天津課題國家自然科學基金

來源: 發布時間:2021-11-16

為了探討UCP1與AKI之間的相關性,我們在體內、體外檢測了UCP1在AKI模型中的表達。結果顯示,UCP1在AKI小鼠中***下調,更重要的是,隨著腎損傷的加重,其表達量逐漸降低(圖2E-F)。在體外,隨著順鉑刺激時間的延長,HK2細胞中UCP1的表達降低(圖2G)。這些結果表明UCP1與AKI的嚴重程度呈負相關。此外,隨著AKI腎細胞損傷程度的增加,脂質的積累,UCP1的表達逐漸降低(圖2H)。這一結果表明,UCP1在AKI中的表達可能影響脂質積累。

3)AKI中的脂質積累與UCP1高度負相關在確定了UCP1與AKI中的脂質積累負相關

后,我們試圖闡明其潛在的關系。首先,我們使用UCP1特異性過表達慢病毒載體和UCP1激動劑CL316243構建UCP1上調的細胞模型(圖3A)。如圖3B所示,UCP1過表達***降低了順鉑暴露HK2的脂質積累。 了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。天津課題國家自然科學基金

乳腺*(BrCa)是世界范圍內**常見的**,診斷為IV期患者的5年相對生存率有所下降。晚期BrCa被認為是不可***的,目前仍缺乏有效的***策略。識別和表征新的**抑制基因對于建立有效的晚期BrCa預后生物標志物或***靶點非常重要。2021年3月發表于Theranostics(IF=11.556)的文獻“Tumor suppressor DRD2 facilitates M1 macrophages and restricts NF-κB signaling to trigger pyroptosis in breast cancer”對此展開了研究。在本文中,在BrCa中,DRD2被發現由于啟動子甲基化而下調。DRD2的高表達與更長的生存時間正相關,尤其是在HER2陽性患者中。DRD2還能促進BrCa細胞對紫杉醇的敏感性。DRD2異位表達***抑制BrCa**發生。在體內和體外,DRD2也能誘導細胞凋亡和壞死。DRD2通過與β-arrestin2、DDX5和eEF1A2相互作用抑制NF-κB信號通路的***。有趣的是,DRD2還調節微環境,促進巨噬細胞M1極化,并觸發GSDME執行的焦亡。陜西課題詢問報價動物建模模型實驗的整體服務。

1肺腺*(LUAD)細胞及其細胞系中均可通過選擇性剪接產生mRNAPD-L1亞型LncRNAPD-L1為探索LUAD不同階段PD-L1蛋白的表達量異,對PD-L1蛋白陽性和陰性樣品均進行了mRNAPD-L1表達的檢測,結果在198bp和92bp處都擴增出了條帶。Sanger測序結果顯示,198bp條帶與PD-L1mRNA序列相匹配,而92bp處條帶為非編碼亞型PD-L1(PD-L1-Lnc)。為進一步證實,設計了探針對缺失片段進行檢測,在878bp和705bp處檢測出兩條條帶,878bp條帶與PD-L1mRNA序列相匹配,而705bp的條帶顯示與PD-L1mRNA相比,第4個外顯子中存在106nt的序列缺失,第5個和第6個外顯子之間存在67nt的缺失。通過BASESCOPE顯色實驗發現,在肺*組織中mRNAPD-L1(藍點)和LncRNAPD-L1(紅點)存在明顯的共表達接下來,作者設計了PD-L1mRNA和PD-L1-Lnc的特異性探針,對這些RN**段進行定量,通過PCR探針擴增并進行qRT-PCR檢測,檢測到PD-L1蛋白陽性和陰性樣品中在PD-L1mRNA和PD-L1-ln數量一致。

然后,我們在H460和H1299細胞中測量了USP35敲除和TKI之間的協同效應,數據表明USP35沉默在體內和體外使H460和H1299細胞對GFB化療敏感(圖9F-H)。值得注意的是,EGFR突變的肺*細胞對TKI更敏感,因此我們評估了USP35沉默是否會使H1650細胞對GFB化療敏感。如圖9I,J所示,USP35沉默進一步抑制了GFB***后H1650細胞的生長、集落形成和**進展。總的來說,USP35缺乏的肺*細胞對化療藥物更敏感。

結論:FPN蛋白穩定性和肺*細胞的鐵輸出需要USP35,從而保持細胞內鐵穩態和**生長。而USP35敲除通過減少游離鐵輸出增加細胞內LIP水平和鐵死亡,并伴隨著肺*細胞生長、定殖和**形成的減少,以及對DDP和PTX化學敏感性的增加。因此USP35是一個很有前途的肺****靶點。 解決了對確定因果調節機制網絡的方法的關鍵需求。

相反,miR-199a-5p抑制劑處理可提高WT小鼠脾CD4+ T細胞中Sirt1的表達(圖5E),并降低衰老標志物p21, p16和乙酰p53水平(圖5F)。***,與MRL/lpr相比,hUC-MSCs可增加miR-199a-5p的產生,表明hUC-MSCs是miR-199a-5p來源的關鍵調控因子 (圖5G)。在transwell系統中,hUC-MSCs與MRL/lpr脾CD4+ T細胞共培養48 h后,細胞內miR-199a-5p升高,Sirt1基因表達降低,CD4+ T細胞中衰老標志物的表達水平恢復,而miR-199a-5p抑制劑處理后仍處于抑制狀態(圖5G-I)。總的來說,這些數據表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p介導的Sirt1下調和隨后p53去乙酰化的減少,增加了脾臟CD4+ T細胞的衰老。高通量測序后續的機制實驗。天津課題國家自然科學基金

Pex調節HSC的ECM分泌。天津課題國家自然科學基金

二、改進標簽轉移和差異分析

研究了方法差異對下游生物學分析的影響

A.B.去除中性粒細胞**提高了在細胞核和細胞的均勻流形近似和投影(UMAP)投影中分離各種細胞類型的能力.

C使用這些工具,中性粒細胞的去除提高了標記轉移評分,與核基方法相比,滲透性細胞產生了更多具有高標記轉移評分的細胞.

D所有方法產生的CD16+單核細胞均少于流式細胞術觀察到的CD16+單核細胞,這表明無論是使用核或通透細胞的scATAC-seq過程中,CD16+單核細胞可能丟失,或者標簽轉移方法不利于識別這種細胞類型. 天津課題國家自然科學基金

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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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