自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進(jìn)行運(yùn)輸、溶解。研究表明，自噬異常會(huì)影響疾病進(jìn)程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發(fā)生會(huì)增強(qiáng)*細(xì)胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會(huì)造成“廢物”的積累、基因突變等，誘發(fā)**。本研究旨在探索人類(lèi)**中是否有某些突變通過(guò)影響LIR基序來(lái)改變自噬選擇性，進(jìn)而影響疾病進(jìn)程。
1.構(gòu)建LIR預(yù)測(cè)模型pLAM
收集人、釀酒酵母、其他物種LIR，并獲取相應(yīng)蛋白,確定了LIR的序列信息。
驗(yàn)證算法的可靠性，然后用于泛*LIR基序預(yù)測(cè)，并對(duì)預(yù)測(cè)到的LIR基序?qū)?yīng)的基因進(jìn)行GO、Pathway富集分析。
2.LIR基序突變預(yù)測(cè)
收集TCGA、ICGC和COSMIC數(shù)據(jù)庫(kù)突變數(shù)據(jù)并進(jìn)行整合，獲得2,963,952個(gè)獨(dú)特的SNV。提取其中LIR基序的突變信息。分析發(fā)現(xiàn)STBD1蛋白，參與糖原代謝，在之前尚未報(bào)道過(guò)與**自噬有關(guān)。
3.分析突變的LIR基序（LAMs）在泛*中的作用
使用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn)，STDB1在泛*中為抑制**；在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中為促進(jìn)**。
FMT處理可能促進(jìn)了創(chuàng)傷性脊髓損傷后神經(jīng)元的存活和軸突再生。常規(guī)標(biāo)書(shū)技術(shù)指導(dǎo)
對(duì)離體培養(yǎng)的Maoa野生型和KO BMMDs中ROS水平的測(cè)定也顯示，在IL-4/IL-13刺激或不刺激下，Maoa KO BMMDs中ROS水平降低，與體內(nèi)TAM結(jié)果一致（圖4d）。向IL-4/ IL-13刺激的Maoa WT和KO BMDMs補(bǔ)充H2O2可將其細(xì)胞內(nèi)ROS水平提高到相似水平，并消除它們?cè)诿庖咭种茦?biāo)記物和特征基因表達(dá)的差異（圖4e-g）。另一方面，補(bǔ)充酪氨酸(MAO-A的底物)可增加ROS水平，并上調(diào)免疫抑制基因在Maoa WT BMDMs中的表達(dá)，但在Maoa KO BMDMs中不上調(diào)（圖4h-j）。綜上所述，這些數(shù)據(jù)表明MAO-A通過(guò)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞內(nèi)ROS水平來(lái)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞的免疫抑制極化。代謝標(biāo)書(shū)免費(fèi)設(shè)計(jì)水蘇糖確實(shí)改善了PCOS大鼠卵巢功能障礙改善了卵巢組織病理?yè)p傷。
為理解TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的機(jī)制作用，從4T1-P、TYRO3-OE、4T1-R和TYRO3–/–細(xì)胞中提取RNA進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組分析。2種耐藥細(xì)胞系Tyro3-OE和4T1-R之間的轉(zhuǎn)錄組學(xué)變化高度相似，變化的重疊百分比較高，表明Tyro3在促進(jìn)**細(xì)胞對(duì)抗PD-1/PD-L1***耐藥中的作用。來(lái)自TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的黑色素瘤患者TYRO3基因的通路分析也顯示TYRO3表達(dá)與PD-1/PD-L1**免疫***通路呈正相關(guān)，與T細(xì)胞介導(dǎo)的抗**反應(yīng)相關(guān)通路（CTL介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡和死亡受體信號(hào)），炎癥反應(yīng)相關(guān)通路（Th1活化、Th2活化、NF-κB信號(hào)）呈負(fù)相關(guān)。HMGB1是一種損傷相關(guān)分子模式分子，由嗜鐵細(xì)胞釋放，我們發(fā)現(xiàn)HMGB1信號(hào)與TYRO3表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。以上表明，TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的作用，并表明TYRO3有利于***TME。
核型生物標(biāo)志物
MarkerDB共有154個(gè)核型標(biāo)記或核型圖，與47種不同的疾病/狀況相關(guān)。MarkerDB中的所有核型生物標(biāo)記物數(shù)據(jù)都是從原始文獻(xiàn)中提取的，包括**學(xué)和血液學(xué)中的遺傳學(xué)和細(xì)胞遺傳學(xué)圖譜，以及人類(lèi)不平衡染色體畸變目錄。目前，MarkerDB中的所有核型標(biāo)記都有一個(gè)或多個(gè)疾病xiang關(guān)聯(lián)，以及MarkerDB ID、標(biāo)記的獨(dú)特圖譜或核型圖（顯示與疾病核型相鄰的正常核型）、核型的簡(jiǎn)短描述、疾病關(guān)聯(lián)、一個(gè)或多個(gè)相關(guān)基因的文獻(xiàn)參考和超鏈接。 單細(xì)胞核測(cè)序能夠獲得組織的細(xì)胞圖譜.
**調(diào)節(jié)因子通常作為蛋白質(zhì)復(fù)合物中的亞基存在，并以多種方式參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控，例如通過(guò)調(diào)節(jié)組蛋白修飾和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。哺乳動(dòng)物BRG1-或brm相關(guān)的染色質(zhì)重塑復(fù)合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細(xì)胞染色質(zhì)可及性景觀。該復(fù)合物是細(xì)胞周期和增殖的關(guān)鍵調(diào)控因子，也是前列腺*的驅(qū)動(dòng)因子，具有多種**特異性作用。此外，頻繁發(fā)生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復(fù)合物重新靶向于染色質(zhì)，促進(jìn)前列腺*的發(fā)生。互斥的ATPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復(fù)雜功能的關(guān)鍵組件。此外，AR與DNA序列特異性轉(zhuǎn)錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經(jīng)建立。TF FOXA1可以結(jié)合到封閉的染色質(zhì)區(qū)域，調(diào)節(jié)其染色質(zhì)可及性，從而促進(jìn)AR結(jié)合染色質(zhì)引發(fā)PCa。環(huán)狀RNA（circRNA）是一類(lèi)共價(jià)閉合的單鏈RNA.內(nèi)分泌標(biāo)書(shū)實(shí)驗(yàn)外包
FMT處理可恢復(fù)SCI小鼠中糞便短鏈脂肪酸(SCFAs)。常規(guī)標(biāo)書(shū)技術(shù)指導(dǎo)
LINC00926通過(guò)***乳腺*細(xì)胞中PGK1的表達(dá)來(lái)***增殖、遷移和侵襲為了研究LINC00926在乳腺*細(xì)胞中的生物學(xué)功能，我們用LINC00926***細(xì)胞，對(duì)其進(jìn)行細(xì)胞生長(zhǎng)、遷移和侵襲分析。細(xì)胞增殖和集落形成實(shí)驗(yàn)顯示，過(guò)表達(dá)LINC00926可降低MDA-MB-231和MCF-7細(xì)胞的增殖(圖2A和2B)。在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系中，PGK1的表達(dá)可逆轉(zhuǎn)上述作用。過(guò)表達(dá)LINC00926也顯示出遷移和侵襲能力下降(圖2C和2D)。同樣，PGK1在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中重新表達(dá)逆轉(zhuǎn)了這些作用。此外，敲除PGK1還可以***LINC00926調(diào)控乳腺*細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的能力(圖2E-2H)，表示LINC00926通過(guò)***PGK1的表達(dá)來(lái)***乳腺*細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲常規(guī)標(biāo)書(shū)技術(shù)指導(dǎo)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專(zhuān)題，外泌體研究專(zhuān)題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
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3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)