miR-335-5p在來源于轉移性CRC細胞的外泌體中高表達
作者進行miRNA測序以確定SW480-exo或SW620-exo中的miRNA表達譜。結果發現SW480-exo和SW620-exo具有顯著不同的miRNA表達譜,并確定了77個miRNA的倍數變化大于5。通過定量PCR,證實miR-335-5p在SW620-exo中的表達比在SW480-exo中更高。并使用來自TCGA數據庫的miRNA和mRNA表達數據,證實了CRC中的miR-335-5p相對于正常樣本顯著升高,以及miR-335-5p高表達的病例的總體存活率較低。為了探索miR-335-5p在CRC中的功能,作者對miR-335-5p高或低表達的CRC樣本中表達的基因進行了基因集富集分析(GSEA)分析。確定了兩種生物學途徑的顯著富集:Ras蛋白信號轉導和Ras蛋白信號轉導的調節。這些結果表明SW620外泌體具有較高水平的miR-335-5p,miR-335-5p在CRC中的功能可能與Ras信號通路的***有關。 公共比較毒理基因組學數據庫。MCD誘導課題基礎實驗外包
為了證明ELNAT1與BCa分泌的EV的關系,作者從BCa細胞培養基中分離出EVs,采用透射電子顯微鏡(TEM)、納米粒子**分析(NTA)及對EVs的蛋白標志物檢測,證明了作者準確分離出BCa分泌的EV(Figure 2 J-L)。并且從BCa患者和健康志愿者尿液樣本中分離的EVs中檢測ELNAT1的表達,發現ELNAT1在BCa分泌的EV中過表達(Figure 2 I)。以上數據表明,EVs介導的ELNAT1過表達與淋巴結轉移相關。
3.EVs介導的ELNAT1促進BCa體內外淋巴管生成和淋巴轉移
為了確定EV介導的ELNAT1是否促進體外淋巴管生成,作者用HLECs孵育BCa細胞分泌的EVs的檢測管形成和遷移。研究發現,干擾ELNAT1基因會破壞UM-UC-3和T24細胞分泌EVs誘導HLECs管形成和遷移的能力(Figure3A-C),這些結果表明EVs介導的ELNAT1誘導了體外淋巴管生成。為 pcr課題第三方實驗室英拜生物對實驗可行性分析。
2021年,美國華盛頓大學生物醫學信息學與醫學教育系和華盛頓大學兒科等團隊合作在Elife(IF=7.08) 雜志上發表了文章“Simultaneous trimodal single-cell measurement of transcripts, epitopes, and chromatin accessibility using TEA-seq.”。此報道開發了一種新的scATAC-seq工作流程,增加了信噪比,并允許對細胞表面標記物和染色質可及性進行配對測量:染色質環境和表位的整合細胞索引,稱為ICICLE-seq。用基于液滴的多組學平臺擴展了這種方法,開發了一種三峰分析方法,可以同時測量數千個單細胞的轉錄組學(scRNA-seq)、表位和染色質可及性(scATAC-seq),并稱之為TEA-seq。這些多模式單細胞檢測提供了一個新的工具箱來識別基于表型定義的細胞類型的類型特異性基因調控和表達。
2、HMH-exo增強低轉移性HCC細胞系的轉移潛力
為了探究HCC轉移時外泌體在細胞與細胞串擾中的可能作用,作者實驗HMH-exo預處理低轉移性的HCC細胞系。結果發現,與LMH-exo或者PBS預處理組相比,HMH-exo***增強了低轉移性HCC細胞系的轉移能力;隨后作者使用低轉移性HCC細胞系構建了體內原位異種移植瘤模型,成瘤后使用外泌體***6周,***檢測肝臟**和肺轉移,結果顯示與其它組相比,HMH-exo組的肝臟**更大,肺轉移結節更多。(圖2)。這些結果表明HMH-exo可以在體內外增強低轉移性HCC細胞的轉移能力。 提供***科研設計咨詢及輔助實驗。
固醇調控元件結合蛋白(SREBPs)是***高脂血癥特征性膽固醇、脂肪酸和甘油三酯生物合成的主要轉錄因子。本研究中發現了一種小分子,白樺素,它通過誘導SREBP裂解***蛋白(SCAP) 與Insig相互作用特異性地抑制SREBP的成熟,進而降低膽固醇和脂肪酸的生物合成,改善飲食誘導的肥胖,降低血清和組織中的脂質含量,提高胰島素敏感性,減小***斑塊的大小。樺樹皮中含有豐富的白樺素,有望成為開發***高脂血癥藥物的先導化合物。本研究于2021年1月發表在《Cell Metabolism》IF:21.567期刊上。英拜生物致力于分子生物行業十余年。武漢課題基礎實驗外包
完善的實驗平臺提供可視化的建模服務。MCD誘導課題基礎實驗外包
接下來研究RASA1是否參與了CRC細胞中外泌體miR-335-5p對遷移、侵襲和EMT的誘導。蛋白質印跡分析顯示,miR-335-5p模擬物-exo增加了Ras和波形蛋白的蛋白水平,但降低了RASA1和E-鈣粘蛋白的蛋白水平;對于RASA1過表達,觀察到這些蛋白質的反向表達趨勢。此外,RASA1過表達逆轉了miR-335-5p模擬物-exo誘導的SW480細胞遷移和侵襲。這些結果表明外泌體miR-335-5p可能通過靶向RASA1誘導遷移、侵襲和EMT。
該研究揭示了外泌體 miR-335-5p 在 CRC 轉移中的新功能,并闡明了外泌體包裹的 miR-335-5p 通過直接靶向 RASA1 促進 CRC 細胞侵襲、轉移和 EMT 轉化。 這些發現強烈表明外泌體 miR-335-5p 可能是一種預后生物標志物,并為解決 CRC 轉移提供有價值的***策略。 MCD誘導課題基礎實驗外包
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗