5）SsD可***抑制AML在體內的進展
為了研究SsD在體內對白血病的***效果，我們建立了C1498和FLT3+白血病小鼠模型(圖5A)。對照組小鼠的白細胞生長較快。0.1mg/kg或0.5mg/kg劑量的SsD***抑制WBC生長(圖5B)。與對WBC的抑制作用一致，SsD也有效地損害了骨髓(BM)克隆原性潛能(圖5C和5D)。此外，與對照組相比，接受SsD***組的小鼠的脾臟更輕，表明SsD處理***逆轉了脾腫大，抑制了脾臟轉移性**細胞(圖5C和5E)。與病理表型一致，SsD處理小鼠的生存時間也明顯延長(圖5F)。機制上，SsD在體內的抗白血病作用是通過其m6ARNA甲基化活性介導的(圖5G)；因為SsD處理小鼠的BM增加了m6ARNA甲基化，從而調節靶基因(圖5H)。 我們接下來研究了Pex對HSCs生物學行為的影響。TBI課題
circACTN4 在 BC 組織和細胞中高度表達并與臨床病理特征相關
為探討circACTN4的表達及其臨床意義，qRT-PCR檢測80對BC組織及鄰近非**組織中circACTN4的表達。circACTN4在BC組織中的表達顯著高于配對的*旁組織。qRT-PCR檢測20對BC和*旁組織中線性ACTN4的表達，數據顯示線性ACTN4在BC組織中高表達。Pearson相關分析顯示circACTN4的水平與BC組織中線性ACTN4的表達呈正相關。結果表明 circACTN4 和 ACTN4 的共過表達協同促進了乳腺*的進展。RO曲線分析，circACTN4的AUC（曲線下面積）為0.719，診斷特異性和敏感性分別為70%和70。circACTN4 在 BC 細胞中的表達顯著高于正常乳腺上皮細胞 MCF-10A。 TBI課題Pex調節HSC的ECM分泌。
為了確定ATM介導的PTEN磷酸化如何調節DDR，構建Pten398A/398A和Pten+/+ littermates MEFs細胞模型。PTEN蛋白水平不受398A突變的影響(補充圖3A, B)。此外，磷酸化AKT (PI3K通路活性的標記物)水平在Pten398A/398A和PTEN +/+ MEFs中相似(補充圖3B)。構建人乳腺上皮細胞系(MCF10A)，穩定表達野生型PTEN (PTEN- wt)，或PTEN的突變形式，不能被ATM磷酸化(PTEN- 398a)。在這些細胞中，內源性的PTEN基因被CRISPR/Cas9編輯刪除，創建了PTEN空細胞，然后用野生型或突變型的蛋白質穩定轉導重組。在表達PTEN- wt和PTEN- 398a的MCF10A細胞中，PTEN蛋白和磷酸化AKT水平相似(補充圖3A)，使這些細胞成為ATM磷酸化PTEN分子作用研究的合適替代模型。
在第7天，腺泡的大小沒有明顯變化(圖2k)。第14天，Myc-INPP4BWT而不是MycINPP4BC842A表達MCF-10A的細胞形成了更大的腺泡(1.8倍)，每個腺泡的細胞數量比載體對照增加了1.4倍(圖2ln)。過表達INPP4B促進MCF-10A細胞增殖，但不影響細胞的尖基底極性和細胞凋亡。與此一致的是，過表達Myc-INPP4BWT而不是Myc-INPP4BC842A在血清剝奪后的單層培養中增強了MCF-10A細胞的增殖(1.7倍)(圖2o,p)。
總之，這一數據與INPP4B以PI(3,4)P2-磷酸酶依賴的方式促進pik3a突變體ER+乳腺*和pik3a野生型乳腺上皮細胞增殖的解釋相一致。 TIMEOR是***個基于 Web 的自適應時間序列多組學管道方法。
4、外泌體miR-138-5p通過抑制KDM6B表達調節巨噬細胞極化
隨后，作者研究了在不同培養條件下TPH-1的表達譜。首先，和**細胞共培養抑制了M1相關基因的表達，IL-6，TNF-α，和IL-1β，但是增加了M2相關基因的表達CD163，Arg-1，IL-10,TGF-β和VEGFA。過表達KDM6B部分抑制了上述表現改變（圖4A-B）。流式檢測顯示乳腺*細胞和TPH-1的共培養增加了CD163陽性細胞數比例，但是過表達KDM6N可以抑制這種效果（圖6C）。類似的，過表達KDM6B抑制了miR-138-5p誘導的M2極化（圖4D-F）。與對照組相比，乳腺*來源的外泌體miR-138-5p降低了M1相關表型，相反，M2標志物增加并伴隨著CD163陽性細胞數的增加（圖6G-I）。用從乳腺*細胞中分離出來的外泌體處理THP-1細胞導致了M2極化，抑制miR-138-5p的表達可挽救這種極化（圖4J-L）。總之，這些結果表明外泌體miR-138-5p通過抑制KDM6B表達調節巨噬細胞極化。 提供分子生物以及到后續動物建模的一整套服務。外泌體課題分子生物學
IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。TBI課題
3）CircMAPK1在體內抑制胃*的發生和轉移
為了進一步證實體外研究結果，我們在體內驗證了circMAPK1在影響致瘤性方面的生物學作用。circMAPK1的沉默可***促進**的生長。相比之下，過表達circMAPK1***抑制了皮下**的生長(圖3a)。接下來，我們通過對增殖細胞標記物Ki67的染色來監測異種移植瘤的增殖。穩定敲除circMAPK1的**組織表現出更強的Ki67染色，而過表達circMAPK1的**組織表現出更弱的Ki67染色(圖3b和c)。為了研究circMAPK1在體內的轉移潛能，我們用熒光素酶質粒穩定地轉染上述細胞系，然后注射到裸鼠的尾靜脈中。結果顯示，circMAPK1的敲低有效地增加了肺轉移病灶的數量和大小。相比之下，生物發光成像(圖3d和e)和H&E染色(圖3f和g)顯示，過表達circMAPK1減少了肺轉移病變。 TBI課題
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7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗