接下來，在低氧條件下，在HCCLM3和Hep3B細(xì)胞中敲低CFL1的表達(dá)（圖5A）。結(jié)果表明，CFL1敲除***逆轉(zhuǎn)了缺氧誘導(dǎo)的HCCLM3細(xì)胞增殖、細(xì)胞遷移和侵襲以及EMT（圖5A-D）。綜上所述，這些結(jié)果表明CFL1表達(dá)受HIF-1α的轉(zhuǎn)錄調(diào)控，介導(dǎo)缺氧誘導(dǎo)的HCC進展。
6、CFL1通過抑制泛素介導(dǎo)的PLD1降解來維持PLD1的表達(dá)為了進一步探索CFL1在HCC中致*作用的下游機制，利用KEGG數(shù)據(jù)庫篩選了受CFL1影響的通路。其中CFL1的高表達(dá)與細(xì)胞膜中細(xì)胞粘附分子和蛋白的定位密切相關(guān)（圖6A）。然后，基于蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫預(yù)測了CFL1和PLD1之間的潛在相互作用（圖6B）。CFL1敲低降低了HCCLM3細(xì)胞中PLD1的蛋白水平，而CFL1過表達(dá)增強了Hep3B細(xì)胞中PLD1蛋白表達(dá)（圖6C）。co-IP實驗表明，CFL1與PLD1相互作用，敲低CFL1可促進肝*細(xì)胞中PLD1的泛素化(圖6D-E)。用放線菌酮(CHX，2μg/mL)阻斷肝*細(xì)胞蛋白質(zhì)合成。繪制蛋白降解曲線，表明CFL1敲低時PLD1蛋白降解更快（圖6F）。此外，蛋白酶體抑制劑MG132(25μM)處理可阻斷CFL1敲低誘導(dǎo)的HCC細(xì)胞中PLD1降解（圖6F）。因此，這些結(jié)果表明CFL1抑制肝*細(xì)胞中泛素介導(dǎo)的PLD1蛋白水解。 說明DHEA***對血清代謝有深遠(yuǎn)的影響.重慶神經(jīng)元損傷標(biāo)書
4）SsD通過直接抑制FTOm6A去甲基化活性來誘導(dǎo)m6A修飾
為了檢測m6A在RNA上的變化，我們在SsD處理的白血病細(xì)胞中進行了m6A點印跡實驗。如圖4A所示，SsD***增加了m6A在轉(zhuǎn)錄組中的豐度。此外，HPLC-MS/MS定量證實了SsD處理的NB4和Kas-1細(xì)胞mRNA中細(xì)胞m6A的增加(圖4B)。接下來，我們檢測了FTO的兩個直接靶點MYC和RARA在SsD處理的細(xì)胞中的表達(dá)。SsD在mRNA和蛋白水平***下調(diào)了NB4和Kas-1細(xì)胞的MYC，而上調(diào)了RARA(圖4C-D)。有趣的是，SsD依賴的MYC和RARA的減少是由于FTO過表達(dá)細(xì)胞中mRNA和蛋白穩(wěn)定性的降低(圖4E-4H)。綜上所述，這些結(jié)果證明了FTO及其下游靶點(如MYC,RARA)是FTO過表達(dá)白血病細(xì)胞中SsD的主要效應(yīng)因子。 項目標(biāo)書免費設(shè)計FMT***可能通過改變糞便短鏈脂肪酸介導(dǎo)宿主的病理生理變化。
CircRNF13直接結(jié)合SUMO2mRNA的3’UTR穩(wěn)定SUMO2
為了探究circRNF13調(diào)節(jié)GLUT1泛素化的機制，作者進行了LC-MS/MS，其中SUMO2引起了作者的注意。SUMO2類泛素化修飾（SUMOylation）是泛素化樣蛋白修飾成員可以調(diào)節(jié)蛋白降解通過泛素化途徑。并且研究表明SUMO2在NOC中是抑制糖酵解的。于是探究circRNF13與SUMO2的結(jié)合關(guān)系。與預(yù)期一致，過表達(dá)circRNF13會在mRNA和蛋白水平誘導(dǎo)SUMO2的表達(dá)上調(diào)，干擾circRNF13則效果相反。生信分析揭示circRNF13和SUMO2的非編碼區(qū)存在結(jié)合位點。RNApull-down顯示生物素標(biāo)記的circRNF13可以下拉SUMO2的mRNA在NPC細(xì)胞中。上熒光素酶實驗表明過表達(dá)circRNF13會提高SUMO2的熒光素酶活性。以上數(shù)據(jù)表明circRNF13通過與SUMO2結(jié)合調(diào)節(jié)其表達(dá)。
6）DRD2通過下調(diào)DDX5和eEF1A2來抑制NF-κB通路的***和**的發(fā)生DRD2異位表達(dá)***抑制了p65和NF-κB靶基因IL-10的mRNA表達(dá)(圖6A)，表明在沒有配體***的情況下，DRD2是NF-κB通路的負(fù)調(diào)控因子。除了結(jié)合***β-arrestin2外，DRD2還可能通過其他方式抑制NF-κB信號通路。采用Co-IP法分離可能的結(jié)合蛋白，并采用質(zhì)譜法進行蛋白鑒定。MDA-MB231和BT549細(xì)胞的所有結(jié)合蛋白中，DDX5、eEF1A2和ICAM-1均被異位表達(dá)的DRD2下調(diào)(圖6B-C)。根據(jù)以往的研究，DDX5和eEF1A2是幾種**中的兩種致*基因。WB也證實了DDX5和eEF1A2蛋白水平下調(diào)(圖6D)。在293T和MDA-MB231中，通過Co-IP和IB實驗證實了DRD2、DDX5和eEF1A2的結(jié)合(圖6E)，表明這三種蛋白形成了一個復(fù)合物。研究了所有三組循環(huán)代謝產(chǎn)物豐度與腸道微生物群之間的聯(lián)系.
系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)患者大多數(shù)存在I型IFN刺激基因(ISGs)的高表達(dá)。線粒體異常也有報道，但I型IFN暴露對這些變化的貢獻尚不清楚。此外，I型IFN通過上調(diào)脂肪酸氧化(FAO)和氧化磷酸化(OXPHOS)促進漿細(xì)胞樣樹突狀細(xì)胞（pDCs）的線粒體功能。本文數(shù)據(jù)表明，I型IFN暴露通過代謝重編程促進CD8 + T細(xì)胞死亡，有助于SLE發(fā)病。本文于2021年3月發(fā)表在《Nature Communications》IF:12.121。
1、ISGs高表達(dá)患者OXPHOS基因下調(diào)為了確定是否T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組特征可以幫助鑒定SLE患者的疾病活動，作者對來源于***和未***女性的CD8+T和CD4+T細(xì)胞的mRNA進行測序。對DEGs進行聚類熱圖分析，發(fā)現(xiàn)SLE患者根據(jù)ISG表達(dá)水平被分為***的兩類：SLE-1和SLE-2（Fig.1a,b）。在兩種T細(xì)胞中，SLE-2類群的患者具有更強烈的I型IFN特征。在CD4+T細(xì)胞中，這種特征伴隨著參與JAK-STAT信號和T細(xì)胞共刺激的基因，而在CD8+T細(xì)胞中，ISG基因的高表達(dá)與基因參與細(xì)胞周期，響應(yīng)DNA損傷和凋亡有關(guān)（Fig.1a,b）。比較SLE-1和SLE-2組的轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜，結(jié)果顯示，除ISGs外，mtDNA編碼的OXPHOS基因的表達(dá)差異比較大（Fig.1c,d）。 脊髓損傷（Spinal cord injury, SCI）患者表現(xiàn)出腸道菌群紊亂而腸道失調(diào)加重SCI模型中的神經(jīng)損傷。褪黑素標(biāo)書上海
circSDHC通過充當(dāng)miR-127-3p的海綿促進ccRCC的進展和轉(zhuǎn)移.重慶神經(jīng)元損傷標(biāo)書
5’-tRF-GlyGCC作為CRC患者的biomarker的診斷價值
為了檢測血漿5’-tRF-GlyGCC水平是否對CRC患者具有診斷價值，ROC曲線以確定臨界值。血漿5’-tRF-GlyGCC含量可以區(qū)分CRC患者和HC，曲線下面積(AUC)為0.882。5’-tRF-GlyGCC的比較好截斷值為1.9725(敏感性86%，特異性72%。結(jié)果表明，5’-tRF-GlyGCC的診斷價值遠(yuǎn)高于CEA(AUC0.762)和CA199(0.557)。此外，5’-tRF-GlyGCC、CEA和CA199組合的ROC曲線將AUC值提高到0.926。聯(lián)合的比較好臨界值為3.1273(敏感性86，特異性84%)。這說明血漿5’-tRF-GlyGCC水平對CRC患者具有良好的診斷能力。 重慶神經(jīng)元損傷標(biāo)書
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗