6）上調(diào)UCP1減輕AKI中的脂質(zhì)積累，可***緩解體內(nèi)炎癥和凋亡
以上研究證實，在體外，上調(diào)UCP1可以通過抑制炎癥和凋亡來抑制AKI的進展。為了探究其在體內(nèi)的作用，我們在腎多點注射模型中檢測了相應(yīng)的指標(biāo)。如圖6A-E所示，炎癥指標(biāo)CD68、IL-1β、IL-6、TNF-α均***降低，UCP1上調(diào)。在凋亡方面，凋亡指標(biāo)Bax和C-caspase3也隨著UCP1的上調(diào)而降低，而Bcl-2隨著UCP1的上調(diào)而升高(圖6F)。TUNEL熒光染色也直接證明了UCP1上調(diào)導(dǎo)致的凋亡減少(圖6G-H)。同樣，我們也使用UCP1激動劑CL316243在動物模型中證實了同樣的炎癥和凋亡趨勢(圖6I-P)。 課題外包服務(wù)找英拜放心安心。甘肅課題服務(wù)兩年
Nup62、Nup214、Nup43在運動神經(jīng)元中過表達***降低了運動功能和攀爬速度(圖5A和B)。與各自的Nup對照或?qū)φ战M動物相比，過表達Nup62和Nup214或Nup62和Nup43的動物的壽命明顯縮短——Nup62/ Nup214 OE和Nup62/Nup43 OE的中位存活時間分別為23天和21天(圖5C)。用RNAi成蟲(Nup62或Nup214)多次暴露于創(chuàng)傷后，檢測其運動功能和壽命。Nup62 mRNA (p <0.01)和Nup214 mRNA (p <0.001)與對照組相比，Nup62和Nup214 RNAi處理組的攀爬水平***降低(圖5D和E)。有趣的是，Nup62 RNAi和Nup214 RNAi處理組創(chuàng)傷后攀爬水平***提高(圖5E, )和速度(圖5F）。
六、核孔病理存在于重復(fù)性TBI患者腦組織中，并與TDP-43病理共同聚集
輕度和重度CTE的組織，但年齡不匹配的對照組顯示***和強烈的NUP62免疫反應(yīng)性(圖6A,B,C）。21例嚴重CTE患者腦組織的NUP62水平明顯高于對照組(圖6D)。輕度CTE病例中NUP62與pTDP-43的共聚集程度有限，而重度CTE病例中NUP62和pTDP-43陽性包體在額葉皮質(zhì)的共聚集(箭頭)更為明顯(圖6E)。 上海課題地區(qū)科學(xué)基金高通量測序的后續(xù)成文服務(wù)。
4）CircMAPK1編碼109個氨基酸的新蛋白MAPK1-109aa
根據(jù)在線數(shù)據(jù)庫circRNADb的預(yù)測結(jié)果，circMAPK1序列中包含一個開放閱讀框，起始密碼子為ATG，IRES位于274-327nt。這一觀察結(jié)果表明circMAPK1具有編碼109aa蛋白的潛能，本研究將其命名為MAPK1-109aa(圖4a)。為了驗證預(yù)測的IRES在circMAPK1中的活性，我們進行了雙熒光素酶檢測，結(jié)果顯示野生型IRES報告基因的熒光素酶活性明顯高于突變型IRES報告基因的熒光素酶活性(圖4b)。為了進一步證實MAPK1-109aa的存在，我們將circMAPK1IRES突變質(zhì)粒和circMAPK1過表達質(zhì)粒轉(zhuǎn)入HEK293T細胞。銀染色結(jié)果顯示，在分子量為13kDa時存在明顯的蛋白帶，與MAPK-109aa的預(yù)測大小一致。MS檢測到AMEIMLNSKLCL序列，與MAPK1-109aa含有特定C端序列LCL的氨基酸序列一致(圖4c)。為了檢測該多肽產(chǎn)物，我們使用了一種識別MAPK1中間部分的抗體(圖4d)。WesternBlot檢測40對胃*組織(圖4e)和細胞系(圖4f)中MAPK1-109aa和MAPK1的水平。
2）整合單核RNA和ATAC數(shù)據(jù)集，用于預(yù)測和驗證ATAC細胞類型分配
snATAC-seq捕獲單個細胞的染色質(zhì)可及性特征。相對而言，我們對細胞類型特異性染色質(zhì)可及性圖譜的了解較少;因此，我們利用注釋snRNA-seq數(shù)據(jù)集使用標(biāo)簽轉(zhuǎn)移來預(yù)測使用Seurat的snATAC-seq細胞類型。標(biāo)簽轉(zhuǎn)移是通過從snATAC-seq數(shù)據(jù)創(chuàng)建一個基因活性矩陣來進行的，這是一種衡量蛋白編碼基因的基因體和啟動子內(nèi)染色質(zhì)可及性的方法。在參考snRNA-seq數(shù)據(jù)集和查詢基因活性矩陣之間識別轉(zhuǎn)移錨點，然后分配預(yù)測的細胞類型。snATAC-seq預(yù)測分數(shù)的分布表明，絕大多數(shù)細胞具有較高的預(yù)測分數(shù)，并被自信地劃分為單細胞類型(補充圖2)。 促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。
越來越多的證據(jù)表明**相關(guān)巨噬細胞（TAMs）和外泌體在轉(zhuǎn)移前niche（生態(tài)位）形成中發(fā)揮重要作用。TAMs是轉(zhuǎn)移前生態(tài)位形成和結(jié)直腸*肝轉(zhuǎn)移(CRLM)的基礎(chǔ)。然而，**來源的外泌體miRNAs與TAMs相互作用的分子機制仍然很大程度上未知。本研究發(fā)現(xiàn)**來源外泌體miR-934可以誘導(dǎo)巨噬細胞M2極化，進而促進CRC的肝轉(zhuǎn)移。該文于2020年11月發(fā)表在《Journal of Hematology and Oncology》IF：11.059期刊上。
1、miR-934表達升高與CRLM進展及預(yù)后不良呈正相關(guān)
為了揭示參與CRLM的miRNA，作者基于TCGA數(shù)據(jù)庫比較了CRC的1期**和4期**的miRNA表達譜，發(fā)現(xiàn)miR-934是在4期**中高表達差異表達*****的miRNA（Fig.1a,b）。此外，作者將110個CRC組織按有無肝轉(zhuǎn)移分為兩組，發(fā)現(xiàn)肝轉(zhuǎn)移組與未轉(zhuǎn)移組相比，組織和血清miR-934表達上調(diào)（Fig.1c,d）。接下來，為了研究miR-934在CRLM進展中的作用，使用ISH比較了miR-934在包含308個CRC樣本的組織芯片(TMA)中的表達，與正常粘膜組織相比，CRC組織中miR-934的表達明顯上調(diào);miR-934表達增加與T分期、M分期、晚期AJCC分期和**復(fù)發(fā)呈正相關(guān)，尤其是在肝轉(zhuǎn)移的病例中（Fig.1e）。
按照實驗設(shè)計路線和實驗結(jié)果進行文章的構(gòu)思與潤色。安徽課題整體服務(wù)
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細胞間的相互作用在**進展和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關(guān)鍵作用。目前關(guān)于這些**細胞是如何與其他細胞相互交流的仍有很多是未知的。**釋放的外泌體被認為是**進行細胞間溝通的有效介質(zhì)。Dong等探索了肝細胞*（HCC）外泌體在其轉(zhuǎn)移和預(yù)后價值中的功能。本文于2021年6月發(fā)表在《Signal Transduction and Targeted Therapy》期刊上，IF：13.493。
1、外泌體的分離與鑒定以及HCC細胞的釋放和吸
收使用投射電子顯微鏡觀察了外泌體的形態(tài)和形狀；納米粒子**分析發(fā)現(xiàn)外泌體直徑在40-200nm之間，并且在6個HCC細胞系外泌體中都檢測到了外泌體標(biāo)志物CD63，CD9，和Alix的表達；然后使用DIO標(biāo)記高轉(zhuǎn)移性HCC細胞的外泌體（HMH-exo）和低轉(zhuǎn)移性HCC細胞外泌體（LMH-exo），在激光掃描共焦顯微鏡下觀察到綠色標(biāo)記的HMH-exo和LMH-exo都可以被低轉(zhuǎn)移性HCC細胞細胞系有效吸收（圖1）。這些結(jié)果表明已經(jīng)成功分離和純化HCC來源的外泌體并且他們可以被其它HCC細胞吸收。 甘肅課題服務(wù)兩年
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