使用SmartSeq2協議對15個胎兒的單個細胞進行scRNA-seq處理(圖1 a)。
基于差異表達(DE)分析和按標準化表達***性排序的前20個標記基因。紅細胞(表達HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細胞祖細胞和單核細胞(表達CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細胞、肥大細胞(表達CD63、GATA2和HDC)、漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs;表達IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環pDCs(表達pDC和增殖標記物;例如,MKI67)和粒細胞1、2和3(表達AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細胞分析顯示,在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在***的轉錄異質性,一些表型祖細胞群體(如造血干細胞、MPPs、cmp、gmp、MEPs和CLPs)由超過10個不同的轉錄定義群體組成(圖1c).注釋了23個不同群體(圖1 d). 代謝變化被認為是腸病**重要的特征之一。廣州神經炎癥科研
三、在體內,tbi介導的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制
為了確定TBI是否會損害體內的核質運輸,我們在果蠅運動神經元中過表達了一個帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達nlsnes -GFP的大腦中,GFP信號分布在細胞核和細胞質中(圖3A)。然而,定量分析顯示,在nls - nes -GFP表達的vnc暴露于TBI中,核GFP信號減少的細胞百分比***增加,而核GFP強度***降低(圖3B和C),說明GFP核進口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來,我們在運動神經元中表達了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標記的沒有核輸出活性的GFP蛋白。表達NLS的非創傷性腦損傷動物的腦細胞-ΔNES-GFP顯示了GFP在細胞核的強大定位(圖3A),而創傷性腦損傷動物的vnc顯示了核GFP減少的細胞數量***增加,核GFP強度降低((圖3B和C)。果蠅幼蟲暴露于TBI,并在DMSO單獨、KPT-350(0.05、0.1或0.5 mM)或KPT-276(50、200或1000 nM)上飼養。對經歷過TBI的果蠅幼蟲的羽化試驗顯示,KPT-350處理的動物(圖3D)或KPT-276處理的動物(圖3E)具有***的劑量依賴性的致死抑制。kpt -350處理的果蠅核GFP信號***高于dmso處理的對照組(圖3G)。 壞死科研服務兩年英拜注重客戶的隱私。
PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩定性有關。此外,小鼠胚胎成纖維細胞(mef)中PTEN基因的缺失導致了未修復的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認為通過至少兩種分子機制促進了基因組的完整性。在細胞核中,PTEN與著絲粒結合蛋白CENP-C結合,促進著絲粒組裝和中期到后期的轉變。此外,作為轉錄因子E2F1的輔助因子,核PTEN似乎調節Rad51的表達,Rad51是DNA修復機制的關鍵組成部分。然而,后續的研究得出了不一致的結果,表明PTEN在轉錄水平上對RAD51的調控可能***于特定的細胞環境。
PTEN缺陷改變了多個細胞周期檢查點,可能留下更少的時間進行DNA損傷修復和/或染色體分離。細胞周期的進展需要幾個分子過程的完美執行,以確保一個熟練的,無錯誤的,細胞分裂。這些事件發生的速度由周期蛋白依賴激酶(CDKs)的活性決定,CDKs磷酸化關鍵底物以促進DNA合成和有絲分裂進程。CDKs的催化活性受細胞周期檢查點的調控,這些檢查點監測細胞周期中主要事件的有序執行。檢查點**了故障安全機制,它確保只有在滿足的比較好情況下才允許細胞分裂。
三、沿著推斷分化軌跡的Motif可及性動態
由于技術限制,scRNA-seq難以檢測低豐度轉錄本(如轉錄因子TFs),而通過染色質的可及性可推斷出這些TFs的活性,因此整合scRNA-seq和scATAC-seq方法具有重要意義。研究者利用scATAC-seq檢測了人類胚胎Lin- CD34+ CD38-細胞的單細胞染色質可及性,分別對18、20和21PCW胚胎的肝臟和股骨中的4,001個細胞進行了測序,基于SNN算法,共得到7個不同的可明顯分離的集群 (Figure 3A)。scRNA-seq數據中檢測了所選標記基因的可及性,與干細胞相關的標記基因(如MLLT3、PROM1、FLI1和GATA2)的可及性較高,而與不同譜系相關的基因(如MPO、ALAS2、MPEG1和CD19)的可及性較低,這與分選細胞的未分化特性一致(圖3B)。 上海英拜生物的動物建模實驗。
褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細胞中機械性損傷引起的鐵死亡
為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用,將HT-22細胞系用siRNA轉染,然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質水平。鑒于脂質過氧化是鐵死亡的標志,使用DCF和BODIRY 581/591 C11作為評估了溶質ROS。與對照組+刮擦損傷組相比,siFth +刮擦損傷組細胞的熒光強度顯著增加,表明siFth增強了HT-22細胞中機械刮擦損傷引起的ROS產生的上調。重要的是,與未經***的siFth組相比,用褪黑素處理siFth轉染的HT-22細胞未能顯著減少刮擦損傷后ROS的上調。
m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。肺纖維化小鼠模型科研服務兩年
英拜生物您隨身的科研小助手。廣州神經炎癥科研
使用SmartSeq2協議對15個胎兒的單個細胞進行scRNA-seq處理(圖1a)。基于差異表達(DE)分析和按標準化表達***性排序的前20個標記基因。紅細胞(表達HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細胞祖細胞和單核細胞(表達CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細胞、肥大細胞(表達CD63、GATA2和HDC)、漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs;表達IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環pDCs(表達pDC和增殖標記物;例如,MKI67)和粒細胞1、2和3(表達AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細胞分析顯示,在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在***的轉錄異質性,一些表型祖細胞群體(如造血干細胞、MPPs、cmp、gmp、MEPs和CLPs)由超過10個不同的轉錄定義群體組成(圖1c).注釋了23個不同群體(圖1d).廣州神經炎癥科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗