越來越多的證據(jù)表明細(xì)胞外囊泡(EVs)通過促進實體**中**-內(nèi)皮細(xì)胞之間的通訊來刺激血管生成。先前的研究表明miR-144是鼻咽*(NPC)細(xì)胞來源的EVs中的內(nèi)含物之一,但EVs miR-144對**內(nèi)皮細(xì)胞和血管生成的影響尚不清楚。2021年3月發(fā)表于“Molecular Therapy”(IF=11.454)的文章“miR-144 delivered by nasopharyngeal carcinoma-derived EVs stimulates angiogenesis through the FBXW7/HIF-1a/VEGF-A axis”對此展開了研究。本研究旨在探討**源性細(xì)胞外囊泡(EVs)在鼻咽*血管生成中的作用。我們初步采集鼻咽*活檢標(biāo)本。研究了所有三組循環(huán)代謝產(chǎn)物豐度與腸道微生物群之間的聯(lián)系.醫(yī)學(xué)科研標(biāo)書售后服務(wù)
CircACTN4 直接與 FUBP1 相互作用并*** MYC 的轉(zhuǎn)錄
為了探索circACTN4的分子機制,首先進行了pull down和質(zhì)譜分析circACTN4結(jié)合蛋白,發(fā)現(xiàn)FUBP1在circACTN4上顯著富集。RIP 檢測進一步證實 FUBP1 可以通過qRT-PCR與BC細(xì)胞中的內(nèi)源性circACTN4 特異性結(jié)合。FISH-IF 分析顯示 circACTN4和FUBP1共定位于細(xì)胞核中。但是circACTN4 的上調(diào)和敲低并沒有改變 FUBP1的表達(dá)水平,表明circACTN4不參與FUBP1的翻譯后調(diào)控。ChIP-PCR測定證實FUBP1與BC細(xì)胞中MYC啟動子結(jié)合。構(gòu)建了 FUBP1 和 FIR 過表達(dá)和敲低質(zhì)粒。通過qRT-PCR和蛋白質(zhì)印跡確定轉(zhuǎn)染效率。qRT-PCR和WB的結(jié)果表明,F(xiàn)UBP1的上調(diào)或下調(diào)分別顯著增加或降低了BC細(xì)胞中MYC的表達(dá)水平。此外, qRT-PCR發(fā)現(xiàn)FUBP1在BC組織中的表達(dá)明顯高于鄰近正常組織中的表達(dá)。 醫(yī)學(xué)科研標(biāo)書售后服務(wù)FMT處理加速SCI小鼠的胃腸道消化。
我們接下來試圖識別circPDE4B上游調(diào)節(jié)器。我們首先對circPDE4B側(cè)翼序列進行RNA pull-down-MS檢測,發(fā)現(xiàn)兩個與RNA剪接相關(guān)的RBP,包括DExH-box helicase 9和FUS(圖1G)。RT-qPCR結(jié)果顯示,F(xiàn)US敲除后,HCs中circPDE4B表達(dá)下調(diào),而pPDE4B和mPDE4B沒有明顯變化(圖1H)。此外,***兩種FUS shRNA慢病毒只降低了circPDE4B的表達(dá)(圖1I),而過表達(dá)FUS則上調(diào)了circPDE4B的表達(dá)(圖1I)。接下來,RIP分析顯示FUS與外顯子相鄰的位點結(jié)合,而其他遠(yuǎn)端位點則可以忽略(圖1J,K)。我們還尋找了可能的FUS響應(yīng)元素,發(fā)現(xiàn)了兩個可能的motifs,A位于上游,B位于下游。我們進一步設(shè)計了兩個短的circPDE4B微基因,包括circPDE4B-s和circPDE4B-s-del(圖1L)。RIP顯示FUS與circPDE4B-s之間存在明顯的相互作用,但與circPDE4B-s-del之間沒有相互作用(圖1M),表明FUS需要周圍內(nèi)含子中的假定位點來結(jié)合。我們接下來在表達(dá)circPDE4B-s/del的HCs中敲除FUS,發(fā)現(xiàn)與circPDE4B-del相比,circPDE4B-s***減少了FUS敲除的circPDE4B轉(zhuǎn)錄本(圖1N)。值得注意的是,在HCs中FUS被TNF-α下調(diào)(圖1O)。綜上所述,在OA中circPDE4B的下調(diào)至少部分是由FUS的抑制引起的。
IL-3/IL-4能誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化,預(yù)先用50ng /mL IL-3/IL-4處理THP-1細(xì)胞3天,驗證anti-miR-934對M2巨噬細(xì)胞極化的影響。結(jié)果顯示PTEN過表達(dá)部分減弱了miR-934和HCT-8細(xì)胞來源外泌體對M2標(biāo)記物(CD206, arginase-1和IL10)表達(dá)的增強作用,而PTEN的沉默則相應(yīng)地逆轉(zhuǎn)了anti-miR-934對M2標(biāo)記物表達(dá)的衰減效應(yīng)(Fig. 5g, i)。流式細(xì)胞術(shù)檢測M2巨噬細(xì)胞標(biāo)志物CD163在PMA處理的THP-1細(xì)胞中的表達(dá),結(jié)果與上述結(jié)果一致(Fig. 5j)。總之,研究結(jié)果表明,miR-934增強了CRC細(xì)胞來源的外泌體對M2巨噬細(xì)胞極化誘導(dǎo)的增強作用,而anti-miR-934減弱了其增強作用。FMT處理***增加了SCI小鼠腸道菌群的豐富度。
與SMARCA4類似,SMARCC1[15](在ChIP-SICAP中發(fā)現(xiàn))顯示與C1和C2位點相結(jié)合(圖2g)。
重點分析了ARBs染色質(zhì)可及性的變化,發(fā)現(xiàn)雄***通常增加了ARBs的可及性(圖3a, ATAC, siCTRL)。盡管SBs和ARBs之間有很大的重疊,但SMARCA4刪除*減少了2149個ARBs的染色質(zhì)可及性。這些sismarca4受影響的位點中有一半是開放的,不管***暴露與否(pre-accessible),其余的在***暴露后顯示其可及性增加(de novo位點,圖3a和c)。被AR招募的SMARCA4增加染色質(zhì)可及性,潛在地協(xié)助其他因素招募到這些位點(圖3d,補充表2)。由于雄***誘導(dǎo)了FOXA1在sismarca4影響位點的結(jié)合(圖3e), AR誘導(dǎo)的SMARCA4的招募可能有助于雄***誘導(dǎo)FOXA1的結(jié)合。上述結(jié)果表明SMARCA4在CRPC細(xì)胞染色質(zhì)景觀的調(diào)節(jié)中既有AR依賴的作用,也有非ARr**的作用。 免疫組織學(xué)染色顯示TNFαIL-1β和NF- κ b陽性染色主要分布在結(jié)腸黏膜層。cancer標(biāo)書動物模型構(gòu)建
circRNAs在**的發(fā)展和進展中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用.醫(yī)學(xué)科研標(biāo)書售后服務(wù)
1)Pex誘導(dǎo)肝纖維化微環(huán)境,促進PDAC肝轉(zhuǎn)移
從小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細(xì)胞分離的外泌體呈現(xiàn)典型的外泌體結(jié)構(gòu),大小約為50-150nm(圖1A,B)。進一步的westernblot分析證實了分離的外泌體的存在(圖1C)。為了確定Pex在PDAC肝轉(zhuǎn)移中的作用,我們首先進行了“教育”程序,并進一步通過脾內(nèi)注射建立了PDAC肝轉(zhuǎn)移模型(圖1D)。在“教育”過程后,STE和原子力顯微鏡(AFM)顯示,與Npex組相比,Pex組小鼠的肝臟剛度***增加(圖1E,F(xiàn))。此外,肝組織膠原密度增加(圖1G),肝ECM明顯重構(gòu)(圖1H,I)。同樣,PDAC原位植入模型也顯示原位**可增加肝臟膠原沉積。肝轉(zhuǎn)移模型顯示,與Npex組相比,Pex組肝轉(zhuǎn)移更多,肝質(zhì)量更高(圖1J)。這些數(shù)據(jù)表明,Pex可以通過重構(gòu)肝臟ECM來誘導(dǎo)肝纖維化微環(huán)境,促進PDAC肝轉(zhuǎn)移。 醫(yī)學(xué)科研標(biāo)書售后服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗