分子生物學課題CRO

來源: 發布時間:2021-10-16

**調節因子通常作為蛋白質復合物中的亞基存在,并以多種方式參與轉錄調控,例如通過調節組蛋白修飾和染色質結構。哺乳動物BRG1-或brm相關的染色質重塑復合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細胞染色質可及性景觀。該復合物是細胞周期和增殖的關鍵調控因子,也是前列腺*的驅動因子,具有多種**特異性作用。此外,頻繁發生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復合物重新靶向于染色質,促進前列腺*的發生。互斥的ATPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復雜功能的關鍵組件。此外,AR與DNA序列特異性轉錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經建立。TF FOXA1可以結合到封閉的染色質區域,調節其染色質可及性,從而促進AR結合染色質引發PCa。使用motif和CHIP-seq預測影響基因簇表達的轉錄因子。分子生物學課題CRO

一、Pten398A加速MMTVneu驅動的乳腺**發生

為了研究ATM磷酸化PTEN的體內功能,我們在小鼠中設計了一個敲入等位基因,其中398位絲氨酸取代了丙氨酸(Pten398A)。Pten398A/+和Pten398A/398A小鼠存活,發育明顯正常。為了研究atm依賴的PTEN磷酸化在乳腺*中的可能作用,我們在小鼠乳腺**病毒(MMTV)啟動子/增強子轉錄控制下表達滅活neu (Erbb2)融合基因的小鼠背景下培養了Pten398A等位基因。在這個成熟的模型中,MMTVneu基因在正常乳腺上皮中低水平表達,導致乳腺**的發展,據報道中位發生率為205天。Pten+/+;MMTVneu小鼠發生了預期潛伏期的乳腺**,顯示了233天的中位生存期(圖1A)。相比之下,Pten398A/398A;MMTVneu小鼠**發展加快,中位生存期縮短至199天(圖1A)。對Pten+/+;MMTVneu和Pten398A/398A;MMTVneu小鼠的石蠟包埋**標本進行免疫組化檢測γH2AX。 TRF課題課題設計英拜生物致力于分子生物行業十余年。

巨噬細胞的差異***與**進展密切相關,而表觀遺傳因子賴氨酸去甲基化酶6B (KDM6B,先前命名為JMJD3)通過一種未知的機制調節巨噬細胞的極化。本文探討了該調解機制及其功能,并于2021年5月發表在《Theranostics》IF:8.579期刊上。

1、巨噬細胞KDM6B的表達被miR-138-5p抑制

根據文獻報道KDM6B是巨噬細胞的***的關鍵分子,因此,作者首先檢測了乳腺*細胞系MB-MDA-231對巨噬細胞系TPH-1中KDM6B表達的影響,結果表明乳腺*細胞及其條件培養基都可***下調KDM6B的表達,表明存在一種乳腺*細胞來源的分泌因子產生此種影響。因此,通過生物信息學預測了KDM6B結合的miRNA,以及結合文獻,通過在乳腺*中上調的,同時符合條件的有3個。隨后將乳腺*細胞和巨噬細胞共培養,檢測三個miRNA的表達,如圖1B所示,只有miR-138-5p和miR-146a的表達在共培養后***上調。進一步檢測發現,只有miR-138-5p處理后KDM6B的表達***下降而非miR-146a(圖1C-D)。生信分析預測了miR-138-5p和KDM6B的結合位點,并進行了熒光素酶實驗檢測,證實了兩者間存在結合關系

但tbi暴露后,Ran***1染色分布異常,細胞核和細胞質強度高(圖2E)。與對照組相比,腦外傷后Ran***1分布異常的細胞百分比明顯增高(圖2F)。反復的創傷損傷會干擾Ran***1在大腦中的定位。TBI大鼠損傷皮質(同側半球)下海馬區域的腦細胞表現出錯誤定位和/或聚集(箭頭)或強烈的Ran***1核染色(箭頭),而假手術對照組主要是光滑的核周染色(圖2H)。與假對照相比,創傷性腦損傷大鼠的NUP62顯示了明顯的胞質(箭頭)和核(箭頭)錯位,假對照顯示了很少的胞質(而沒有核)錯位(圖2J)。創傷性腦損傷腦組織中NUP62病理細胞的百分比明顯高于假手術對照組(圖2K).致力于醫學相關領域的實驗技術服務和相關生物醫學課題的研究。

一、腦損傷改變了果蠅的大腦蛋白質組,擾亂了NCT蛋白和Nup蛋白水平

為了研究創傷性腦損傷的機制,我們使用了一個具有良好特征的創傷性腦損傷果蠅模型,該模型顯示了強大的表型,如TDP-43同源物(Tbph)、p62、應激顆粒和泛素病理,以識別和研究創傷性腦損傷后大腦蛋白質組的變化(圖1A)。對暴露于重復TBI的三齡果蠅幼蟲大腦中的2000個蛋白質進行了無偏性蛋白質組學分析(w1118),發現361個蛋白質在創傷損傷后發生了***變化(p 0.05,學生t檢驗)。基于基因本體論(GO)的復雜網絡分析在BiNGO (Cytoscape 3)中對tbi相關腦蛋白質組與非tbi對照進行了關聯分析,確定了不同類別的改變蛋白,其中大多數上調(圖1B和C;圖1圖補充1A-E;補充文件1和3)。TBI后上調的比較高類別是微管細胞骨架、蛋白質折疊和蛋白酶體。此外,我們還鑒定了涉及**白復合體和剪接體的蛋白質。核孔復合體(NPC)和NCT通路的組成部分是tbi后上調的主要蛋白子集(圖1圖補充1F)。 醫學整體課題外包服務。SNP檢測課題分子生物學

英拜生物對實驗可行性分析。分子生物學課題CRO

二、腸道微生物群落動態變化

確定每個個體部位12個**豐富的科。HSCT后,在腸內第II期Lachnospiraceae的豐度減少,從檢查前的13%減少到第1周的4.7%,然后在第III期開始的第3個月恢復到27.5%(圖2A)。同時,腸球菌科在II期的擴張(檢查前:6.1%;第1周:22.8%)和第二階段的乳酸菌科(預檢:2%;第3個月后,第三階段分別減少到0.2%和0.6%(圖2A)。LDA在腸道中顯示了19個支系(共102個ASVs),這些支系在時間點上對樣品的分離效果比較好(圖2B)。兩個相當有鑒別能力且LDA系數為正的進化支系包括腸球菌科(Enterococcaceae)和乳酸桿菌科(Lactobacillaceae)的ASVs(圖2B)。從第3個月開始,它們的豐度再次下降到與預處理時間相當的水平(圖2C)。其中,ASV 78的數量**多,觀察頻率比較高(圖2D),其16S rRNA部分基因序列與wexlerae序列相似性較高。另一項PCA分析也支持這些發現(圖2E)。腸球菌科(Enterococcaceae)在II期樣品中更為豐富,Lachnospiraceae和Ruminococcaceae在I期和III期樣品中更為豐富(圖2E)。 分子生物學課題CRO

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