TRIM25的RNA結合活性對于其對底物的泛素連接酶活性是必需的。構建了一個帶有FLAG標記RNA結合域(RBD)缺失突變體。TRIM25ΔRBD不影響IGF2BPs的蛋白質水平,對IGF2BPs的泛素化水平沒有明顯影響,表明TRIM25完整的RBD對于IGF2BPs的有效泛素化和降解是必要的。這些結果表明,TRIM25通過泛素-蛋白酶體途徑促進NSCLC細胞中IGF2BPs的降解,并且TRIM25的RNA結合活性對其在底物泛素化中的作用至關重要。
已經顯示,TRIM25使用RNA作為其靶標有效泛素化的支架。然后,探討了TRIM25對IGF2BPs的泛素連接酶活性是否取決于circNDUFB2的存在。 circNDUFB2的丟失顯示了TRIM25對IGF2BPs泛素化和降解的顯著減弱作用。進一步驗證實驗數據并檢查circNDUFB2是否充當支架來增強TRIM25與IGF2BP的結合,進行了Co-IP分析。在帶有circNDUFB2但沒有circNDUFB2-MUT過表達的A549細胞中,TRIM25和IGF2BP之間的關聯得到增強。由于circNDUFB2對RNA核酸外切酶的抗性,使用RNase A***會嚴重破壞相互作用。此外,在METTL3 / 14敲低后,IGF2BP的泛素化作用顯著降低。結果表明,circNDUFB2充當支架,以增強TRIM25和IGF2BPs之間的相互作用,隨后促進TRIM25介導的IGF2BPs泛素化和降解。 Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。snoRNA課題課題設計
USF2促進circACTN4在BC中的表達為了研究 circRNA 在 BC發展中的功能,利用芯片分析檢測了4對BC組織和*旁組織中circRNA表達特征。共發現85個***差異表達的circRNAs, 63 個上調和22個下調circRNAs。熱圖顯示了14個上調的circRNA,其中circACTN4是失調**嚴重的一個,差異高達10倍。根據circBase數據庫發現circACTN4來自位于人類19號染色體上的ACTN4基因,產生于ACTN4外顯子2至外顯子7(共571bp),通過 Sanger 測序驗證了反向剪接連接點。為了驗證circACTN4的環形結構,使用聚斂引物和發散引物擴增環狀 circACTN4 和線性 ACTN4。通過FISH和核質分離PCR觀察到circACTN4主要位于BC細胞的細胞核中, circACTN4在*組織中的表達高于*旁組織。電鏡課題分子生物學按照實驗設計路線和實驗結果進行文章的構思與潤色。
實驗課題整體外包服務簡介:英拜生物一直致力于醫學相關領域的實驗技術服務和相關生物醫學課題的研究。為了廣大醫學領域的研究學者能夠在繁忙的工作與研究中的提供科學有理的科研設計咨詢及輔助實施,相關文獻查閱、實驗可行性分析、實驗流程設計、課題項目申請、整體實驗實施、數據分析與處理、論文潤色。服務內容:1,了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量2根客戶的研究方向,查閱相關文獻3.設計實驗路線:根據客戶的要求和提供的樣本類型、樣本量設計實驗4.實驗操作:按照實驗方案實施實驗5.整理實驗結果:完成實驗,對實驗結果進行整理6.數據統計與分析處理:對實驗結果進行生物學分析7.論文:按照實驗設計路線和實驗結果進行文章的構思與潤色。
三、在體內,tbi介導的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制
為了確定TBI是否會損害體內的核質運輸,我們在果蠅運動神經元中過表達了一個帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達nlsnes -GFP的大腦中,GFP信號分布在細胞核和細胞質中(圖3A)。然而,定量分析顯示,在nls - nes -GFP表達的vnc暴露于TBI中,核GFP信號減少的細胞百分比***增加,而核GFP強度***降低(圖3B和C),說明GFP核進口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來,我們在運動神經元中表達了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標記的沒有核輸出活性的GFP蛋白。表達NLS的非創傷性腦損傷動物的腦細胞-ΔNES-GFP顯示了GFP在細胞核的強大定位(圖3A),而創傷性腦損傷動物的vnc顯示了核GFP減少的細胞數量***增加,核GFP強度降低((圖3B和C)。果蠅幼蟲暴露于TBI,并在DMSO單獨、KPT-350(0.05、0.1或0.5 mM)或KPT-276(50、200或1000 nM)上飼養。對經歷過TBI的果蠅幼蟲的羽化試驗顯示,KPT-350處理的動物(圖3D)或KPT-276處理的動物(圖3E)具有***的劑量依賴性的致死抑制。kpt -350處理的果蠅核GFP信號***高于dmso處理的對照組(圖3G)。 公共比較毒理基因組學數據庫。
在基礎條件下,Fth -KO小鼠皮層中鐵穩態輕度受損
使用蛋白質印跡分析,實時PCR和Fth免疫熒光證實了在基礎條件下神經元Fth表達的喪失。Fth- KO小鼠的FTH mRNA和蛋白表達較低。我們還通過免疫熒光觀察了Fth的神經元水平。從他莫昔芬處理的皮層神經元Fth- KO小鼠具有減少的免疫原性FTH的。重要的是,在神經元中觀察到幾乎罕見FTH陽性細胞Fth- KO小鼠。有趣的是,神經元中Fth的喪失并未導致Ftl表達的代償性增加。接下來,檢查了神經元Fth在鐵代謝和氧化還原穩態中的假定作用。Fth-KO組與對照組相比,皮質Fe2 +,Fe3+,總鐵水平***增加。Perls的藍色染色顯示在生理條件下,在Fth- KO中觀察到的鐵陽性細胞相對較少。這些結果表明,Fth- KO小鼠具有活力和繁殖力,但鐵代謝發生了改變,這提供了神經元鐵蛋白的鐵存儲功能在維持皮質鐵穩態基礎條件中起重要作用的證據。 外泌體CD44v6和C1QBP可能是預測PDAC患者預后的有前途的生物標志物。凋亡 課題實驗檢測服務
ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布。snoRNA課題課題設計
為了進一步探索Pex調控HSC行為的機制,我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測序基因表達譜(圖3A)。在差異表達基因中,我們觀察到41個重疊的上調基因在Pan02exo組與Npex組和KPCexo組與Npex組之間存在部分交集(圖3B)。主要涉及的基因參與細胞外空間、細胞外區域和ECM(圖3C),表明Pex調節HSC的ECM分泌。此外,GO和KEGG通路分析顯示,IGF-1及其下游PI3K/AKT是受Pex影響的排名比較高的信號通路(圖3D,E)。westernblot分析支持了Pex***增加HSC中IGF-1R、IRS-1和AKT磷酸化的發現(圖3F)。當使用IGF-1R抑制劑時,Pex誘導的p-IGF-1R、p-IRS-1和p-AKT的上調被阻斷(圖3G)。基于這些結果,我們推測IGF-1信號可能是介導Pex依賴的HSC活化的關鍵因素。與預期的一樣,IGF-1R抑制劑***了Pex誘導的HSC的活化、增殖和遷移(圖4A-D)。此外,IGF-1R抑制劑逆轉了Pex誘導的HSC中ECM的產生(圖4E)。我們的體內實驗表明,IGF-1R抑制劑可以阻斷Pex誘導的肝纖維化(圖4F-I)。這些數據表明IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。snoRNA課題課題設計
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗