外泌體circ_0072083的分泌依賴于TMZ抗性神經膠質瘤細胞中的Warburg效應
為了探索circ_0072083是否通過外泌體攜帶，從TMZ抗性和敏感細胞的培養基中分離外泌體。外泌體通過TEM 確認。大小主要在 100-200 nm，抗性細胞比敏感細胞具有更高濃度的外泌體。外泌體還通過特定標記物（CD63、CD81 和 TSG101）鑒定。此外，與 U251 和 U87 細胞相比，U251/TR 和 U87/TR 細胞中的外泌體 circ_0072083 水平明顯升高。此外，在抗性細胞中發現了比敏感細胞更高的 Warburg 效應，這通過乳酸產生、葡萄糖攝取和關鍵酶（GLUT1、LDHA 和 PKM2）水平的增加來揭示。 m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。成都血清/血漿芯片科研
進一步使用E8聚類分析顯示，這些暴露于慢性d-flow的ec向免疫細胞樣類型(EndICLT)轉變，但沒有達到完全分化的免疫細胞狀態(圖3C和S3)。圖3D顯示了EC簇中EndMT、Tagln、Acta2、Cnn1和Snai1的四個標記物，分別**了s流(E2)、急性d流(E6)和慢性d流(E8)染色質可及性的變化。與s-流(E2)和急性d-流(E6)相比，慢性d-流在E8的啟動子區域(箭頭)增加了這些基因的可及性。從scRNA-seq數據的小提琴圖中可以看出，E8中相應基因的表達量增加，進一步證實了這一結果(圖3E)。
如圖4所示，與LS相比，慢性OS降低了KLF2和KLF4的表達，同時誘導了EndMT標記物(SNAI1和TAGLN)。重要的是，慢性OS誘導了兩個巨噬細胞標記基因(C1QC和C5AR1)的表達，直接證明了OS可以在體外誘導EndICLT。此外，我們利用小鼠PCL模型進行了一項en - face共免疫染色研究，以確定體內CDH5+ ECs中是否表達巨噬細胞標記蛋白。如圖4A-4D所示，C1QA和LYZ在LCA ECs中明顯被誘導，而在rca中沒有，這為血流誘導的eniclt提供了更有力的證據。我們分析了由基因本體結果確定的d-flow條件***的致***通路(圖2E)。 遼寧轉錄組科研大黃酸處理改變腸道菌群組成。
六、多組學方法分析表征近端小管細胞子集
Cicero研究了從PT到PT_VCAM1轉變過程中染色質可及性的變化。VCAM1和TPM1轉錄增加(圖6a)與VCAM1基因體和啟動子區域染色質可及性增加相關(圖6b,c)。同樣，SLC5A12和SLC4A4轉錄降低(圖6c)與染色質可及性降低相關(圖6c，補充圖15)。通過評估chromVAR轉錄因子的活性，我們發現了可能調節近端小管和PT_VCAM1之間過渡的轉錄因子。有趣的是，近端小管顯示出強大的HNF4A活性，該活性在PT_VCAM1簇中降低，并與增加的REL和RELA活性相一致(圖6d)。我們在PT_VCAM1細胞核中驗證了減少的HNF4A蛋白表達(圖6e)。我們從VCAM1基因體中鑒定出一個約60kb的開放染色質區域，該區域包含一個與VCAM1啟動子相互作用的RELA基序(通過ciscoaccessibilitynetwork)。實際上，ChIP-qPCR擴增了該位點，使其能夠與RELA結合(圖6f，補充圖17b)，為該細胞類型中RELA調控VCAM1表達提供了實驗證據。
與對照組相比，來自轉染miR101/miR-423模擬物的THP-1細胞上清液的外泌體***抑制Daoy細胞的增殖能力。我們用轉染miR-101-3p/miR-423-5p的THP-1單核細胞培養上清液進一步培養Daoy細胞，發現Daoy細胞的增殖能力受到***抑制，而在含GW4869的培養基中培養后則無明顯變化。這些結果表明，對細胞增殖的影響至少部分歸因于外泌體的存在，并且GW4869處理可部分逆轉這些影響。與THP-1細胞類似，我們發現HMO6細胞也能分泌含有miR-101-3p和miR-423-5p的外泌體， MB組織中存在CD68+細胞。***，我們從MB患者和健康對照者的外周血中分離CD14單核細胞。與對照組相比，在MB患者來源的CD14單核細胞培養上清中，外體miR-101-3p和miR-423-5p的表達更高?？傊?，這些結果表明MB患者的單核細胞-巨噬細胞分泌含有miR-101-3p和miR-423-5p的外泌體，這些外泌體可以轉移到MB細胞。英拜有一支高精尖的團隊。
5）過表達miR-337-3p和miR-137抑制子宮內膜*細胞的惡性生物學行為
為了研究miR-337-3p和miR-137在子宮內膜*生物學行為中的可能作用，我們分別用agomir-337-3p/137和antagomir-3373p/137轉染Ishikawa和HEC-1A細胞。使用CCK-8和EdU檢測細胞增殖(圖5A和5B)。傷口愈合和Transwell檢測分別用于評估細胞遷移和侵襲。過表達miR-33373p和miR-137降低了Ishikawa和HEC-1A細胞的遷移和侵襲能力(圖5C和5D)。流式細胞術檢測并分析細胞周期分布(圖5E)。以上實驗結果證實，與miR-NC組相比，miR-337-3p和miR-137過表達***抑制了細胞的增殖、侵襲和遷移。 大黃酸改變嘌呤代謝降低尿酸水平。浙江代謝組學科研
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為了驗證tRFs&tiRNA-Seq數據，作者檢測了91對PTC組織和*旁組織中tRFs&tiRNA的表達，其中，tiRNA-Gly在人類PTC組織中的表達水平比較高，并***高于*旁組織（圖1F-G）。WB顯示，tiRNA-Gly在PTC**中蛋白表達***高于*旁，但是tRNA-Gly的表達在*和*旁中無***差異（圖1H）。總之，tiRNA-Gly可能在PTC的進展中起致*作用。
在小鼠模型中，tiRNA-Gly調節PTC細胞的增殖和遷移，并影響**生長
首先檢測了tiRNA-Gly在3株PTC細胞系中的表達，如圖2A所示，K1細胞系中tiRNA-Gly的表達***低于BCPAP和TPC-1細胞系。因此，對于功能獲得性實驗，合成帶有5’磷酸末端的tiRNA-Gly轉染至K1細胞系（圖2B）。結果發現，與對照組相比，tiRNA-Gly***促進K1細胞的增殖和遷移（圖2C-D）。對于功能缺失實驗，在BCPAP和TPC-1細胞系中轉染siRNA干擾tiRNA-Gly的表達，結果顯示細胞的增殖和遷移都***下降（圖2E-G）。體內實驗得出了類似的結果，干擾tiRNA-Gly表達導致**體積減小，Ki67表達下降。總之，體內體外實驗都表明tiRNA-Gly是PTC的惡性因子。 成都血清/血漿芯片科研
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