細胞因子通過蛋白聚糖的 GAG 側鏈與**衍生的外泌體的外表面結合
為了評估細胞因子與**衍生的外泌體關聯背后的機制，評估了細胞因子是位于外泌體內還是與外泌體外膜結合。為了研究它們的亞外泌體定位，我們添加了重組人或小鼠 CCL2 和 IL-6，這兩種細胞因子都存在于血漿外泌體分離物和TIF中，用于兩種人和兩種鼠*細胞系衍生的外泌體。孵育后，通過重新純化外泌體去除未結合的細胞因子。我們確實觀察到兩種 CCL2 的濃度依賴性增加和 IL-6在這些環境中的外泌體分離物中。值得注意的是，CCL2 與鼠 PyMT 細胞衍生的外泌體的結合相對低于所有其他設置。進一步用蛋白酶 K 處理 CCL2 結合的 BC 外泌體，其濃度可導致外膜蛋白（如 CD9）降解，但不會降解囊泡內 HSP70，確認破壞***于外泌體表面。用蛋白酶 K 處理 BC 外泌體的表面表示大部分 CCL2 位于外泌體外膜上。 FMT處理加速SCI小鼠的胃腸道消化。成都MCD誘導標書
尿素循環中間體連接Tug1/PGC1α軸與線粒體重塑
已知細胞在響應外部代謝信號時表現出代謝重塑，其特征是通過在底物和/或代謝途徑之間的轉換來適應代謝需求的變化。為了進一步了解Tug1在關鍵代謝途徑中的作用，作者重新分析了他們之前釋放的足細胞無偏性比較轉錄組數據，該數據分為Tug1-knockdown(shTug1)和scrambleshorthairpinRNA(shRNA)control(shCtrl)兩組，該結果為糖酵解、三羧酸循環和氧化磷酸化(OXPHOS)中酶催化反應的一系列mRNA變化提供了一些早期線索。接下來，對全細胞和線粒體代謝物進行代謝組分析。在測定的糖酵解、TCA循環、氨基酸的中間體中，作者發現尿素循環（也被稱為精氨酸-瓜氨酸循環）的中間體在*****被改變的，在Tug1-KD和Tug1-KD/Pgc1-OE細胞中。Tug1-KD細胞中，與對照組比，尿素循環的兩種中間產物鳥氨酸和瓜氨酸是上調*****的代謝物，與Tug1-KD細胞比較，它們是Tug1-KD/Pgc1-OE足細胞中下調*****的代謝物，提示Tug1/PGC1α軸對這兩種關鍵代謝物具有調節作用。代謝產物富集分析也表明嘧啶代謝，尿素循環的下游副產物和精氨酸的生物合成是富集**多的途徑。 北京自噬標書FMT處理可恢復SCI小鼠中糞便短鏈脂肪酸(SCFAs)。
ITGB8-AS1是CRC生長和遷移所必須的
作者在HCT116和DLD-1細胞系中敲除ITGB8-AS1后，發現兩個細胞系的增殖和集落形成，以及細胞的遷移。在體內，敲除ITGB8-AS1后**的生長受到***抑制。此外，作者還構建了ITGB8-AS1過表達載體驗證ITGB8-AS1對**的影響，實驗證明ITGB8-AS1是CRC生長和遷移所必須的。
在CRC中ITGB8-AS1正調控Focal黏附信號通路
作者對ITGB8-AS1敲除的細胞和對照細胞進行轉錄組測序，挖掘差異表達基因，并對其進行KEGG分析，發現差異表達基因主要富集與Focal黏附信號通路。作者使用WB檢測了該通路中的幾個關鍵基因，發現敲除ITGB8-AS1后兩個細胞系中他們的表達或磷酸化都***下降。這些結果表明在CRC中ITGB8-AS1正調控Focal黏附信號通路。
結果1）circPDE4B在OA組織中表達較低
我們之前對3個臨床OA和3個對照樣本的軟骨細胞核糖體RNA缺失的總RNA進行了RNA-seq分析。在數量**多的50個***調控異常的circRNA中，circPDE4B的表達水平排名***。我們評估了每個病例的OA嚴重程度(圖1A)。同時，我們進行了組織形態學和熒光原位雜交實驗，結果顯示軟骨降解程度增加對應軟骨細胞中circPDE4B的表達降低(圖1B)。RT-qPCR檢測到嚴重OA組織軟骨細胞中circPDE4BRNA水平下調，而mPDE4BmRNA水平保持相對一致(圖1C)。綜上所述，circPDE4B的表達與OA的嚴重程度呈負相關。考慮到circPDE4B在人和小鼠之間是保守的，我們也檢測了circPDE4B在人/小鼠軟骨細胞中的表達，發現IL-1β和TNF-α處理***降低了HCs（人）/MCs（鼠）中circPDE4的表達，且呈時間依賴性(圖1D)。核分離實驗結合RT-qPCR分析和FISH分析發現，circPDE4B/circPde4b主要位于HCs/MCs的細胞質中(圖1E、F)。綜上所述，circPDE4B在OA中被下調，因此可能參與了OA的進展。 PCOS大鼠大部分血清代謝物的豐度與對照組大鼠完全不同.
為了闡明HuR是否影響LncRNA-HGBC在GBC細胞中的穩定性，通過兩次HuR敲除實驗均發現LncRNA-HGBC在NOZ細胞系中的表達量降低；為進一步探索 LncRNA-HGBC表達量的降低是不是由于 LncRNA-HGBC衰退所致，通過阻斷RNA的轉錄，觀察30h內 LncRNA-HGBC表達量的變化，隨著HuR的逐步消耗，LncRNA-HGBC水平的半衰期從18小時降低到5小時，這一系列實驗表明HuR與LncRNA HGBC相互作用并維持LncRNA HGBC穩定表達。
LncRNA-HGBC作為一種競爭性內源性RNA抑制miR-502-3p表達
前期的研究已經證實LncRNA-HGBC定位在細胞質上，作者初步假設LncRNA-HGBC可能作為miRNA海綿影響miRNA的表達，在GBC的進展中發揮作用。為了找出與LncRNA-miRNA相互作用的miRNA，作者將LncRNA-HGBC全長序列克隆到pmirGLO雙熒光素酶報告載體中，將6個與**抑制相關的候選miRNA通過雙熒光素酶實驗進行分析，發現其中的miR-502-3p和miR-618可抑制LncRNA-HGBC的熒光素酶活性，說明LncRNA-HGBC可能與miR-502-3p、miR-618相互作用。作者根據先前的miRNA微陣列結果發現，與鄰近的非**組織相比，在GBC組織中miR-502-3p表達量確實下調了。當LncRNA-HGBC中1176-1183nt之間的序列被敲除后將不能與miR-502-3p結合，熒光活性將不會再被抑制。 轉座酶染色質可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術。廣州褪黑素標書
SCI小鼠的握力在損傷后逐漸持續恢復。成都MCD誘導標書
在體外，上調UCP1減少AKI期間的脂質積累可通過AMPK/ULK1途徑促進自噬
自噬已被證實在AKI中發揮重要作用。因此，自噬已經成為我們關注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉染過表達UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細胞模型中，自噬相關指標顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示，上調UCP1消除AKI中的脂質積累后，細胞自噬得到促進(圖7C)。基于這些發現，為了驗證自噬在UCP1功能中的重要性，我們進行了功能恢復實驗。如圖7D-F所示，氯喹抑制自噬***逆轉了順鉑組UCP1引起的炎癥指標下降。同樣，TUNEL染色顯示，使用氯喹抑制自噬，可以明顯逆轉UCP1促進的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結果表明，脂質積累通過作用于AKI細胞自噬，在調節細胞功能方面發揮著重要作用。 成都MCD誘導標書
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關研究
4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗