為了探討UCP1與AKI之間的相關性,我們在體內、體外檢測了UCP1在AKI模型中的表達。結果顯示,UCP1在AKI小鼠中***下調,更重要的是,隨著腎損傷的加重,其表達量逐漸降低(圖2E-F)。在體外,隨著順鉑刺激時間的延長,HK2細胞中UCP1的表達降低(圖2G)。這些結果表明UCP1與AKI的嚴重程度呈負相關。此外,隨著AKI腎細胞損傷程度的增加,脂質的積累,UCP1的表達逐漸降低(圖2H)。這一結果表明,UCP1在AKI中的表達可能影響脂質積累。
3)AKI中的脂質積累與UCP1高度負相關在確定了UCP1與AKI中的脂質積累負相關
后,我們試圖闡明其潛在的關系。首先,我們使用UCP1特異性過表達慢病毒載體和UCP1激動劑CL316243構建UCP1上調的細胞模型(圖3A)。如圖3B所示,UCP1過表達***降低了順鉑暴露HK2的脂質積累。 阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配。MMP
qRT-PCR結果表明,暴露于miR-144模擬物處理的鼻咽*細胞的HUVECs中miR-144上調,而暴露于miR-144inhibitor處理的鼻咽*細胞的HUVECs中miR-144下調(圖3C)。Transwell實驗結果表明,miR-144過表達EVs足以增強HUVECs的遷移和侵襲,而miR-144抑制EVs則表現出相反的趨勢(圖3D和3E)。此外,我們還通過傷口愈合實驗檢測HUVECs的增殖和遷移能力(圖3F)。結果顯示,與NC模擬EV組相比,miR-144模擬EV組細胞的創面愈合率升高,說明C666-1-和SUNE1細胞來源的EVmiR-144均促進HUVECs的增殖和遷移。與NC抑制EV組相比,miR-144抑制EV組的細胞創面愈合率降低,提示C666-1-和SUNE1EV細胞EVmiR-144抑制后,HUVECs的增殖和遷移受到抑制。轉錄組Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。
為了了解白樺素和他汀類藥物的抗DIO作用,進一步分析了脂質吸收,體力活動和能量消耗。在洛伐他汀***的小鼠中,盡管呼吸商(RQ)增強,表明從體內利用葡萄糖和蛋白質進行能量生產已超過脂質氧化,但耗氧量和總能量消耗仍與WD喂養的小鼠相似(圖4F-4H)。另一方面,用洛伐他汀喂養的小鼠的糞便膽固醇和甘油三酸酯(TG)顯著增加(圖4C和4D),表明洛伐他汀降低脂質吸收或增加脂質排泄,從而拮抗DIO。這一觀察結果與以前的報告是一致的。另一方面,白樺素對脂質吸收/排泄沒有影響(圖4C和4D)。
數據庫還可以分析現有的化學品和基因相關數據,根據自身需要檢索相關基因或者化學品。
該數據庫還將解剖學及其相關表型與環境化學物質聯系起來,使它們可計算用于薈萃分析,并使 CTD 中化學和表型景觀的解剖學視角成為可能。2020 年, CTD 利用醫學主題詞中“解剖學”分支的修改子集作為其受控詞匯源,其中包括 1799 個用于解剖結構和區域、生理系統、流體和組織、細胞和亞細胞成分的術語。 目前,CTD中超過247000種化學-表型相互作用使用了870個解剖學術語。 用戶可以通過選擇門戶圖標向下鉆取可導航層次結構或使用 CTD 關鍵字搜索框中的“解剖”選擇列表選項,從主頁訪問 CTD Anatomy。CTD Anatomy 頁面組織和合并數據,允許用戶從解剖學角度探索交互;這可用于識別不同生理系統(例如腎臟、肝臟、大腦和心血管系統)獨有或共享的化學物質和表型,或發現例如影響影響的 1158 種化學物質 心臟中有 600 種表型。同樣,已經開始將 CTD 暴露與 CTD 解剖學相結合,使環境健康科學家能夠調查暴露研究和組織和系統暴露化學應激誘導表型的細節。***,為了幫助提高數據庫的互操作性。 上海英拜提供課題外包服務。
1、在響應CDK4/6抑制中瘤內記憶類CD8+T細胞的表現
為了***評價CDK4/6抑制對抗**T細胞免疫的影響,使用多模式單細胞測序(CITE-seq)分析了CDK4/6抑制劑palbociclib或對照處理的MC38-OVA**小鼠的瘤內T細胞群體(Fig.1A)。維度分析顯示MC38-OVA**中有10個不同的T細胞群(Fig.1B)。用CDK4/6i處理的**有較低頻率的CD4+調節性T細胞(Foxp3+Tregs),而CD8+記憶類T細胞頻率更高,以Tcf7、Sell、Bcl2和Cd7高表達為特征(Fig.1B-D)。CD8+T細胞池的基因動態表達揭示來源于CDK4/6i處理的小鼠的CD8+**免疫浸潤(TILs)向更早、更像干細胞的分化狀態傾斜(Fig.1E-F)。與此一致,較早出現假時間軌跡的細胞表達更高水平的記憶相關基因(Tcf7,Sell,Il7r),和更低水平的效應相關基因(Prf1,Gzmb)和耗損標志物(PD-1,TIM3)(Fig.1G)。 ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布。MMP
外泌體CD44v6和C1QBP可能是預測PDAC患者預后的有前途的生物標志物。MMP
JAK-Stat6信號通路在介導IL-4/IL-13誘導TME中TAMs免疫抑制極化過程中起關鍵作用。IL-4/IL-13刺激后,JAK磷酸化,隨后Stat6磷酸化,磷酸化后的Stat6二聚并遷移至細胞核,然后與IL-4/IL-13相應基因,包括那些參與巨噬細胞免疫響應功能的基因的啟動子結合。據報道ROS可以促進JAK和Stat6磷酸化。因此,推測MAO-A可能通過上調ROS水平影響巨噬細胞極化,從而使JAK-Stat6信號通路敏感。事實上,直接分析從B16-OVA荷瘤Maoa WT和Maoa KO小鼠中分離的TAMs證實,與野生型TAMs相比,MAO - A缺陷的TAMs顯示Stat6***降低(圖4k-l)。進一步分析IL-4/ IL-13誘導的JAK-Stat6信號通路,與在Maoa WT BMDMs中相比,在Maoa KO BMDMs中JAK-Stat6信號***下降,補充H2O2可使其JAK-Stat6信號達到與WT類似水平(圖4m)。這些數據表明MAO-A通過ROS致敏的JAK-Stat6通路***促進巨噬細胞免疫抑制極化。
總之,這些體內外數據支持MAO-A促進TME中免疫抑制極化,通過上調TAM細胞內ROS水平,從而提高IL-4/ IL -13誘導的JAK-Stat6信號通路。 MMP
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗