2021年5月,在Elife 雜志上發表了文章“Traumatic injury compromises nucleocytoplasmic transport and leads to TDP-43 pathology.”。此報道在體內,反復的創傷會上調核孔蛋白,改變核孔蛋白的穩定性,改變NCT蛋白,改變Ran***1和核孔蛋白的分布,改變NCT。此外,核輸出的藥理抑制可以防止tbi介導的致命性和NCT缺陷。有趣的是,在體內和體外,核孔蛋白的上調導致TDP-43定位錯誤、聚集、磷酸化和溶解性改變,并降低運動功能和壽命。對NUP62病理和CTE患者腦組織中NUP62濃度升高的研究結果表明NCT缺陷與創傷損傷有關,這可能介導了TDP-43的病理變化。英拜專注高通量測序行業的整體服務。湖北ampk信號通路芯片科研
5)DRD2通過阻斷TAK1的磷酸化來限制NF-κB信號的***
NF-κB信號的***對于觸發炎癥小體組裝和隨后的焦亡是必不可少的。IF染色顯示DRD2幾乎阻斷了p-p65的核易位(圖5A),但這種抑制被Mφ所抵消(圖5B)。核和細胞質提取物也顯示DRD2抑制了p-p65的核易位(圖5C)。如WB結果所示,在LPS刺激下,DRD2抑制IKKα/β、IκBα和p65的磷酸化(圖5D)。異位DRD2表達也***抑制了Mφ誘導的p65磷酸化和IKKα/β的上游***(圖5E)。WB結果顯示DRD2下調NF-κB的下游靶點ICAM-1。然而,這種下調被Mφ所抵消(圖5E)。抑制IKKα/β磷酸化提示DRD2負向介導IKK復合物上游。TAK1在催化IKKα和IKKβ中起關鍵作用。TAK1的磷酸化被異位DRD2表達***抑制(圖5D-E)。因此,DRD2通過阻斷上游激酶TAK1來抑制NF-κB信號通路的***。 免疫學科研中標率高大黃酸可以改變腸道菌群組成。
m6A的研究方向(1)主要是通過研究m6A修飾相關的甲基化、去甲基化酶和識別蛋白的功能,進而研究m6A修飾的生物學功能和作用機制:-般通過敲除m6A酶分子,研究下游功能基因分子的表達和m6A甲基化情況。通過介導相關基因異常(可變剪切、穩定性、翻譯.miRNA調控)影響細胞表型和功能特征。(2)m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾病細胞模型或者發病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motifpeaks數量及分布,Peak關聯基因的特征,聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路疾病樣本vs正常樣本3vs3以上MeRIP-SeqRNA-Seqm6A修飾圖譜分析m6A修飾差異基因分析差異表達基因分析差異表達基因關聯分析MeRIP-PCR、qPCR驗證
四、TEA-seq轉錄本、表位和可及性的三峰測量
A.隨著從單個核中同時捕獲RNA-seq和ATAC-seq的商業平臺的發布,我們推斷通透細胞可以用于同時捕獲三個主要的分子隔間:DNA可以用scATAC-seq捕獲,RNA可以用scRNA-seq捕獲,蛋白質表位豐度可以用聚腺苷化抗體條形碼捕獲,我們根據轉錄本、表位表位和可及性將其稱為TEA-seq。經過試驗和關鍵步驟的優化后,我們能夠在10倍基因組MultiomeATAC+基因表達平臺上獲得文庫,該平臺使用46個低聚標記抗體組合了數千個單細胞的所有三種測量結果.
B.D.在對裝入4孔的細胞進行初始數據處理后,我們鑒定出29264個通過上述scATAC-seqQC標準的細胞條形碼,有2,500,500個獨特的ATAC-seq片段(中值=8762個獨特的ATAC片段),有>500個基因被scRNA-seq檢測到(中值=2399個RNAUMIs;中位數=檢測到129,249個基因),500個ADTUMIs.
G.H.更敏感的蛋白質豐度測量允許檢測許多附加的相關標準物質,例如CCR2/CD192.
I.J.一種單核細胞上表達的趨化因子受體和CD38,一種表達于多種免疫細胞表面的糖蛋白. 英拜生物擁有一支高精尖的技術豐富的技術團隊。
英拜生物是國內承接各類高通量測序科研項目以及一站式的測序文章發表服務的公司之一。公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包,以及撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在你的指導下完成,等于是把客戶實驗室搬到我們平臺,客戶可提供學生在平臺學習,公司來幫助客戶代教學生實驗,讓客戶安心沒有后顧之憂。我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。浙江hippo信號通路芯片科研
大黃酸能緩解D。SS誘導的小鼠慢性結腸炎。湖北ampk信號通路芯片科研
circNDUFB2抑制NSCLC進展
體外研究表明circNDUFB2過表達顯著抑制了NSCLC細胞的增殖,遷移和侵襲,而circNDUFB2敲低顯著促進了這些表型。體內實驗表明circNDUFB2過表達可顯著抑制NSCLC細胞的致瘤性和轉移。這些數據表明circNDUFB2可能在NSCLC進展中起抑制作用。
circNDUFB2與NSCLC細胞中的IGF2BP1/2/3相互作用
為了探索circNDUFB2是否通過與蛋白質相互作用發揮功能,RNA pulldown來鑒定與其相關的蛋白質。RNApulldown沉淀物通過SDS-PAGE分離。銀染后,切下約65 kDa的有義特異性條帶,并使用質譜進行分析。發現**個豐富的蛋白質分別是IGF2BP2,IGF2BP1和IGF2BP3。使用Western blot和RIP分析證實了這一結果。此外, RNA FISH免疫熒光分析,發現circNDUFB2與IGF2BPs共定位在細胞質中。為了探討IGF2BPs的KH域對于與circNDUFB2之間的相互作用,構建IGF2BPs突變體,KH結構域突變明顯減少了IGF2BP與circNDUFB2之間的相互作用。接下來進行了circNDUFB2突變,發現circNDUFB2突變顯著降低了IGF2BP與circNDUFB2之間的相互作用。 湖北ampk信號通路芯片科研
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6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗