4、RBM17促進PTC細胞的增殖和遷移,并在PTC**組織中升高
接下來探究RBM17在PTC細胞中的功能,RBM17的mRNA和蛋白表達在K1細胞系中遠低于TPC-1和BC***細胞,其表達趨勢類似于tiRNA-Gly(圖4A-B)。于是構建了RBM17過表達的K1細胞系,發現其增殖和遷移曾麗***增加(圖4C-F)。RBM17敲低則效果相反(圖4G-J)。此外,RBM蛋白表達在PTC**組織中***高于*旁組織(圖4K)。以上結果表明RBM17的作用和tiRNA-Gly相似,在PTC中促進**進展。
5、RBM17的衰減抑制了tiRNA-Gly對PTC細胞的影響,RBM17在PTC組織中的表達受tiRNA-Gly的調控
隨后,作者分別檢測了人PTC組織中tiRNA-Gly高表達和tiRNA-Gly低表達的組織樣本中RBM17的表達水平,結果發現與預期一致,tiRNA-Gly高表達組RBM17的表達也***高于tiRNA-Gly低表達組(圖5A)。進行了類似于拯救實驗,即過表達tiRNA-Gly組,敲除RBM17組,以及過表達tiRNA-Gly的同時敲除RBM17組,結果表明,tiRNA-Gly過表達+siRBM17同時處理可以部分消除單獨處理時引起的TPC-1和BC***細胞增殖和遷移的改變(圖5B-C)。體內實驗表明,tiRNA-Gly敲低導致RBM17的表達急劇性下降(圖5D)。總之,tiRNA-Gly對PTC增殖和遷移的作用依賴于RBM17。 m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。KEGG科研
六、多組學方法分析表征近端小管細胞子集
Cicero研究了從PT到PT_VCAM1轉變過程中染色質可及性的變化。VCAM1和TPM1轉錄增加(圖6a)與VCAM1基因體和啟動子區域染色質可及性增加相關(圖6b,c)。同樣,SLC5A12和SLC4A4轉錄降低(圖6c)與染色質可及性降低相關(圖6c,補充圖15)。通過評估chromVAR轉錄因子的活性,我們發現了可能調節近端小管和PT_VCAM1之間過渡的轉錄因子。有趣的是,近端小管顯示出強大的HNF4A活性,該活性在PT_VCAM1簇中降低,并與增加的REL和RELA活性相一致(圖6d)。我們在PT_VCAM1細胞核中驗證了減少的HNF4A蛋白表達(圖6e)。我們從VCAM1基因體中鑒定出一個約60kb的開放染色質區域,該區域包含一個與VCAM1啟動子相互作用的RELA基序(通過ciscoaccessibilitynetwork)。實際上,ChIP-qPCR擴增了該位點,使其能夠與RELA結合(圖6f,補充圖17b),為該細胞類型中RELA調控VCAM1表達提供了實驗證據。 代謝組學科研服務兩年外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化促進CRC肝轉移。
FOXP4是miR-101-3p和miR-423-5p的靶點
為了進一步了解miR-101-3p和miR-423-5p如何影響**進展,我們使用TargetScan和RNA22預測工具確定了它們的潛在靶點。我們選擇了6個在兩個數據庫中均被miRNA調控的基因作為潛在靶點進行評估,分別是FOXP4、PLCB1、ANKRD52、ANGPTL2、DL***3、a和DCUN1D3(圖4A)。由于FOXP4已知在胚胎發育和**發生中有作用,因此選擇該基因進行進一步研究。經westernblotting檢測,轉染miR-101-3p或miR-423-5p的Daoy細胞顯示內源性FOXP4蛋白表達降低。此外,HEK293T細胞中的熒光素酶報告基因檢測顯示,這兩種miRNA的過表達均***抑制FOXP4-3'UTR驅動的熒光素酶活性。然而,miR-101-3p或miR-423-5p與FOXP43'UTR共轉染后,熒光素酶活性未見***變化。這表明FOXP4可能是MB中miR-101-3p和miR423-5p的直接和功能靶點。
色素瘤甲基化PCR芯片用于研究在黑色素瘤中低甲基化和高甲基化的22個基因的啟動子甲基化狀態。黑色素瘤占皮膚*不到5%,但80%的人死亡,說明疾病的**性和惡性。表觀遺傳研究低甲基化和高甲基化**抑制基因鑒定了黑色素瘤新的***靶標。這個芯片上的基因包括全基因組分析發現在黑色素瘤中經常發生高甲基化的基因,以及參與黑色素瘤發生和進程的基因。利用這些芯片分析細胞或新鮮組織基因組DNA樣本有助于關聯CpG島甲基化狀態與生物表型。結果還可以洞察**發生和進程,及其病理背后的分子機制和生物學通路。利用這個芯片,通過簡單的限制性內切酶消化和實時定量PCR,就可以研究分析22個參與黑色素瘤起始和進程的不同基因的啟動子甲基化狀態。大黃酸處理改變腸道菌群組成。
circRNAs已經成為重要的生物調節因子。小編***給大家帶來2021年5月發表于影響因子為16.102的Ann Rheum Dis雜志上題為"circPDE4B prevents articular cartilage degeneration and promotes repair by acting as a scaffold for RIC8A and MID1"的文章。在本研究中,作者旨在闡明circPDE4B的作用,據報道,該circRNAs在骨關節炎(OA)組織中下調。我們體外研究了circPDE4B在人和小鼠軟骨細胞中的作用。通過RNA下拉-質譜分析、免疫共沉淀、谷胱甘肽- S-轉移酶下拉、RNA免疫共沉淀,驗證了circPDE4B與RIC8A)/ MID1復合物的相互作用。采用小鼠OA模型證實了circPDE4B在體內OA發病機制中的作用。本研究強調了circPDE4B-RIC8A軸在OA關節中的功能及其對MAPK-p38的調控,提示這一軸可能是OA的***靶點。大黃酸處理沒有改變乳酸菌尿酸的產生。湖北佝僂病大鼠模型科研
英拜的實驗室坐落在上海漕河涇園區浦江園區。KEGG科研
6、MiR-199a-5p改善MRL/lpr小鼠疾病
接下來,在體內評估了miR-199a-5p對MRL/lpr小鼠的影響。17周齡MRL/lpr小鼠每4天注射20nmolmiR-199a-5pagomir或對照(agomirnc),共4周(圖6A)。末次注射后48h處死小鼠,分離脾臟CD4+T細胞。與對照組相比,miR-199a-5pagomir處理組顯示miR-199a-5p水平升高(圖6B),Sirt1表達降低(圖6C),衰老標志物p21和p16的表達***上調(圖6D)。這些數據表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p增加MRL/lpr脾CD4+T細胞衰老。
接下來,研究系統給予miR-199a-5p agomir是否能挽救MRL/lpr小鼠的狼瘡表型。與agomir nc組相比,miR-199a-5p agomir處理組脾臟和淋巴結明顯縮小(圖7A-B),血清中anti-dsDNA抗體、IgG水平下降(圖7D-E)。血清ANA水平有下降趨勢(圖7C)。miR-199a-5p agomir處理組的腎損傷,表現為尿蛋白下降(圖7F),腎小球增大和細胞增生減少(圖7G),外周***袢中IgG沉積減少(圖7h)。綜上所述,這些數據表明hUC-MSCs移植通過miR -199a-5p介導的Sirt1信號下調從而增加脾CD4+ T細胞的衰老,改善MRL/lpr小鼠的疾病表型。 KEGG科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗