驗(yàn)證
結(jié)果表明,微生物來源的生物標(biāo)志物組在檢測大腸腺瘤方面優(yōu)于FIT,并且它們的組合可以提高非侵入性腺瘤診斷的準(zhǔn)確性。
5.在**隊(duì)列中驗(yàn)證結(jié)直腸腺瘤標(biāo)志物
本研究納入了另外兩個(gè)來自美國(驗(yàn)證組1)和中國(驗(yàn)證組2)的**隊(duì)列。驗(yàn)證隊(duì)列1由70名對照和102例腺瘤患者組成,而驗(yàn)證隊(duì)列2中有57例腺瘤患者和52例CRC患者。 思路是您的操作我們來做。黑龍江科研服務(wù)兩年
英拜生物是國內(nèi)承接各類高通量測序科研項(xiàng)目以及一站式的測序文章發(fā)表服務(wù)的公司之一。cancer科研贈(zèng)送提供技術(shù)路線
與基因表達(dá)改變一致,白樺素處理以濃度依賴性的方式***減少了膽固醇和脂肪酸的從頭合成(圖3D-E)。此外,白樺素降低了細(xì)胞膽固醇(圖3F)和中性脂質(zhì)(主要是膽固醇酯和甘油三酸酯)的穩(wěn)態(tài)水平(圖3G)。兩者合計(jì),我們的數(shù)據(jù)表明白樺素抑制SREBP加工并下調(diào)膽固醇和脂肪酸的生物合成,從而降低細(xì)胞脂質(zhì)水平。有趣的是,洛伐他汀顯著降低了膽固醇的合成(圖3D),但也適度地增加了脂肪酸的生物合成(圖3E),這可能是因?yàn)槁宸ニ∈荋MGCR的抑制劑,它可以阻斷膽固醇的合成,進(jìn)而刺激SREBP的活化,從而增加脂肪酸合成。cancer科研贈(zèng)送提供技術(shù)路線
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺,提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)