在所有**中具有比較高***性頻率的基因是蛋白質編碼基因BCL9L。BCL9L在10種**類型的**組織中***上調。其表達水平與m6A信號呈正相關(r=0.35)和m6A亞型在總人口中。在泛*薈萃分析(HR)中,BCL9L的高表達與總體生存率降低***相關。這一發現在6個外部驗證數據集中得到證實,包括肺*,胃*,乳腺*,肝*和卵巢*,乳腺*。BCL9L是Wnt信號通路的重要成員,與Wnt信號通路的ssGSEA富集分數***相關。在參與Wnt信號轉導的5個m6A互作基因(MYC、LEF1、WIF1、CTNNB1和SOX2)中,BCL9L與MYC有很強的相關性(r=0.34)和CTNNB1(r=0.36)。此外,我們驗證了外部數據集中的109個蛋白質編碼基因。在PFDR的meta分析中,40個基因(37.7%)與生存率相關<0.05,表明它們在**中起重要作用。總之,這項研究表明m6A調節因子和相互作用基因可能在**預后中起重要作用。我們對m6A模式的系統評價提高了對**微環境中RNA甲基化失調的理解。預測的相互作用靶基因可能為臨床***靶點提供更多的信息。大量數據支持腸道微生物組在SCI中發揮重要作用。常規標書服務價格
1、在響應CDK4/6抑制中瘤內記憶類CD8+T細胞的表現
為了***評價CDK4/6抑制對抗**T細胞免疫的影響,使用多模式單細胞測序(CITE-seq)分析了CDK4/6抑制劑palbociclib或對照處理的MC38-OVA**小鼠的瘤內T細胞群體(Fig.1A)。維度分析顯示MC38-OVA**中有10個不同的T細胞群(Fig.1B)。用CDK4/6i處理的**有較低頻率的CD4+調節性T細胞(Foxp3+Tregs),而CD8+記憶類T細胞頻率更高,以Tcf7、Sell、Bcl2和Cd7高表達為特征(Fig.1B-D)。CD8+T細胞池的基因動態表達揭示來源于CDK4/6i處理的小鼠的CD8+**免疫浸潤(TILs)向更早、更像干細胞的分化狀態傾斜(Fig.1E-F)。與此一致,較早出現假時間軌跡的細胞表達更高水平的記憶相關基因(Tcf7,Sell,Il7r),和更低水平的效應相關基因(Prf1,Gzmb)和耗損標志物(PD-1,TIM3)(Fig.1G)。 醫學相關標書中標率高miR-127-3p是一種*****因子可下調CDKN3/E2F1軸的活性。
遷移體(migrasome)是清華大學生命科學院俞立團隊新發現的胞外分泌囊泡,該研究成果已于2015年發表在Cell Research期刊(IF=20.509)[1]。遷移體是在遷移細胞后部回縮纖維的前列或交叉處生長的大囊泡,直徑約為0.5μm到3μm,并且包含許多較小的囊泡(**多300余個,**少不足10個),掃描電子顯微鏡觀察下呈石榴狀結構。細胞遷移后,回縮纖維**終斷裂,遷移體分離。遷移體及其內容物,包括細胞溶質成分和來源不明的囊泡,被釋放到細胞外空間——這一過程稱為遷移。俞立團隊推測遷移體可能在細胞間通訊中發揮重要作用。
2017年俞立團隊進一步研究發現,整合素與 ECM 蛋白的配對結合決定了遷移體的形成[2],該研究成果也發表在Cell Research期刊。2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法[3]。2019年,俞立團隊發現Tspan4和膽固醇在遷移體形成時組織成為微米級大型微結構域,這一結構即遷移體的基本結構,還證實遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結構的剛度增加而產生的一種生物物理過程[4],該研究成果發表于Nature Cell Biology期刊中(IF=20.041)。
細胞周期蛋白依賴性激酶4和6(CDK4/6)的藥理學抑制劑是***受體陽性乳腺*的獲批***藥物,目前正在其他**類型的數百項臨床試驗中進行評價。這些抑制劑的臨床成功在很大程度上歸因于定義明確的**內在細胞抑制機制,而其作為免疫調節劑的新作用知之甚少。本研究利用整合的表觀基因組、轉錄組學和蛋白質組學分析,證明了CDK4/6抑制劑在促進免疫T細胞記憶的表型和功能獲得中的新作用。本文的機制見解拓寬了CDK4/6抑制劑作為增強抗**T細胞免疫的臨床工具的前瞻性效用。本研究于2021年5月14日發表在《Cancer Discovery》IF:29.497期刊上。FMT處理導致緊密連接蛋白表達上調并促進SCI后的腸道屏障完整性的維持。
7、CFL1/PLD1軸介導低氧誘導的HCC細胞中AKT途徑的***之前的一項研究表明,PLD1***AKT及其下游mTOR通路促進HCC細胞增殖、侵襲。與此一致,作者觀察到CFL1敲除降低了p-AKT水平,在HCCLM3細胞中通過PLD1恢復增強了p-AKT水平(圖7A,C)。此外,PLD1沉默逆轉了CFL1誘導的Hep3B細胞中AKT信號轉導通路的活化(圖7B,D)。值得注意的是,CFL1或PLD1敲除抑制了肝*細胞中缺氧誘導的AKT通路***和EMT過程(圖7E,F)。之后,進行拯救實驗探討HIF-1α-CFL1-PLD1軸中PLD1的功能。在HCCLM3細胞中過表達的PLD1可以逆轉低氧條件下CFL1-shRNA引起的對AKT磷酸化或EMT過程的抑制(圖7G,H)。總的來說,證實CFL1/PLD1軸在缺氧誘導的HCC進展中起重要作用。
總之,該研究表明HCC中過表達CFL1與較差的臨床病理學參數呈正相關。體外和體內實驗證實CFL1是HCC**生長和轉移的驅動因素。PDL1/AKT通路介導CFL1的致*功能。此外,CFL1是一個缺氧反應基因,通過***PLD1/AKT信號轉導參與缺氧誘導的HCC進展(圖8)。綜上所述,該研究表明CFL1是低氧微環境與HCC進展之間的一種新的連接體。 為了確定水蘇糖是否參與了Tempol對PCOS大鼠的有益作用.創傷性腦損傷標書地區科學基金
GO和KEGG分析顯示circNDUFB2觸發免疫防御和I型干擾素(IFNs)信號。常規標書服務價格
6、MiR-199a-5p改善MRL/lpr小鼠疾病
接下來,在體內評估了miR-199a-5p對MRL/lpr小鼠的影響。17周齡MRL/lpr小鼠每4天注射20nmolmiR-199a-5pagomir或對照(agomirnc),共4周(圖6A)。末次注射后48h處死小鼠,分離脾臟CD4+T細胞。與對照組相比,miR-199a-5pagomir處理組顯示miR-199a-5p水平升高(圖6B),Sirt1表達降低(圖6C),衰老標志物p21和p16的表達***上調(圖6D)。這些數據表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p增加MRL/lpr脾CD4+T細胞衰老。
接下來,研究系統給予miR-199a-5p agomir是否能挽救MRL/lpr小鼠的狼瘡表型。與agomir nc組相比,miR-199a-5p agomir處理組脾臟和淋巴結明顯縮小(圖7A-B),血清中anti-dsDNA抗體、IgG水平下降(圖7D-E)。血清ANA水平有下降趨勢(圖7C)。miR-199a-5p agomir處理組的腎損傷,表現為尿蛋白下降(圖7F),腎小球增大和細胞增生減少(圖7G),外周***袢中IgG沉積減少(圖7h)。綜上所述,這些數據表明hUC-MSCs移植通過miR -199a-5p介導的Sirt1信號下調從而增加脾CD4+ T細胞的衰老,改善MRL/lpr小鼠的疾病表型。 常規標書服務價格
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1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗