6、MiR-199a-5p改善MRL/lpr小鼠疾病
接下來，在體內(nèi)評估了miR-199a-5p對MRL/lpr小鼠的影響。17周齡MRL/lpr小鼠每4天注射20nmolmiR-199a-5pagomir或?qū)φ?agomirnc)，共4周(圖6A)。末次注射后48h處死小鼠，分離脾臟CD4+T細(xì)胞。與對照組相比，miR-199a-5pagomir處理組顯示miR-199a-5p水平升高(圖6B)，Sirt1表達(dá)降低(圖6C)，衰老標(biāo)志物p21和p16的表達(dá)***上調(diào)(圖6D)。這些數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p增加MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞衰老。
接下來，研究系統(tǒng)給予miR-199a-5p agomir是否能挽救MRL/lpr小鼠的狼瘡表型。與agomir nc組相比，miR-199a-5p agomir處理組脾臟和淋巴結(jié)明顯縮小(圖7A-B)，血清中anti-dsDNA抗體、IgG水平下降(圖7D-E)。血清ANA水平有下降趨勢(圖7C)。miR-199a-5p agomir處理組的腎損傷，表現(xiàn)為尿蛋白下降（圖7F），腎小球增大和細(xì)胞增生減少(圖7G)，外周***袢中IgG沉積減少(圖7h)。綜上所述，這些數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs移植通過miR -199a-5p介導(dǎo)的Sirt1信號下調(diào)從而增加脾CD4+ T細(xì)胞的衰老，改善MRL/lpr小鼠的疾病表型。 了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。內(nèi)分泌課題歡迎咨詢
2）Pex增強(qiáng)肝衛(wèi)星細(xì)胞(HSCs)的活性
為了證實(shí)Pex的生物學(xué)功能，將原代小鼠肝細(xì)胞與Pex孵育，Pex被受體細(xì)胞吸收。然后使用免疫熒光染色對原發(fā)性肝細(xì)胞的類型進(jìn)行表征，結(jié)果顯示，desmin+HSCs和F4/80+Kupffer細(xì)胞吸收了Pex(圖2A)。我們接下來研究了Pex對HSCs生物學(xué)行為的影響，發(fā)現(xiàn)Pex***增強(qiáng)了HSCs的增殖和遷移能力(圖2B和C)。Pex與Npex處理的HSCs的凋亡沒有***差異(圖2D)。westernblot和免疫熒光檢測結(jié)果顯示，Pex***上調(diào)α-SMA的表達(dá)，說明Pex能促進(jìn)HSC的活化(圖2E和F)。我們觀察到Pex可以通過下調(diào)vitronectin和tenascinC的表達(dá)，上調(diào)collagenI和fibronectin的表達(dá)來調(diào)節(jié)HSCs中的ECM分泌(圖2G)。 泌尿課題實(shí)驗(yàn)外包***ATM對PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。
七、YTHDF1-FZD7-b-catenin軸促進(jìn)胃*進(jìn)展
A和B, Western blot分析YTHDF1、FZD7、B -catenin和***的B -catenin在YTHDF1敲低的MGC-803 (A)和HGC-27 (B)細(xì)胞中轉(zhuǎn)染FZD7構(gòu)建物或空載體對照。C和D，如上所述MGC-803 (C)和HGC-27 (D)細(xì)胞的增殖。E，如上所述MGC-803(左)和HGC-27(右)細(xì)胞的遷移分析。F，如上所述MGC-803(左)和HGC-27(右)細(xì)胞的侵襲分析。G，熱圖顯示YTHDF1, FZD7，(總)b-catenin在人胃*樣本中的表達(dá)結(jié)果(n= 79)。H, YTHDF1、FZD7和(總)b-catenin在人胃*樣本中的表達(dá)的相關(guān)性分析(n= 79;Pearson和Spearman相關(guān)檢驗(yàn))。I，三對胃**及鄰近正常組織中YTHDF1、FZD7、活化b-catenin的代表性IHC芯片結(jié)果。J，胃*患者YTHDF1、FZD7、(total) b-catenin (low, n 39; high, n 40)及總生存率Kaplan Meier分析(log-rank with Mantel Cox test)。K，顯示YTHDF1如何調(diào)節(jié)b-catenin信號通路促進(jìn)胃*進(jìn)展的示意圖。
CircRNF13在鼻咽*臨床樣本中低表達(dá)
作者對NPC細(xì)胞進(jìn)行高通量測序獲得cicRNA表達(dá)譜，總計(jì)鑒定到6153個(gè)circRNAs，并包括了5種類型的circRNA。其中豐度較高的circRNF13相對于非**的鼻炎上皮細(xì)胞（NPE），在NPC中***下調(diào)。circRNF13是有外顯子8和外顯子2反向剪切形成，在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中均有分布，并且可在RNaseR處理下穩(wěn)定存在。以上結(jié)果表明circRNF13可能影響NPC的進(jìn)展。
CircRNF13抑制NPC細(xì)胞的增殖遷移和侵襲
在NPC細(xì)胞系HNE2和CNE2中，過表達(dá)circRNF13都會(huì)***抑制NPC細(xì)胞的增殖，減少G2/M的細(xì)胞比例，以及侵襲和遷移。但是干擾circRNF13的表達(dá)則有完全相反的結(jié)果。提示circRNF13抑制NPC的生物學(xué)功能。 解決了對確定因果調(diào)節(jié)機(jī)制網(wǎng)絡(luò)的方法的關(guān)鍵需求。
LncExpDB提供101293個(gè)人類lncRNA基因（對應(yīng)于331244個(gè)轉(zhuǎn)錄本）***且高質(zhì)量的**。它包含了這些lncRNA在337個(gè)生物學(xué)條件下的豐富表達(dá)譜，這些條件屬于九個(gè)重要的生物學(xué)背景，涉及正常組織/細(xì)胞系、*細(xì)胞系、亞細(xì)胞定位、外泌體、細(xì)胞分化、植入前胚胎、***發(fā)育、晝夜節(jié)律和病毒***.此外，LncExpDB識別了25191個(gè)特征lncRNA基因，并表征了24508個(gè)lncRNA基因和17345個(gè)mRNA基因之間的28443865個(gè)共表達(dá)相互作用。
基于跨多個(gè)生物環(huán)境的綜合表達(dá)譜，LncExpDB具有增值管理和分析功能，可提供可靠轉(zhuǎn)錄的lncRNA基因。因此，我們發(fā)現(xiàn)92016個(gè)lncRNA基因（90.8%）得到可靠轉(zhuǎn)錄證據(jù)的支持（表達(dá)值閾值為1TPM），在九個(gè)生物學(xué)背景中分布不均。在可靠轉(zhuǎn)錄的基因中，大多數(shù)(82.6%)在至少兩種生物環(huán)境中表達(dá)，3318個(gè)lncRNAs(3.6%)在所有9種環(huán)境中表達(dá)。 英拜生物對實(shí)驗(yàn)可行性分析。臨床醫(yī)學(xué)課題贈(zèng)送提供技術(shù)路線
公共比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫。內(nèi)分泌課題歡迎咨詢
2021年5月，***一篇發(fā)表在cancer research（IF=12.7000）的文章（YTHDF1 Promotes Gastric Carcinogenesis by Controlling Translation of FZD7）。此研究分析了cBioPortal (cBio cancer Genomics Portal)630例原發(fā)性胃腺*數(shù)據(jù)集，發(fā)現(xiàn)YTHDF1（m6A讀取蛋白）的突變主要是基因擴(kuò)增，導(dǎo)致其過表達(dá)。YTHDF1的高表達(dá)與更具侵襲性的**進(jìn)展和較差的總生存期相關(guān)。抑制YTHDF1在體內(nèi)外均可抑制胃*細(xì)胞增殖和**發(fā)生。在機(jī)制上，YTHDF1以m6依賴的方式促進(jìn)了Wnt關(guān)鍵受體frizzled7 (FZD7)的翻譯，突變的YTHDF1增強(qiáng)了FZD7的表達(dá)，導(dǎo)致Wnt/b-catenin通路的過度***，促進(jìn)了胃*的發(fā)生。我們的研究結(jié)果表明，YTHDF1及其m6a介導(dǎo)的Wnt/b-catenin信號通路在胃*中的致*作用，為靶向此類表觀遺傳調(diào)控因子提供了一種新的方法內(nèi)分泌課題歡迎咨詢
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)