2、miR-208b由結腸*細胞以外泌體的方式分泌
隨后,作者探究了miR-208b的存在方式是否由外泌體介導。分離鑒定了3株CRC細胞系的外泌體,并檢測了其中miR-208b的表達。外泌體中miR-208b的表達模式和在細胞中的模式一致,在SW480-OXA***高于SW480***高于NCM460。這些結果表明CRC中miR-208b的是以外泌體的模式分泌,這可能和順鉑化療敏感性有關。
3、SW480細胞分泌的外泌體miR-208b促進Treg擴增
前人研究表明順鉑會影響**免疫微環境。MiRNA可能通過促進Treg擴增誘導免疫侵襲。因此,作者探究了CRC分泌外泌體miR-208b對T細胞分化的影響。使用siRNA去除miR-208b,然后收集外泌體,將含有不同水平miR-208b的外泌體與原代CD4+T細胞共培養(圖4A-B)。6h后,受體CD4+T細胞中miR-208b***增加,尤其是SW480-OXA組,而外泌體miR-208b缺失組則沒有***改變,表明CD4+T細胞中miR-208b是由外泌體傳輸(圖4C-D)。此外,SW480和SW480-OXA來源外泌體處理組的CD4+CD25highFoxp3+Tregs細胞數***增加,而外泌體miR-208b缺失對其陽性細胞數則沒有明顯影響。表明外泌體miR-208b促進Treg擴增。 m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。廣州智力障礙拷貝數科研
6.水蘇糖減輕DHEA誘導的多囊卵巢綜合征大鼠卵巢功能障礙
為了確定水蘇糖是否參與了Tempol對PCOS大鼠的有益作用,DHEA處理的大鼠給予200mg/kg水蘇糖12天。水蘇糖給藥對體重沒有明顯影響(圖8A),但改善了PCOS大鼠的動情周期紊亂(圖8B)。H&E染色表明,水蘇糖可減少卵巢囊泡數量,增加黃體形成(圖8C-E)。水蘇糖還可***降低PCOS大鼠血清睪酮水平的升高(圖8F)。上述結果提示水蘇糖確實改善了PCOS大鼠卵巢功能障礙,改善了卵巢組織病理損傷。
綜上所述,Tempol通過降低腸道氧化應激、恢復腸道失調、調節腸道微生物和宿主代謝產物之間的相互作用來保護DHEA誘導的多囊卵巢綜合征(PCOS)(圖9)。這些結果表明Tempol是一種潛在的***多囊卵巢綜合征的策略。 肥胖因子科研中標率高代謝變化被認為是腸病**重要的特征之一。
三、INPP4B促進晚期核內體上PI(3,4)P2到PI(3)P的轉化
使用了幾種基于無偏性蛋白質組學的技術來表征INPP4B在pik3a突變ER+乳腺*中的下游信號功能。首先,利用液相色譜-串聯質譜(LC-MS/MS)進行全細胞蛋白質組學研究,確定GFP-INPP4B與gfp載體表達MCF-7細胞中蛋白水平的差異(2倍)。功能注釋分析顯示,inpp4b過表達細胞中上調的蛋白與內溶酶體系統密切相關,內溶酶體系統是介導細胞外受體和貨物內化和降解的囊泡運輸途徑(圖3a)。免疫沉淀質譜(IP-MS)對受EGF刺激的MCF-7細胞進行GFP-INPP4B蛋白復合物的分析,以***I類PI3K信號。從該分析中鑒定出的**富集的結合伙伴是RAB7A (Rab7),這是一種定位于晚期核內體的小GTPase(圖3b)。GFP-INPP4B與內源性Rab7的共免疫共沉淀證實了INPP4B與Rab7的結合(圖3c)。通過免疫電鏡進一步分析INPP4B定位于晚期核內體,結果顯示GFPINPP4B定位于晚期核內體的限制膜和內膜(圖3d),之前的研究已經確定了PI(3,4)P2和PI(3)P。
為了確定CDK4 /6i誘導的記憶形成是否通過細胞周期的RB介導的G1期阻滯,用G1阻滯劑處理細胞,胸腺嘧啶,通過阻止DNA合成和進入S期,**于RB的誘導G1阻滯。結果顯示胸腺嘧啶處理的細胞表型復制了CDK4/6抑制,并在很大程度上挽救了Rb1 KO細胞中Tcm的形成(Fig. 3J) ,表明RB介導的G1阻滯本身有助于CDK4 /6i誘導的記憶分化。通過3'RNA-seq進一步分析Rb1 KO細胞,發現記憶相關基因下調和效應標記增加(圖3K-L),CDK4/6抑制后未能逆轉(圖3M-N)。這些結果表明CDK4/6i介導的轉錄重編程和記憶形成是通過RB依賴的G1細胞周期停滯和同時抑制CDK4/6信號轉導。大黃酸能緩解D。SS誘導的小鼠慢性結腸炎。
三、INPP4B促進晚期核內體上PI(3,4)P2到PI(3)P的轉化
使用了幾種基于無偏性蛋白質組學的技術來表征INPP4B在pik3a突變ER+乳腺*中的下游信號功能。首先,利用液相色譜-串聯質譜(LC-MS/MS)進行全細胞蛋白質組學研究,確定GFP-INPP4B與gfp載體表達MCF-7細胞中蛋白水平的差異(2倍)。功能注釋分析顯示,inpp4b過表達細胞中上調的蛋白與內溶酶體系統密切相關,內溶酶體系統是介導細胞外受體和貨物內化和降解的囊泡運輸途徑(圖3a)。免疫沉淀質譜(IP-MS)對受EGF刺激的MCF-7細胞進行GFP-INPP4B蛋白復合物的分析,以***I類PI3K信號。從該分析中鑒定出的**富集的結合伙伴是RAB7A (Rab7),這是一種定位于晚期核內體的小GTPase(圖3b)。GFP-INPP4B與內源性Rab7的共免疫共沉淀證實了INPP4B與Rab7的結合(圖3c)。通過免疫電鏡進一步分析INPP4B定位于晚期核內體,結果顯示GFPINPP4B定位于晚期核內體的限制膜和內膜(圖3d),之前的研究已經確定了PI(3,4)P2和PI(3)P。在皂苷處理的MCF-7細胞中,觀察到內源性INPP4B與HARab7WT或HA-Rab7Q67L共同定位于cd63陽性的晚期核內體(圖3e)。 大黃酸導致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。武漢小鼠腸道科研
N6甲基腺苷(m6A)是一種常見的真核細胞mRNA修飾。廣州智力障礙拷貝數科研
盡管轉錄組學技術在過去幾十年中發展迅速,但由于芯片和RNA-seq之間固有的可變性差異,對混合數據的綜合分析仍然具有挑戰性。本文提出了Rank-In(/rank-in/)來糾正兩種技術之間的非生物效應,從而能夠自由混合數據以進行整合分析。網站首頁如下,支持上傳用戶自己的芯片、轉錄組數據。該網頁**終會給出調整后的矩陣、差異基因列表以及聚類結果圖第一步:上傳表達文件表達文件格式如下,需上傳***行為樣本名、***列為基因名的表達矩陣轉錄組數據表達量可以使用FPKM、TPM或TMM;芯片數據使用基因表達強度;如果下載GEO數據,需要對探針注釋為基因,然后上傳注釋后的表達文件。第二步:上傳分組文件分組文件***列文樣本名,第二列為分組。“1”表示來自正常組織的樣本,“2”表示**亞型1的樣本,“3”表示**亞型2的樣本,依此類推 廣州智力障礙拷貝數科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗