轉錄組學 (RNA-Seq) 模塊
RNA-seq 模塊對與衰老相關的全基因組轉錄組變化進行編目。RNA-seq 模塊中收集的數據集來自與衰老研究相關的已發表文章。該模塊收集在特定基因干預(過表達、敲除等)時觀察到的轉錄組變化,該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過程中基因表達譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個可能與衰老有關的差異表達基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中,可以通過基因名稱輕松搜索 DEG,并且每個 DEG 條目都包含潛在的實驗條件和基因表達的倍數變化及其發布的來源。可以下載每篇文章中的所有搜索結果和相應的DEG數據庫。 鑒定的前列腺瘤細胞內源性雄***受體網絡。上海凋亡芯片科研
3、外泌體S100A4是HCC細胞轉移潛力的關鍵增強子
為了探究通過HMH-exo增強HCC轉移能力的關鍵,作者對LMH-exo和HMH-exo進行了iTRAQ質譜篩選。結果從HMH-exo中鑒定到116個***上調和43***下調的蛋白質;結果發現了4個蛋白家族的聚類:Apo、PSM、EEF/EIF和S100鈣結合蛋白家族(圖3a-b)。經過文獻分析,作者主要關注了S100鈣結合蛋白家族,并以其中*****差異表達的4個蛋白為主:依次是S100A4,S100A6,S100A10,和S100A11。作者檢測了這4個蛋白在5個HCC細胞系外泌體中的表達豐度,結果發現依然是S100A4的表達水平比較高(圖3c)。因此,初步選擇S100A4進行下一步分析。 藥物保護科研實驗外包專注于生命科學內的前沿研究。
在缺氧條件下的持續***誘導不同的細胞內程序
已知的缺氧信號靶點BNIP3在缺氧下升高,mTORC1在持續刺激下被***(圖3a)。從這四種條件中獲得的RNA序列被用來比較培養物和之前公布的數據之間的轉錄組。主成分分析顯示,所有四個群體的轉錄組都不同(圖3b)。缺氧條件下的持續刺激并沒有誘導持續刺激和缺氧誘導基因的組合,而是驅動了一個不同的轉錄譜(圖3c)。基因本體論表明,連續刺激條件之間共享的基因簇與負調控和代謝變化相關(簇3和簇5)(圖3b)。與缺氧條件下持續刺激相關的基因(聚類1和7)主要由抗病毒和抗增殖基因驅動。
MAP4K4是絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族的成員,可以通過磷酸蛋白MEKK1***MAPK通路。構建pCMV-NM_4834.4和pCMV-NM_1242560.1質粒,分別轉染K1細胞,并通過qRT-PCR驗證了其轉染效率(圖6E)。這兩種變異***增強了K1細胞的增殖和遷移。而截斷型(NM_4834.4)比長型(NM_1242560.1)對增殖和遷移的影響更強(圖6F-G)。此外,MEKK1、MKK4、JNK、MEK、ERK的總磷酸化水平未發生改變,而NM_4834.4和NM_1242560.1兩種變體轉染組的磷酸化水平均高于對照組。更重要的是,與NM_1242560.1相比,NM_4834.4對磷酸-MEKK1、MKK4、JNK、MEK、ERK的影響更強,這表明MAP4K4中第16外顯子的剪切影響了MAPK通路下游蛋白的磷酸化(圖6H)。體內小鼠模型結果證明,注射si-tiRNA-Gly組移植瘤中磷酸化蛋白水平明顯降低,而總蛋白水平與生理鹽水組相比沒有變化(圖6I)。這些結果表明,RBM17介導的tiRNA-Gly誘導的MAP4K4第16外顯子剪接可增強PTC細胞的增殖和遷移,并對MAPK通路下游蛋白進行磷酸化。
總之,本文闡明了tiRNA-Gly結合RBM17的UHM結構域并促進其易位,導致RBM17蛋白增加,從而誘導PTC細胞中靶基因的選擇性剪接,**終促進**進展。 上海英拜生物有經驗豐富的科研團隊。
接下來,我們使用3D分析儀分析NOX4上調后人星形膠質細胞細胞毒性的形態學變化(圖7E)。相對于對照,NOX4的升高誘導了細胞毒性的形態學特征,包括細胞質面積縮小和起泡(圖7E)。此外,與對照組相比,NOX4升高后,形態死亡細胞數量***增加(圖7F)。與形態學分析結果一致,相對于對照,NOX4的升高***增加了細胞毒性水平(圖7G)。這些結果表明,NOX4通過氧化應激誘導的人星形膠質細胞脂質過氧化促進了鐵死亡。結論:NOX4通過線粒體代謝損傷,氧化應激誘導的脂質過氧化作用促進星形膠質細胞的鐵死亡,這是AD期間星形膠質細胞損傷的一種重要分子機制。尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。骨折鼠模型科研整體服務
發現乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。上海凋亡芯片科研
一、異種HSCT前后監測腸道、口腔和鼻腔微生物群和宿主免疫系統。
在1年的時間里,從29名兒童的10個時間點收集糞便樣本、口腔拭子和前鼻孔拭子:在HSCT前2次,HSCT當天,HSCT后1個月每周,以及HSCT后12個月的3個隨訪時間點(圖1)。通過16SrRNA基因譜測定這些樣本中的微生物群落動態。共對709份患者樣本(212份糞便樣本、248份口腔拭子和249份鼻拭子來自10個時間點)進行了鑒定。發現移植前患者的微生物群落組成與健康對照不同;三個身體部位性在HSCT后微生物α多樣性下降;在一年中,微生物群落動態呈現出三個階段:第一階段(在檢查前和適應開始時的樣本),第二階段(HSCT的***天到第1個月),第三階段(月+3到月+12)(圖1C);第一階段和第三階段的樣本在口腔和鼻腔重疊,表明微生物群落可能從較晚的時間點恢復到與造血干細胞移植前類似的狀態。 上海凋亡芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗