褪黑素可減少TBI誘發的小鼠腦行為缺陷和病變體積
為了利用褪黑素對TBI誘導的神經系統結果和病變體積的影響，進行了行為分析以及HE染色。關于線握測試，與假手術組相比，TBI在第1-8天導致運動表現顯著下降，但與TBI組相比，褪黑素和Lip-1的***改善了第2-6天的運動表現。在MWM測試中觀察到，與假手術組相比，TBI在第10-15天導致潛伏期延長，但是褪黑素和Lip-1***的TBI小鼠均表現出比TBI小鼠明顯更短的逃避潛伏期。曠場試驗中，與假手術組相比，TBI組的動物的總距離、中心移動距離和花費時間明顯縮短。褪黑素***可顯著逆轉上述參。HE染色顯示，褪黑素和Lip-1***的TBI組在TBI后第16天的病變體積明顯小于TBI組。兩者合計，結果提供了褪黑素***小鼠中TBI后改善運動，記憶和焦慮結局以及病變體積的證據。 TIMEOR用于推斷基因調控事件之間的關系。帕金森小鼠模型課題整包服務
急性胰腺炎(AP)是**常見的炎癥性胃腸道疾病之一，在小鼠和人類模型中似乎通過外分泌腺泡細胞的再生而恢復。巨噬細胞是由組織損傷引發的炎癥和組織再生反應的重要驅動因素，包括***、自身免疫性疾病、機械或毒性損傷以及其他原因。在組織損傷時，骨髓(BM)衍生的巨噬細胞和/或組織駐留巨噬細胞被***并以促炎方式響應局部環境，然后迅速轉變為傷口修復表型。巨噬細胞的表型和作用已在急性和慢性胰腺炎中得到充分證明。然而，關于巨噬細胞如何調節損傷后的胰腺修復/再生，包括ADM和腺泡再分化，我們知之甚少。***講一篇關于巨噬細胞表型變化與AP炎癥相關的文章，該文章題名為：Macrophagephenotypicswitchorchestratestheinflammationandrepair/regenerationfollowingacutepancreatitisinjury，IF=5.737，一區雜志。帕金森小鼠模型課題整包服務致力于醫學相關領域的實驗技術服務和相關生物醫學課題的研究。
同時，CD8T細胞和M0巨噬細胞顯示出**強的競爭作用。對免疫浸潤細胞進行PCA分析，結果表明，免疫浸潤可以區分晚期斑塊和早期斑塊。4.GSEA分析將所有表達數據分為早期和晚期斑塊組，然后進行GSEA分析。結果顯示與免疫細胞和免疫相關功能高度相關5.差異表達分析使用R軟件limma包分析早起、晚期斑快差異基因（log2(foldchange)>1，adjustedpvalue<.05），pheatmap包進行結果喲可視化。6.差異基因GO、Pathway富集分析使用ClusterProfiler包對差異進進行GO、Pathway分析。使用ggplot2包進行結果可視化。
在所有**中具有比較高***性頻率的基因是蛋白質編碼基因BCL9L。BCL9L在10種**類型的**組織中***上調。其表達水平與m6A信號呈正相關（r=0.35）和m6A亞型在總人口中。在泛*薈萃分析（HR）中，BCL9L的高表達與總體生存率降低***相關。這一發現在6個外部驗證數據集中得到證實，包括肺*，胃*，乳腺*，肝*和卵巢*，乳腺*。BCL9L是Wnt信號通路的重要成員，與Wnt信號通路的ssGSEA富集分數***相關。在參與Wnt信號轉導的5個m6A互作基因（MYC、LEF1、WIF1、CTNNB1和SOX2）中，BCL9L與MYC有很強的相關性（r=0.34）和CTNNB1（r=0.36）。此外，我們驗證了外部數據集中的109個蛋白質編碼基因。在PFDR的meta分析中，40個基因（37.7%）與生存率相關<0.05，表明它們在**中起重要作用?？傊?，這項研究表明m6A調節因子和相互作用基因可能在**預后中起重要作用。我們對m6A模式的系統評價提高了對**微環境中RNA甲基化失調的理解。預測的相互作用靶基因可能為臨床***靶點提供更多的信息。醫學整體課題外包服務。
5）circPDE4B和RIC8A調控軟骨細胞中的p38信號通路
為了闡明RIC8A下游的信號通路，我們研究了RIC8A敲低的HCs中MAPKs、NF-κB和mTOR的磷酸化水平。兩種RIC8AshRNA***降低了p38的磷酸化水平(圖5A)。然后用信號分子抑制劑對HCs進行預處理，包括ERK1/2抑制劑、p38抑制劑和JNK抑制劑，然后是RIC8A過表達。經過p38MAPK抑制劑預處理的RIC8A過表達抑制了OA，然而，ERK或JNK抑制劑對其沒有影響(圖5B)。此外，***RIC8AshRNA或過表達腺病毒后，p38MAPK的磷酸化及其定位發生了異常調節(圖5C-E)。這些結果表明，RIC8A在軟骨細胞中通過p38信號通路發揮作用。接下來我們研究了circPDE4B在OA中調控p38信號通路中的作用。circPDE4B過表達降低，而circPDE4B敲低***p38MAPK信號，同時p38磷酸化和核轉位(圖5F-H)。然后我們進行了拯救試驗。如圖5I-K所示，RIC8A過表達挽救了過表達circPDE4B誘導的p38信號通路的下調，而抑制RIC8A挽救了敲除circPDE4B誘導的p38信號通路的***，以及p38的磷酸化和核易位。基于這些發現，circPDE4B-RIC8A軸在調節軟骨細胞下游p38MAPK信號通路中發揮重要作用。 高通量測序的后續成文服務。流式課題實驗檢測服務
公共比較毒理基因組學數據庫。帕金森小鼠模型課題整包服務
4.ELNAT1直接與hnRNPA1相互作用
由于lncRNA的分子功能與其亞細胞定位相關，通過FISH和亞細胞定位實驗發現ELNAT1在UM-UC-3和T24細胞的細胞質和細胞核均有表達（SupplementalFigure7A,B）。并且通過RNA-pulldown實驗，發現在分子量35~40kDa上有明顯的條帶（Figure4A）。對此，通過質譜（MS）和Westernblot分析顯示，hnRNPA1是**豐富的ELNAT1相互作用蛋白（Figure4B-D）。熒光染色和RNA免疫沉淀（RIP）證實了ELNAT1和hnRNPA1在UM-UC-3和T24細胞中的共定位，并且ELNAT1通過內源性hnRNPA1富集（Figure4E,F），進一步驗證了ELNAT1和hnRNPA1之間的相互作用。 帕金森小鼠模型課題整包服務
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1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗