MAD2和p31conmet調節SAC的持續時間,反過來,也調節有絲分裂的持續時間。這促使我們研究RIT1是否通過與MAD2和p31conmet的直接關聯來影響SAC。通過RNAi或crispr介導的敲除去除RIT1可延長有絲分裂進程(圖3A和S3A S3E)。此外,SAC的藥理抑制挽救了RIT1耗盡的作用,表明RIT1以SAC依賴的方式影響有絲分裂。此外,RIT1的缺失增加了染色體分離錯誤的發生率(圖3B),這表明RIT1不僅對有絲分裂的及時進展至關重要,而且RIT1蛋白水平的失調也破壞了正常的SAC功能。LZTR1或RIT1M90I表達的缺失加速了異步生長細胞的有絲分裂進程,這一效應依賴于PM釋放RIT1(圖3C、S3H和S3I)。同樣,RIT1 WT或M90I的過表達部分覆蓋了藥物誘導的SAC反應(圖3D和S3J)。RIT1M90I的異位表達以依賴MAD2-和p31come結合的方式***增加了有絲分裂錯誤的發生率,包括滯后染色體和橋接染色體(圖3G和S3O)。因此,我們觀察到在表達RIT1M90I的細胞中非整倍體率增加,但在表達不能結合MAD2/p31conmet的突變體的細胞中卻沒有(圖3H和S3P)。這些結果表明,RIT1水平的增加會導致與MAD2和p31conmet的直接相互作用,從而降低有絲分裂的保真度。zVAD預處理也略微增加了IR后PTEN-398A細胞中未解決的DNA損傷灶的數量。調控因子
3.IRES序列
由于circRNA是共價閉環分子,沒有游離末端,因此circRNA的翻譯必須使用一種非經典的啟動機制,即不依賴5’-帽子的翻譯啟動。這種起始途徑往往通過IRES(內部核糖體進入位點)驅動,IRES是具有特殊二級結構的短RN**段。在病毒中發現并證明了大量的IRES元件,在一些特殊情況下,哺乳動物內源性的IRES元件也可以起始翻譯。作者團隊也曾針對circRNA中IRES元件進行了系統性的篩選驗證。數據庫也使用了所有可用的IRES信息作為支持circRNA翻譯的證據。 蛋白質我們接下來研究了Pex對HSCs生物學行為的影響。
然后使用單細胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細胞的轉錄譜(Fig. 4G)。使用pseudobulk RNA-seq分析和預轉移體外培養的基因比較,生成了持續細胞的基因標記,其標志是記憶相關基因(Sell,Foxp1,Tcf7,Cd7,Il7r,Klf2,Ccl5)的高表達和效應相關基因(Gzmd,Ifng,Prf1,Gzma,Gzmb)的低表達(Fig. 4H-I)。對先前的體外單細胞數據(Fig. 2H-J)的進一步分析顯示,CDK4/6i處理后,具有這種持續性特征的細胞頻率從7.5%增加至26.8%(Fig. 4J-K)。這些數據表明,抑制CDK4/6促進T細胞向真實的記憶表型分化,其特征是功能的長期持久性。
隨后,作者研究了YTHDC2是否通過SLC7A11抑制胱氨酸攝取。當YTHDC2在H1299細胞中過表達時,并過表達SLC7A11完全恢復了受損的胱氨酸攝取(圖4E-G)。ATF4是SLC7A11轉錄的關鍵轉錄因子,ATF4在H1299細胞中上調SLC7A11(圖4H、I)。過表達YTHDC2仍然拮抗ATF4的作用(圖4H-J)。因此,YTHDC2損害依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取。結合臨床分析,YTHDC2表達下調,而SLC7A11表達上調(圖4K、L),并且它們在**中呈負相關(圖4M)。
5.YTHDC2以m6A依賴的方式使SLC7A11mRNA不穩定
作者為研究YTHDC2是否在轉錄被阻斷后調控SLC7A11mRNA的穩定性,通過泛轉錄抑制劑ActD處理H1299和H1975細胞,發現YTH結構域對于YTHDC2縮短H1299細胞中SLC7A11mRNA的半衰期至關重要(圖5A)。在H1975細胞中,CRISPR/Cas9技術使YTHDC2功能喪失,然后YTHDC2重構,進一步證實YTHDC2加速了SLC7A11mRNA的衰變(圖5B)。EXOSC10是一種外切酶,負責3’-5’外切酶活性。EXOSC10的缺失,減弱了YTHDC2縮短SLC7A11mRNA半衰期的作用(圖5C、D)。在藥理學水平上,用兩種泛-RNase抑制劑DEPC和RNasin***H1299細胞,也阻斷了YTHDC2的功能(圖5D)。 促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。
4、外泌體miR-138-5p通過抑制KDM6B表達調節巨噬細胞極化
隨后,作者研究了在不同培養條件下TPH-1的表達譜。首先,和**細胞共培養抑制了M1相關基因的表達,IL-6,TNF-α,和IL-1β,但是增加了M2相關基因的表達CD163,Arg-1,IL-10,TGF-β和VEGFA。過表達KDM6B部分抑制了上述表現改變(圖4A-B)。流式檢測顯示乳腺*細胞和TPH-1的共培養增加了CD163陽性細胞數比例,但是過表達KDM6N可以抑制這種效果(圖6C)。類似的,過表達KDM6B抑制了miR-138-5p誘導的M2極化(圖4D-F)。與對照組相比,乳腺*來源的外泌體miR-138-5p降低了M1相關表型,相反,M2標志物增加并伴隨著CD163陽性細胞數的增加(圖6G-I)。用從乳腺*細胞中分離出來的外泌體處理THP-1細胞導致了M2極化,抑制miR-138-5p的表達可挽救這種極化(圖4J-L)。總之,這些結果表明外泌體miR-138-5p通過抑制KDM6B表達調節巨噬細胞極化。 Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。更年期綜合癥(MS)
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點擊該基因的名稱,將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻中的更多詳細信息。***,在“詳細信息”部分中總結了有關疾病,細胞類型和基因的詳細信息。SC2disease還提供了從基于單細胞的結果和基于GWAS的結果得出的疾病的易感基因。所有GWAS數據均從GWAS目錄獲得。以2型糖尿病為例,將通過單擊“可視化”顯示由scRNA-seq和GWAS檢測到的易感基因列表。此外,可通過單擊“可視化”以可視方式顯示結果。在所得圖中,x軸是從GWAS結果獲得的基因中SNP的**小P值。y軸是從scRNA-seq結果獲得的疾病的重疊敏感性基因的細胞類型。條的顏色顯示基因表達的log 2倍變化。調控因子
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