二、阻斷atm依賴的PTEN磷酸化導致基因組
了確定ATM介導的PTEN磷酸化如何調節DDR，構建Pten398A/398A和Pten+/+littermatesMEFs細胞模型。PTEN蛋白水平不受398A突變的影響(補充圖3A,B)。此外，磷酸化AKT(PI3K通路活性的標記物)水平在Pten398A/398A和PTEN+/+MEFs中相似(補充圖3B)。構建人乳腺上皮細胞系(MCF10A)，穩定表達野生型PTEN(PTEN-wt)，或PTEN的突變形式，不能被ATM磷酸化(PTEN-398a)。在這些細胞中，內源性的PTEN基因被CRISPR/Cas9編輯刪除，創建了PTEN空細胞，然后用野生型或突變型的蛋白質穩定轉導重組。在表達PTEN-wt和PTEN-398a的MCF10A細胞中，PTEN蛋白和磷酸化AKT水平相似(補充圖3A)，使這些細胞成為ATM磷酸化PTEN分子作用研究的合適替代模型。Pten+/+和Pten398A/398Amef在10gyIR作用下，通過測定每個細胞的γH2AX和53bp1病灶數量來評估其修復DNA損傷的能力。在Pten+/+mef中，我們觀察到在照射后4小時，每個細胞的病灶數量達到峰值，24小時后恢復到接近基線水平(圖2AC)。Pten+/+和Pten398A/398A在ir后4小時，每個細胞聚集的病灶數量相似。然而，Pten398A/398Amef在24小時時間點比Pten+/+mef保留了更多的病灶數，表明DNA修復能力降低(圖2C)。 大黃酸可以改變腸道菌群組成。上海滲透性應激科研
遷移體（migrasome）是清華大學生命科學院俞立團隊新發現的胞外分泌囊泡，該研究成果已于2015年發表在Cell Research期刊（IF=20.509）[1]。遷移體是在遷移細胞后部回縮纖維的前列或交叉處生長的大囊泡，直徑約為0.5μm到3μm，并且包含許多較小的囊泡（**多300余個，**少不足10個），掃描電子顯微鏡觀察下呈石榴狀結構。細胞遷移后，回縮纖維**終斷裂，遷移體分離。遷移體及其內容物，包括細胞溶質成分和來源不明的囊泡，被釋放到細胞外空間——這一過程稱為遷移。俞立團隊推測遷移體可能在細胞間通訊中發揮重要作用。
2017年俞立團隊進一步研究發現，整合素與 ECM 蛋白的配對結合決定了遷移體的形成[2]，該研究成果也發表在Cell Research期刊。2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法[3]。2019年，俞立團隊發現Tspan4和膽固醇在遷移體形成時組織成為微米級大型微結構域，這一結構即遷移體的基本結構，還證實遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結構的剛度增加而產生的一種生物物理過程[4]，該研究成果發表于Nature Cell Biology期刊中（IF=20.041）。 骨代謝科研省自然科學基金METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。
急性髓系白血病(AML)的靶向***的實施一直具有挑戰性。FTO是一種m6A去甲基酶，作為一種致*基因，促進白血病*基因介導的細胞轉化和白血病發生。因此為大家介紹于2021年3月發表于影響因子為8.579的Theranostics上文章“Saikosaponin D exhibits anti-leukemic activity by targeting FTO/m6A signaling”。在這里，我們研究了Saikosaponin-d (SsD)在AML中***的抗增殖作用中的作用，并通過靶向SsD的FTO來評估m6A去甲基化活性。SsD在體外和體內均能***抑制AML細胞增殖，促進細胞凋亡和細胞周期阻滯。機制上，SsD直接靶向FTO，從而增加了m6A RNA的甲基化，降低了下游基因轉錄本的穩定性，導致相關通路的抑制。重要的是，SsD還克服了FTO/m6A介導的白血病對酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性。總之，FTO依賴的m6A RNA甲基化介導了SsD的抗白血病作用，使SsD成為一種***白血病的藥物。
2、miR-208b由結腸*細胞以外泌體的方式分泌
隨后，作者探究了miR-208b的存在方式是否由外泌體介導。分離鑒定了3株CRC細胞系的外泌體，并檢測了其中miR-208b的表達。外泌體中miR-208b的表達模式和在細胞中的模式一致，在SW480-OXA***高于SW480***高于NCM460。這些結果表明CRC中miR-208b的是以外泌體的模式分泌，這可能和順鉑化療敏感性有關。
3、SW480細胞分泌的外泌體miR-208b促進Treg擴增
前人研究表明順鉑會影響**免疫微環境。MiRNA可能通過促進Treg擴增誘導免疫侵襲。因此，作者探究了CRC分泌外泌體miR-208b對T細胞分化的影響。使用siRNA去除miR-208b，然后收集外泌體，將含有不同水平miR-208b的外泌體與原代CD4+T細胞共培養（圖4A-B）。6h后，受體CD4+T細胞中miR-208b***增加，尤其是SW480-OXA組，而外泌體miR-208b缺失組則沒有***改變，表明CD4+T細胞中miR-208b是由外泌體傳輸（圖4C-D）。此外，SW480和SW480-OXA來源外泌體處理組的CD4+CD25highFoxp3+Tregs細胞數***增加，而外泌體miR-208b缺失對其陽性細胞數則沒有明顯影響。表明外泌體miR-208b促進Treg擴增。 英拜的員工福利待遇很好。
英拜生物立足于生命科學實驗技術服務的公司，服務平臺有細胞生物學研究平臺、分子生物學研究平臺、病理學研究平臺、免疫學研究平臺、蛋白質與多肽研究平臺、測序和芯片研究平臺，高通量/高內涵篩選平臺、分子表觀遺傳學研究平臺，提供專業檢測服務、技術合作和轉化服務指導。英拜生物服務項目分子生物學檢測蛋白質與免疫學動物實驗實時熒光定量PCR，ELISA（酶聯免疫吸附法）技術Western-blot實驗服務，雙熒光素酶報告基因檢測，染色質免疫共沉淀（ChIP），pullDown，過表達/干擾腺病毒包裝純化細胞整體實驗外包動物整體實驗外包腺相關病毒包裝純化肺炎大鼠模型肝炎-肝硬化-肝cancer模型蛋白芯片原代細胞培養肝纖維化模型細胞因子芯片骨髓間充質干細胞培養膽結石模型脂肪干細胞培養急性胰腺炎模型生長因子芯片心肌成纖維細胞培養急性腎衰竭模型炎癥因子芯片軟骨細胞培養體內血栓模型血管生成因子芯片血管內皮細胞培養關節炎模型凋亡因子芯片神經元細胞培養趨化因子芯片內皮組細胞原代培養裸鼠成瘤動物整體實驗服務細胞生物學檢測高通量測序代謝組學細胞原代培養mRNA測序LncRNA測序細胞凋亡檢測全基因組測序核磁共震NMR細胞周期檢測RNA-Seq測序細胞克隆形成實驗外顯子測序Trans。巨噬細胞表型協調急性胰腺炎損傷后的炎癥和修復再生。合成甲基化科研實驗可參觀
英拜注重客戶的隱私。上海滲透性應激科研
四、scRNA-seq和scATAC-seq數據整合
目前尚無人類胚胎HSPCs的染色質可及性圖譜，研究者基于基因體可及性繪制細胞圖譜來整合scRNA-seq和scATAC-seq數據。首先使用6種豐富的細胞類型對scRNA-seq實驗中篩選出的CD34+ CD38- 細胞進行分類，結果顯示scATAC-seq數據集中指定細胞類型的頻率與scRNA-seq數據中的頻率高度一致，這表明染色質可及性和轉錄組具有相關性。然而，不同類型的細胞在整個軌跡上有相當大的混合，如HSCs/MPPs-Cycle***分布在七個集群中，這表明在HSCs/MPP群體中存在***的染色質啟動，從而導致了異質性。之后研究者比較了7個集群中HSCs /MPPs中選定的譜系特異性TF基序的可及性，結果顯示在轉錄同源的HSCs/MPPs集群中，一些先于基因表達的TFs的活性存在***差異。 ***，研究者進一步探索分化過程中染色質可及性和基因表達之間的“時滯”，結果顯示在HSCs/MPS中，GATA1-調節子靶基因的啟動子在任何明顯基因表達之前均是開放的，這證實HSCs/MPP中染色質的可及性早于轉錄變化。 上海滲透性應激科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關研究
4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗