遼寧標書實驗外包

來源: 發布時間:2021-11-06

4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細胞轉移中發揮作用

據報道,外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結合蛋白來轉運。通過RNApull-down分析和質譜分析,鑒定了三種可能參與miR-934轉運的RNA結合蛋白,并發現敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達(Fig.4a,b)。hnRNPA2B1是一種RNA結合蛋白,通過與特定基序GGAG/CCCU結合,參與miRNAs的運輸和轉錄后調控。特別是,由于miR-934序列中有兩個GGAG基序,我們推測hnRNPA2B1可能通過與GGAG序列結合,介導miR-934包裝成外泌體的過程。此外,miRNApull-down分析顯示,在細胞質和外泌體中,miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結合關系,然而,突變miR-934的結合序列(GGAG)可削弱這種結合(Fig.4c)。RNA免疫沉淀分析進一步證明,無論是在CRC細胞及其外泌體裂解物中,miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集(Fig.4d)。此外,敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細胞轉移到巨噬細胞的過程(Fig.4e)。因此,這些結果證實hnRNPA2B1可以通過與miR-934的GGAG序列結合,介導miR-934包裝到CRC細胞外泌體中,并將外泌體miR-934轉移到巨噬細胞中。 腸道微生物群和循環代謝產物之間的聯系.遼寧標書實驗外包

6.ELNAT1通過UBC9誘導的hnRNPA1的SUMOylation被封裝到EVs中

UBC9可以催化靶蛋白的SUMOylation來調節它們與生物分子的相互作用和細胞運輸。Figure6A顯示,通過co-IP分析,觀察到一個明顯的15~25kDa條帶被hnRNPA1特異性富集。此外,IP分析顯示UBC9過表達增強了hnRNPA1的SUMO2連接,表明UBC9誘導hnRNPA1的SUMOylation(Figure6B)。將hnRNPA1中SUMOylation修飾的位點賴氨酸3(K3)和賴氨酸113(K113)用精氨酸替代(Figure6C),并通過co-IP分析表明,證明了hnRNPA1中SUMOylation修飾的位點是K113(Figure6D)。ELNAT1過表達上調了hnRNPA1K113的SUMO化,而敲除UBC9則消除了這個影響(Figure6E)。 糖尿病標書國家自然科學基金采用UPGMAPCoA和NMDS評估不同群體的腸道菌群β-多樣性.

為了證實FOXO3A/LINC00926/PGK1通路的體內表型,我們首先通過將MDA-MB-231細胞注射到BALB/c小鼠的乳腺脂肪墊上,研究了LINC00926/PGK1軸對乳腺*生長的影響。與預期的一樣,下調LINC00926***增加了乳腺**的生長。相反,當PGK1被敲除時,**生長被***。更重要的是,當PGK1被敲除時,LINC00926敲除對**生長的影響***減弱(圖7A-7C)。接下來,我們研究了FOXO3A/LINC00926軸對乳腺*生長的影響。結果顯示FOXO3A過表達***降低了乳腺*的生長。當LINC00926敲低時,**生長增加,FOXO3A過表達對**生長的影響***減弱(圖7D-7F)。接下來,我們研究了該途徑對乳腺*轉移的影響。與對照組相比,LINC00926基因***組在整個肺區域擴散的結節數量明顯增加(圖7G)。相反,PGK1基因敲低導致乳腺*細胞向肺轉移擴散的減少。然而,PGK1下調極大地減弱了下調LINC00926調節肺轉移的能力(圖7G)。與**生長實驗結果一致,下調LINC00926***減弱了FOXO3A調控肺轉移的能力

6)MAPK1-109aa通過競爭性結合MEK1來抑制MAPK1的磷酸化

為了研究MAPK1-109aa抑制GC的分子機制,我們將標記的MAPK1-109aa質粒轉染HEK293T細胞。在flag標記的MAPK1-109aa免疫沉淀復合物中,潛在的相互作用蛋白被拉下(圖7a)。采用蛋白MS分析對差異表達蛋白進行鑒定。在被識別的蛋白質列表中,豐度比較高的蛋白質是MEK1,表明MEK1是MAPK1-109aa潛在的相互作用蛋白(圖7b,c)。此外,flag標記的MAPK1-109aa可以與MEK1相互作用,證實了MAPK1-109aa與MEK1之間的直接相互作用(圖7d)。免疫熒光染色顯示MAPK1-109aa與MEK1共定位(圖7e)。此外,我們采用MEK1抗體免疫共沉淀,探討MAPK1-109aa對MAPK1通路的潛在調控作用。 circSDHC是一個很有前景的RCC患者潛在的預后生物標志物和***靶點。

tiRNA-Gly通過RBM17調節增殖或遷移相關基因的選擇性剪接

由于RBM17是一種參與mRNA選擇性剪接的剪接體蛋白,研究tiRNA-Gly在與RBM17結合時是否調節下游基因的選擇性剪接將是一項有趣的研究。對過表達tiRNA-Gly后的K1細胞系進行RNA測序,所有的選擇性剪切事件如6A所示,外顯子跳躍(cassette外顯子)占37.67%,A5SSs剪接占6.78%,A3SSs剪接占4.99%,備選***外顯子(AltStart)剪接占18.19%,備選末端外顯子(AltEnd)剪接占18.74%,互斥事件(MEXs)占5.12%,內含子保留剪接(IR)占8.51%。外顯子跳躍顯然是tiRNA-Gly誘導的**頻繁的選擇性剪接事件。MAP4K4、POSTN、HACE1、DPP9和BRCA1是外顯子跳躍導致表達變化比較大的基因。tiRNA-Gly誘導了MAK4K4第16外顯子的跳躍,POSTN第21外顯子的跳躍,HACE1第8外顯子的跳躍,DPP9第21外顯子的跳躍和BRCA1第13外顯子的跳躍(圖6B)。如圖6C-D所示,升高的tiRNA-Gly誘導了MAP4K4一個截斷型(NM_4834.4)的mRNA水平,降低了一個長型(NM_1242560.1)的mRNA水平,而下調的RBM17則起相反的作用。重要的是,RBM17的敲除阻斷了由tiRNA-Gly誘導的MAP4K4截斷變體(NM_4834.4)的增加,表明tiRNA-Gly誘導的選擇性剪接依賴于RBM17。 在786-O和A498細胞中CDKN3敲除后的western blot分析證實了這一關系.糖尿病標書國家自然科學基金

間接量熱法測定平均呼吸交換商(RQ值)在SCI + FMT組恢復正常。遼寧標書實驗外包

npm1突變的AML原始病例中,免疫表型集群3和8的豐度明顯較高,這些集群3和8表型原始,由表達低水平的骨髓單核細胞分化標志物的CD34+ CD38lo(3)或CD34 CD38lo(8)細胞組成(圖4C, D,補充圖21)。非***白血病集群為CD34,但表達少量的骨髓單核細胞標記物。相比之下,npm1突變的急性髓細胞白血病committed 病例顯示出5個免疫表型集群(1,7,16,22和24)的豐度高于原始病例(圖4B, D)。這些免疫表型集群包括CD34?/lo CD38+ CD11c+細胞也表達CD33、CD14、CD16和HLA-DR的各種組合,顯示出異常的骨髓單核細胞分化(圖4C,補充圖21A)。在原始病例中,***原始免疫表型聚集的總豐度較低(平均值(9.4±11.4%),***分化免疫表型聚集(平均53±37%)。遼寧標書實驗外包

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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