一、人胎肝和骨髓造血室的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組
為獲取胚胎發(fā)育期間造血細(xì)胞的全部譜系，研究者從17 – 22 PCW的胚胎肝臟、股骨和髖骨中對(duì)表型確定的血液群體進(jìn)行單細(xì)胞分類，并對(duì)15個(gè)胚胎的單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq檢測(cè)（圖1）。基于差異表達(dá)分析和標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)***性排名前20的標(biāo)記基因，標(biāo)注了23個(gè)不同的群體，發(fā)現(xiàn)在肝臟或股骨中檢測(cè)不到任何T細(xì)胞或先天淋巴細(xì)胞（ILCs），單細(xì)胞分析顯示在所有免疫表型定義的干細(xì)胞和祖細(xì)胞群體中存在大量的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性，其中一些表型祖細(xì)胞群體（如HSCs，MPPs，CMPs，GMPs，MEPs和CLPs）由10多個(gè)不同的轉(zhuǎn)錄表型定義群體組成，這進(jìn)一步證明人類臍帶血的祖細(xì)胞室具有高度的異質(zhì)性。此外，該研究分析表明當(dāng)前使用的細(xì)胞表面標(biāo)記物不能很好地預(yù)測(cè)人類胚胎造血祖細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄狀態(tài)。 高通量測(cè)序后續(xù)的機(jī)制實(shí)驗(yàn)。上海課題
3.TYRO3通過(guò)抑制鐵死亡和**TME，誘導(dǎo)抗PD-1/PD-L1耐藥性。.
為探究TYRO3在TME中的功能，首先評(píng)估了TYRO3-OE4T1和4T1-P**之間免疫學(xué)特征的整體變化。免疫細(xì)胞譜分析發(fā)現(xiàn)在CD45-**細(xì)胞中，Tyro3過(guò)表達(dá)與PD-L1或caspase-3無(wú)關(guān)，Tyro3-OE**中M1樣巨噬細(xì)胞水平降低，M1/M2比值下降，提示**表達(dá)的Tyro3促進(jìn)M1～M2巨噬細(xì)胞極化。用TYRO3-OEBT549細(xì)胞或TYRO3-OE和TYRO3–/–4T1**細(xì)胞的條件培養(yǎng)基孵育THP1單核細(xì)胞或骨髓源性巨噬細(xì)胞，進(jìn)一步驗(yàn)證TYRO3的體外***功能。RNA-Seq發(fā)現(xiàn)VEGF在耐藥細(xì)胞系4T1-R和Tyro3-OE中表達(dá)上調(diào)，TYRO3-OEBT549細(xì)胞的條件培養(yǎng)基CM***降低M1標(biāo)記物的表達(dá)，增加M2標(biāo)記物的表達(dá)，加入VEGFR抑制劑完全消除TYRO3對(duì)巨噬細(xì)胞極化的影響。這些結(jié)果表明TYRO3通過(guò)上調(diào)VEGF降低M1/M2比值，從而促進(jìn)原瘤TME。 四川課題實(shí)驗(yàn)外包了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。
中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組和北京基因組研究所（國(guó)家生物信息中心）鮑一明研究組、張維綺研究組合作建立了AgingAtlas數(shù)據(jù)庫(kù)（./aging/index）。數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)文章于2020年10月29日以“AgingAtlas:amulti-omicsdatabaseforagingbiology”為題在線發(fā)表于NucleicAcidsResearch雜志（IF=）。
AgingAtlas目前的實(shí)現(xiàn)包括五個(gè)模塊：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和藥物基因組學(xué)。此外，AgingAtlasConsortium還手動(dòng)管理了一系列與衰老相關(guān)的人類和小鼠基因(GAAA)。GAAA部分現(xiàn)在包含數(shù)百個(gè)人類和小鼠衰老相關(guān)基因，分為10個(gè)“基因集”和相應(yīng)的KEGG通路。基因組具有成熟的老化特征，包括基因組不穩(wěn)定性、端粒磨損、表觀遺傳改變、蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)喪失、線粒體功能障礙、營(yíng)養(yǎng)感知失調(diào)、細(xì)胞間通訊改變、細(xì)胞衰老和干細(xì)胞衰竭。AgingAtlasConsortium的老年學(xué)專家將GAAA中的每個(gè)基因都?xì)w因于這些基因集。因此，GAAA提供了AgingAtlas的基準(zhǔn)部分，以幫助用戶更好地解釋這些與衰老相關(guān)的基因的生物學(xué)意義。
本公司依靠完整的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員以及實(shí)戰(zhàn)能力豐富的翻譯專家，可以根據(jù)客戶研究方向選定課題，設(shè)計(jì)研究?jī)?nèi)容跟研究路線，并提供相關(guān)實(shí)驗(yàn)服務(wù)。
1 國(guó)資然標(biāo)書的潤(rùn)色以及申請(qǐng)指導(dǎo)
本公司能針對(duì)目前各研究領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀，為客戶提供專業(yè)的課題指導(dǎo)以及新穎的實(shí)驗(yàn)思路，以確保在課題的新穎和思路的可行性上取得較好的優(yōu)勢(shì)
2，課題免費(fèi)設(shè)計(jì)
我們可以為客戶搜索，查閱文獻(xiàn)，分析其實(shí)驗(yàn)思路的合理性，還能結(jié)合客戶的實(shí)驗(yàn)要求分析課題中所需要的技術(shù)方法和檢測(cè)指標(biāo)，進(jìn)而設(shè)計(jì)出合理的實(shí)驗(yàn)方案。 soRNA測(cè)序的 整套服務(wù)。
8）在AKI期間上調(diào)UCP1減少脂質(zhì)積累，可通過(guò)AMPK/ULK1途徑促進(jìn)體內(nèi)自噬
我們發(fā)現(xiàn)UCP1在體外通過(guò)***自噬來(lái)影響AKI中的細(xì)胞功能，我們探討了這種情況在體內(nèi)是否也會(huì)發(fā)生。結(jié)果表明，在動(dòng)物模型中上調(diào)UCP1也能******AMPK/ULK1/自噬通路(圖8A)，免疫熒光和免疫組化分析進(jìn)一步證實(shí)了這一點(diǎn)(圖8B-C)。***，CL316243上調(diào)UCP1后，AMPK/ULK1/自噬通路也被******(圖8D-F)。綜上所述，我們的研究構(gòu)建了AKI中脂質(zhì)積累***的模型，且這種積累的脂質(zhì)與UCP1呈負(fù)相關(guān)。通過(guò)上調(diào)UCP1來(lái)***AKI中積累的脂質(zhì)，可以***AMPK/ULK1/自噬通路來(lái)抑制疾病進(jìn)展(圖9)。
結(jié)論：UCP1直接調(diào)控AKI中的脂質(zhì)積累，***細(xì)胞自噬，從而***抑制疾病進(jìn)展。這為AKI的***提供了新的思路和靶點(diǎn)。 促*分泌體通過(guò)外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。重慶課題地區(qū)科學(xué)基金
產(chǎn)生關(guān)于環(huán)境影響疾病的病因和分子機(jī)制的可測(cè)試的假設(shè)。上海課題
circ_0072083 與 miR-1252-5p 相互作用以調(diào)節(jié) TMZ 抗性
神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞中的 ALKBH5/NANOG 軸和 TMZ 抗性為了分析circ_0072083如何調(diào)節(jié)ALKBH5/NANOG軸，探索了潛在的 miRNA作為串?dāng)_。基于Circinteractome和starBase的數(shù)據(jù)庫(kù)，維恩圖顯示只有一種miRNA（miR-1252-5p）可以與circ_0072083、ALKBH5和NANOG結(jié)合。 miR-1252-5p 表達(dá)在 TMZ 抗性組織和細(xì)胞中顯著降低。為了驗(yàn)證它們的相互作用，構(gòu)建了野生型和突變型熒光素酶報(bào)告載體。miR-1252-5p 過(guò)表達(dá)明顯降低了野生型組（WT-circ_0072083、WT-NANOG 3'UTR 和 WT-ALKBH5 3'UTR）的熒光素酶活性，而沒(méi)有改變突變組（MUT -circ_0072083，MUT-NANOG 3'UTR 和 MUT-ALKBH5 3'UTR）。 上海課題
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)