外泌體circ_0072083與膠質(zhì)瘤患者的TMZ耐藥、診斷和生存有關(guān)
為了分析外泌體 circ_0072083 在膠質(zhì)瘤患者中的價(jià)值，從患者的血清樣本中分離外泌體。通過(guò) TEM 和特定標(biāo)記物（CD63、CD81 和 TSG101）驗(yàn)證外泌體。此外，大小主要在100-200 nm，并且在耐藥患者中其濃度更高。此外，與TMZ敏感患者（n ?=33）相比，TMZ耐藥患者（n =36）的外泌體circ_0072083水平顯著上調(diào)。此外，通過(guò)將這些外泌體暴露于不同條件來(lái)評(píng)估外泌體 circ_0072083 的穩(wěn)定性，結(jié)果表明 TMZ 耐藥患者中外泌體 circ_0072083 的豐度不受不同孵育時(shí)間和不同 pH 值的顯著影響。此外，外泌體 circ_0072083 可以作為神經(jīng)膠質(zhì)瘤的**診斷靶標(biāo)（AUC= 0.85，P ?< 0.05），并且外泌體 circ_0072083 水平高的患者總生存率較低（P ?< 0.05）。?根據(jù)平均水平將患者分為高（n ?= 36）或低（n = 33）外泌體circ_0072083組。桌子表格11總結(jié)出高外泌體circ_0072083水平與膠質(zhì)瘤患者的**大小、晚期WHO分級(jí)、MGMT甲基化和TMZ抗性相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)表明外泌體circ_0072083在神經(jīng)膠質(zhì)瘤患者中具有重要作用。這表明外泌體circ_0072083可以通過(guò)在Warburg效應(yīng)下調(diào)節(jié)ALKBH5介導(dǎo)的去甲基化來(lái)調(diào)節(jié)miR-1252-5p/NANOG軸來(lái)增加膠質(zhì)瘤中的TMZ抗性。 英拜在全國(guó)各省會(huì)城市均有自己的**客戶。收縮壓科研省自然科學(xué)基金
CD8+T細(xì)胞是**重要的**適應(yīng)性免疫調(diào)節(jié)細(xì)胞，通過(guò)直接殺死*細(xì)胞來(lái)介導(dǎo)抗**免疫。PD-1抑制***CD8+T細(xì)胞以增加T細(xì)胞***，從而導(dǎo)致**消退。因此，CD8+T細(xì)胞的***可能是通過(guò)免疫療法***LSCC的關(guān)鍵。這篇文章以生信分析開篇，篩選出關(guān)鍵基因后在動(dòng)物模型與臨床樣本中進(jìn)行了簡(jiǎn)單的驗(yàn)證。實(shí)驗(yàn)思路如下：
1.下載GEO數(shù)據(jù)并進(jìn)行數(shù)據(jù)篩選下載數(shù)據(jù)集GSE17710，選擇變異系數(shù)＞0.1的5000個(gè)基因進(jìn)行后續(xù)WGCNA分析2.CIBERSORT分析免疫浸潤(rùn)分析獲得每個(gè)樣本中22種免疫細(xì)胞的豐度，選擇T細(xì)胞作為WGCNA分析的性狀**（其中，T細(xì)胞包括7中亞型）3.WGCNA構(gòu)建基因網(wǎng)絡(luò)使用R包“WGCNA”對(duì)5000個(gè)WGCNA分析，構(gòu)建LSCC基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，軟閾值β=5（R2=0.9）構(gòu)建無(wú)標(biāo)度網(wǎng)絡(luò)。動(dòng)態(tài)混合切割來(lái)建立分層聚類樹，樹枝**了一系列具有相似表達(dá)數(shù)據(jù)的基因，每個(gè)樹葉**了樹上的單個(gè)基因。生成了十八個(gè)模塊。 遼寧缺氧信號(hào)通路科研Th1/Th2細(xì)胞失衡也是結(jié)腸炎的一個(gè)重要特征。
3）IGF-1信號(hào)在Pex誘導(dǎo)的HSC活化和肝纖維化中至關(guān)重要
為了進(jìn)一步探索Pex調(diào)控HSC行為的機(jī)制，我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測(cè)序基因表達(dá)譜(圖3A)。在差異表達(dá)基因中，我們觀察到41個(gè)重疊的上調(diào)基因在Pan02exo組與Npex組和KPCexo組與Npex組之間存在部分交集(圖3B)。主要涉及的基因參與細(xì)胞外空間、細(xì)胞外區(qū)域和ECM(圖3C)，表明Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。此外，GO和KEGG通路分析顯示，IGF-1及其下游PI3K/AKT是受Pex影響的排名比較高的信號(hào)通路(圖3D，E)。westernblot分析支持了Pex***增加HSC中IGF-1R、IRS-1和AKT磷酸化的發(fā)現(xiàn)(圖3F)。當(dāng)使用IGF-1R抑制劑時(shí)，Pex誘導(dǎo)的p-IGF-1R、p-IRS-1和p-AKT的上調(diào)被阻斷(圖3G)。基于這些結(jié)果，我們推測(cè)IGF-1信號(hào)可能是介導(dǎo)Pex依賴的HSC活化的關(guān)鍵因素。與預(yù)期的一樣，IGF-1R抑制劑抑制了Pex誘導(dǎo)的HSC的活化、增殖和遷移(圖4A-D)。此外，IGF-1R抑制劑逆轉(zhuǎn)了Pex誘導(dǎo)的HSC中ECM的產(chǎn)生(圖4E)。我們的體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表明，IGF-1R抑制劑可以阻斷Pex誘導(dǎo)的肝纖維化(圖4F-I)。這些數(shù)據(jù)表明IGF-1信號(hào)在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。
6、CDK4/6抑制誘導(dǎo)T細(xì)胞表型與免疫檢查點(diǎn)***的良好反應(yīng)相關(guān)
在臨床小鼠模型中，CDK4/6抑制劑與ICB顯示出***的協(xié)同作用。鑒于**近的研究強(qiáng)調(diào)**微環(huán)境中的干細(xì)胞樣T細(xì)胞是ICB反應(yīng)的關(guān)鍵介質(zhì)，作者假設(shè)CDK4/6i介導(dǎo)的T細(xì)胞記憶誘導(dǎo)產(chǎn)生了更有利的T細(xì)胞池用于免疫檢查點(diǎn)靶向***，因此將有助于該聯(lián)合***的療效。事實(shí)上，這種CDK4/6i應(yīng)答特征富集在ICB應(yīng)答患者的CD8+TIL中，在單細(xì)胞和患者水平準(zhǔn)確分為應(yīng)答者和非應(yīng)答者（Fig.6A-D）。這表明CDK4/6i誘導(dǎo)了T細(xì)胞內(nèi)基因特征，該特征與患者對(duì)ICB的良好反應(yīng)相關(guān)。 英拜提供一年三節(jié)的購(gòu)物卡津貼。
越來(lái)越多的證據(jù)表明細(xì)胞外囊泡（EVs）通過(guò)促進(jìn)實(shí)體**中**-內(nèi)皮細(xì)胞之間的通訊來(lái)刺激血管生成。先前的研究表明miR-144是鼻咽*（NPC）細(xì)胞來(lái)源的EVs中的內(nèi)含物之一，但EVs miR-144對(duì)**內(nèi)皮細(xì)胞和血管生成的影響尚不清楚。2021年3月發(fā)表于“Molecular Therapy”（IF=11.454）的文章“miR-144 delivered by nasopharyngeal carcinoma-derived EVs stimulates angiogenesis through the FBXW7/HIF-1a/VEGF-A axis”對(duì)此展開了研究。本研究旨在探討**源性細(xì)胞外囊泡(EVs)在鼻咽*血管生成中的作用。我們初步采集鼻咽*活檢標(biāo)本。外泌體miR-934誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化促進(jìn)CRC肝轉(zhuǎn)移。重慶腸道菌科研
代謝變化被認(rèn)為是腸病**重要的特征之一。收縮壓科研省自然科學(xué)基金
細(xì)胞間的相互作用在**進(jìn)展和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關(guān)鍵作用。目前關(guān)于這些**細(xì)胞是如何與其他細(xì)胞相互交流的仍有很多是未知的。**釋放的外泌體被認(rèn)為是**進(jìn)行細(xì)胞間溝通的有效介質(zhì)。Dong等探索了肝細(xì)胞*（HCC）外泌體在其轉(zhuǎn)移和預(yù)后價(jià)值中的功能。本文于2021年6月發(fā)表在《Signal Transduction and Targeted Therapy》期刊上，IF：13.493。
1、外泌體的分離與鑒定以及HCC細(xì)胞的釋放和吸收
使用投射電子顯微鏡觀察了外泌體的形態(tài)和形狀；納米粒子**分析發(fā)現(xiàn)外泌體直徑在40-200nm之間，并且在6個(gè)HCC細(xì)胞系外泌體中都檢測(cè)到了外泌體標(biāo)志物CD63，CD9，和Alix的表達(dá)；然后使用DIO標(biāo)記高轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞的外泌體（HMH-exo）和低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞外泌體（LMH-exo），在激光掃描共焦顯微鏡下觀察到綠色標(biāo)記的HMH-exo和LMH-exo都可以被低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞細(xì)胞系有效吸收（圖1）。這些結(jié)果表明已經(jīng)成功分離和純化HCC來(lái)源的外泌體并且他們可以被其它HCC細(xì)胞吸收。 收縮壓科研省自然科學(xué)基金
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7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)