為了確定s-flow和d-flow在體內單細胞分辨率下對ECs基因轉錄表達和染色質可及性譜的全基因組影響，我們使用小鼠PCL模型進行了scRNA-seq和scATAC-seq。將C57BL/6小鼠部分結扎，以暴露于血流的對側RCA作為對照，在LCA中誘導d-血流。部分結扎后2天(2D)和2周(2W)， rca (2D- r和2W- r)和lca (2D- l和2W- l)用膠原酶酶解獲得單個細胞和單個核，分別用于scRNA-seq和scATAC-seq。
在標準化之后，一個基于無監督圖的聚類將細胞劃分成組，通過統前列形近似和投影(UMAP)圖可視化(圖1A)。我們的UMAP分析確定了16個獨特的細胞簇以流和時間依賴的方式分布(圖1A和1B)。每個細胞簇都是用確定的標記基因進行鑒定(1C).發現8個EC簇(E1E8)、血管平滑肌細胞(SMCs)、成纖維細胞(Fibro)、4個單核/巨噬細胞(macrophages14)、樹突狀細胞(DCs)和T細胞。通過Pecam1、Icam2、Cdh5和Tie1的表達來鑒定EC簇。smc特異性標記為Cnn1、Myl9和Speg。同樣，Medag、Dpep1和Lum作為纖維的標記物;巨噬細胞C1qa,C1qb,C1qc,C5ar1;DCs的Ccr7和Mmp25;T細胞的Itk(圖1C)。
探討SCI腸道微生物失調與神經炎癥之間的分子相互作用。蛋白組學標書動物模型構建
8.EVs介導的ELNAT1上調HLECs中SOX18的表達
qRT-PCR分析UM-UC-3-EV1載體或UM-UC-3-EVELNAT1處理的HLECs中淋巴管生成相關基因的表達，結果顯示SRY-box轉錄因子18（SOX18）是**明顯的與EVs介導的ELNAT1表達正相關的基因（Figure8A,B）。此外，ChIRP分析表明EVs介導的ELNAT1與HLECs中SOX18啟動子的771~786bp（p4）直接相互作用（Figure8C,D）。SOX18-p4區域的突變降低了EVs介導的ELNAT1誘導的熒光素酶活性（Figure8E,F），表明SOX18-p4對于EVs介導的ELNAT1誘導HLECs中SOX18的上調至關重要。hnRNPA1和H3K4me3在SOX18啟動子上的富集與EVs介導的ELNAT1表達***相關（Figure8G,J）。EVs介導的ELNAT1過表達增強了HLECs的管形成和遷移能力，而干擾SOX18則HLECs的管形成和遷移能力受損（Figure8K,M），表明SOX18是EVs介導的ELNAT1驅動體外BCa淋巴管生成所必需的。綜上所述，這些結果表明，EVs介導的ELNAT1通過轉錄上調HLECs中SOX18的表達來促進BCa淋巴管生成。 湖北標書歡迎咨詢在786-O和A498細胞中CDKN3敲除后的western blot分析證實了這一關系.
5）USP35通過靶向FPN調節鐵下垂
我們接下來試圖闡明USP35對鐵死亡的可能機制。負責鐵輸入的蛋白質(Tf和TfR)沒有改變；然而，哺乳動物中關鍵的鐵轉運蛋白FPN在USP35缺乏的細胞中減少，而在過表達的細胞中增加(圖6A-C)。在USP35過表達的*細胞中，細胞膜中的FPN蛋白豐度增加，但由于USP35的敲除而降低(圖6D)。與分子變化一致，在USP35沉默或過表達的細胞中，胱氨酸攝取也不受影響(圖6E)。為了進一步證實FPN的參與，H460和H1299細胞分別預***shFPN以敲低內源性FPN表達。USP35過表達在鐵刺激時降低了肺*細胞內LIP和Fe2+，但在FPN缺陷細胞中未能做到這一點(圖6F)。
2）LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制增殖、遷移和侵襲
為了研究LINC00926在乳腺*細胞中的生物學功能，我們用LINC00926***細胞，對其進行細胞生長、遷移和侵襲分析。細胞增殖和集落形成實驗顯示，過表達LINC00926可降低MDA-MB-231和MCF-7細胞的增殖(圖2A和2B)。在LINC00926轉染的細胞系中，PGK1的表達可逆轉上述作用。過表達LINC00926也顯示出遷移和侵襲能力下降(圖2C和2D)。同樣，PGK1在LINC00926轉染的細胞中重新表達逆轉了這些作用。此外，敲除PGK1還可以抑制LINC00926調控乳腺*細胞增殖、遷移和侵襲的能力(圖2E-2H)，表示LINC00926通過抑制PGK1的表達來抑制乳腺*細胞的增殖、遷移和侵襲。 水蘇糖可減少卵巢囊泡數量黃體形成.
公共比較毒理基因組學數據庫（CTD，/)是一個創新的數字生態系統，它將化學品、基因、表型、疾病和暴露的毒理學信息聯系起來，以促進對人類健康的了解。整合了基于文獻、人工策劃的交互，以創建一個知識庫，協調跨物種異質數據的化學暴露及其生物影響。在這兩年一次的更新中，報告CTD的含量增加了20%，現在提供了4500萬個毒性基因組關系，涉及600個比較物種的16300多種化學品、51300個基因、5500種表型、7200種疾病和163000次暴露事件。此外，通過CTD疾病頁面上的新數據選項卡（幫助填補環境健康方面的知識空白）和新的表型搜索參數（用于批量查詢和維恩分析工具），增加了化學表型內容的功能。此外，還介紹了新的CTD解剖學頁面，允許用戶從解剖學角度獨特地探索和分析化學-表型相互作用。***，用新的基于文獻的化學同義詞增強了CTD化學頁面（以改進查詢），并添加了1600個基于氨基酸的化合物（以增加化學景觀）?？傊@些更新繼續增強CTD作為一個強大的資源，以產生關于環境影響疾病的病因和分子機制的可測試的假設。 水蘇糖確實改善了PCOS大鼠卵巢功能障礙改善了卵巢組織病理損傷。蛋白組學標書動物模型構建
促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。蛋白組學標書動物模型構建
生物標志物是生物體中可測量的物質或特征，它指示某些現象，例如狀況，疾病，飲食，干預措施或環境暴露。在這方面，生物標記物可分為三種類型：（i）分子（化學物質，蛋白質或基因），（ii）細胞（細胞類型，細胞形態，組織組織學）或（iii）成像（X射線，CT） ，PET或MRI功能）。生物標記物類型的選擇在很大程度上取決于所研究的現象和所研究的生物系統。在醫學中，生物標志物的主要目的是診斷，預后或預測疾病。它們還可以用于評估藥物，***，污染物，食物或其他攝入物質的暴露。蛋白組學標書動物模型構建
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗